More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3702 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3702  hypothetical protein  100 
 
 		 449 aa  910    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.962253  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  31.2 
 
 		 467 aa  232  9e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0943  ABC transporter component-like protein  33.55 
 
 		 452 aa  224  3e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000599069  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3172  hypothetical protein  34.83 
 
 		 471 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.534068  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0490  protein of unknown function DUF214  35.4 
 
 		 443 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  31.69 
 
 		 457 aa  204  3e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0890  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  27.49 
 
 		 502 aa  155  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  28.85 
 
 		 419 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  26.75 
 
 		 431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  26.71 
 
 		 397 aa  126  9e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2606  hypothetical protein  27.45 
 
 		 420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000189226  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  22.75 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  24.95 
 
 		 397 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  25.71 
 
 		 397 aa  113  9e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  27.95 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  25.7 
 
 		 404 aa  110  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  26.52 
 
 		 414 aa  110  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  26.52 
 
 		 397 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  24.3 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  25.83 
 
 		 641 aa  107  4e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  23.87 
 
 		 397 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  25.5 
 
 		 399 aa  104  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  25.9 
 
 		 391 aa  103  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  22.27 
 
 		 658 aa  100  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  22.99 
 
 		 406 aa  100  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  22.15 
 
 		 653 aa  99.4  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  23.89 
 
 		 401 aa  99.4  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  24.3 
 
 		 397 aa  99.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  24.41 
 
 		 662 aa  99  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  24.25 
 
 		 411 aa  98.6  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  23.28 
 
 		 397 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  24.51 
 
 		 400 aa  97.8  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  23.92 
 
 		 402 aa  97.1  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  24.95 
 
 		 408 aa  97.1  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  25.66 
 
 		 398 aa  96.3  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  23.84 
 
 		 394 aa  96.3  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  23.71 
 
 		 406 aa  95.9  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  25.11 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  23.06 
 
 		 397 aa  96.3  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  25.11 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0585  hypothetical protein  25.43 
 
 		 402 aa  95.1  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000219996  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  22.46 
 
 		 393 aa  95.1  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  24.4 
 
 		 391 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  24.14 
 
 		 397 aa  94.4  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  23.19 
 
 		 644 aa  94  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  23.97 
 
 		 391 aa  94  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  23.97 
 
 		 391 aa  94  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  23.97 
 
 		 391 aa  94  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  23.13 
 
 		 405 aa  93.6  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  23.97 
 
 		 391 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  23.35 
 
 		 399 aa  93.2  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.71 
 
 		 413 aa  93.2  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  23.5 
 
 		 403 aa  93.2  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  22.89 
 
 		 656 aa  92.4  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  23.58 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  25.39 
 
 		 381 aa  92  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  22.44 
 
 		 643 aa  92  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  36.2 
 
 		 443 aa  92.4  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  30.73 
 
 		 395 aa  92.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  23.39 
 
 		 406 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  25.16 
 
 		 395 aa  90.9  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1615  protein of unknown function DUF214  24.73 
 
 		 430 aa  90.5  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  23.21 
 
 		 402 aa  90.5  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  26.7 
 
 		 394 aa  90.1  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.33 
 
 		 664 aa  90.1  7e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  24.17 
 
 		 383 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  23.95 
 
 		 383 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  24.29 
 
 		 401 aa  89.7  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2385  protein of unknown function DUF214  29.53 
 
 		 466 aa  89.7  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  23.23 
 
 		 409 aa  89.7  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25 
 
 		 419 aa  89.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  22.36 
 
 		 402 aa  88.6  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  25.59 
 
 		 651 aa  88.6  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3479  protein of unknown function DUF214  21.15 
 
 		 399 aa  88.2  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  23.53 
 
 		 404 aa  87.8  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  23.59 
 
 		 409 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  23.5 
 
 		 409 aa  88.2  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  23.11 
 
 		 696 aa  87.4  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  23.59 
 
 		 409 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  34.36 
 
 		 414 aa  87.8  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  22.76 
 
 		 401 aa  87  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  24.62 
 
 		 400 aa  87  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  34.44 
 
 		 642 aa  87  6e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  24.84 
 
 		 410 aa  87  6e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  23.09 
 
 		 391 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  23.38 
 
 		 409 aa  86.7  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  25.11 
 
 		 387 aa  86.3  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  25.06 
 
 		 383 aa  86.7  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  22.78 
 
 		 394 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  30.81 
 
 		 452 aa  85.9  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  22.63 
 
 		 414 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  23.28 
 
 		 427 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  24.89 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  23.01 
 
 		 657 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02835  hypothetical protein  24.36 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  24.12 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04780  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  24.62 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1575  protein of unknown function DUF214  30.89 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000796219  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  33.97 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>