More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0953 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  100 
 
 
402 aa  782    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  56.64 
 
 
402 aa  436  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3478  protein of unknown function DUF214  56.72 
 
 
402 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  52.37 
 
 
404 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  38.96 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3479  protein of unknown function DUF214  38.81 
 
 
399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3708  ABC transporter permease protein  38.35 
 
 
399 aa  237  3e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0954  hypothetical protein  34.58 
 
 
399 aa  215  9e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  36.43 
 
 
409 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  37.77 
 
 
411 aa  210  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  34.48 
 
 
409 aa  209  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  35.94 
 
 
409 aa  208  2e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  32.93 
 
 
410 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  32.93 
 
 
410 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  34.86 
 
 
409 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  33.08 
 
 
398 aa  203  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  33.65 
 
 
405 aa  201  3e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  32.6 
 
 
405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  34.14 
 
 
409 aa  196  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  34.14 
 
 
409 aa  196  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  36.01 
 
 
657 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  36.8 
 
 
410 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  37.11 
 
 
409 aa  193  5e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  37.11 
 
 
409 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  32.03 
 
 
409 aa  192  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  33.41 
 
 
443 aa  189  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  36.87 
 
 
409 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  33.9 
 
 
406 aa  188  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  32.28 
 
 
405 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  33.9 
 
 
405 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  33.9 
 
 
405 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  33.82 
 
 
405 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  33.5 
 
 
407 aa  186  5e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  32.04 
 
 
405 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  33.17 
 
 
405 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  35.11 
 
 
408 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  28.64 
 
 
394 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  34.34 
 
 
394 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  33.33 
 
 
656 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  32.85 
 
 
405 aa  178  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  28.25 
 
 
394 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  29.16 
 
 
406 aa  177  3e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  32.86 
 
 
405 aa  177  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  30.9 
 
 
406 aa  177  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  33.66 
 
 
404 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  30.81 
 
 
403 aa  176  8e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  30.98 
 
 
408 aa  175  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  33.25 
 
 
656 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  33.25 
 
 
666 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  31.34 
 
 
391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  32.35 
 
 
654 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  33.59 
 
 
643 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  32.12 
 
 
409 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  32.11 
 
 
400 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  33 
 
 
657 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  31.86 
 
 
400 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  31.4 
 
 
408 aa  169  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  31.2 
 
 
654 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  31.42 
 
 
647 aa  169  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  32.6 
 
 
654 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  32.01 
 
 
644 aa  168  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  33.83 
 
 
398 aa  168  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  32.24 
 
 
414 aa  166  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  28.78 
 
 
397 aa  166  5e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  33.33 
 
 
671 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  31.69 
 
 
415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  30.27 
 
 
409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  31.62 
 
 
401 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8341  protein of unknown function DUF214  35.63 
 
 
394 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  30.77 
 
 
385 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  32.22 
 
 
663 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  31.43 
 
 
414 aa  162  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  33.17 
 
 
410 aa  162  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  29.9 
 
 
401 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  31.86 
 
 
661 aa  160  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  31.7 
 
 
667 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  27.91 
 
 
406 aa  160  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  29.27 
 
 
411 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  31.7 
 
 
663 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  31.27 
 
 
656 aa  160  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  31.7 
 
 
682 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  31.7 
 
 
667 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  31.7 
 
 
682 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1168  hypothetical protein  31.92 
 
 
406 aa  159  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.69946  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  31.51 
 
 
645 aa  159  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  34.31 
 
 
403 aa  158  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  29.9 
 
 
653 aa  158  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  31.3 
 
 
405 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  28.06 
 
 
397 aa  157  3e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  28.95 
 
 
406 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  35.24 
 
 
395 aa  157  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.02 
 
 
656 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  33.01 
 
 
411 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.45 
 
 
678 aa  156  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  31.45 
 
 
678 aa  156  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  30.1 
 
 
402 aa  155  8e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  31.45 
 
 
678 aa  155  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  31.48 
 
 
401 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  31.48 
 
 
401 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.77 
 
 
412 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>