More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3709 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  100 
 
 		 404 aa  802    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  56.42 
 
 		 402 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  52.37 
 
 		 402 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3478  protein of unknown function DUF214  51.01 
 
 		 402 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  40.84 
 
 		 399 aa  266  4e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3708  ABC transporter permease protein  38.54 
 
 		 399 aa  242  9e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3479  protein of unknown function DUF214  36.11 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  34.96 
 
 		 409 aa  221  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  32.91 
 
 		 405 aa  217  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0954  hypothetical protein  33.17 
 
 		 399 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  34.61 
 
 		 398 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  34.1 
 
 		 410 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  33.08 
 
 		 406 aa  205  1e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  33.85 
 
 		 409 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  34.28 
 
 		 403 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  33.84 
 
 		 410 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  34.95 
 
 		 409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  34.78 
 
 		 407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  33.68 
 
 		 405 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  32 
 
 		 405 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  32.2 
 
 		 406 aa  198  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  33.17 
 
 		 405 aa  197  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  34.96 
 
 		 409 aa  196  7e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  33.84 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  33.59 
 
 		 401 aa  195  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  33.85 
 
 		 657 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  32.91 
 
 		 409 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  33.68 
 
 		 654 aa  193  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  34.78 
 
 		 409 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  34.78 
 
 		 409 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  32.11 
 
 		 405 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  32.11 
 
 		 405 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  31.78 
 
 		 406 aa  186  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  32.92 
 
 		 405 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  32.92 
 
 		 405 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  32.83 
 
 		 394 aa  186  9e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  32.92 
 
 		 656 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  33.33 
 
 		 409 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  34.07 
 
 		 411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  31.82 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  31.43 
 
 		 663 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  33.57 
 
 		 443 aa  183  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  33.42 
 
 		 656 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  31.99 
 
 		 409 aa  182  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  32.49 
 
 		 654 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  31.77 
 
 		 657 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  31.28 
 
 		 400 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  32.04 
 
 		 408 aa  180  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  31.52 
 
 		 400 aa  180  4e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  35.09 
 
 		 400 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  33.75 
 
 		 408 aa  179  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  32.38 
 
 		 391 aa  179  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  32 
 
 		 403 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  33.25 
 
 		 409 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  35.09 
 
 		 409 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  34.84 
 
 		 409 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  32.25 
 
 		 406 aa  176  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  31.78 
 
 		 402 aa  176  6e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  35.09 
 
 		 409 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  31.78 
 
 		 401 aa  176  7e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  30.91 
 
 		 663 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  33.77 
 
 		 671 aa  176  8e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  31.46 
 
 		 652 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  31.2 
 
 		 651 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  34.62 
 
 		 414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  31.63 
 
 		 406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  34.38 
 
 		 414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  33.33 
 
 		 410 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  32.74 
 
 		 654 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  31.97 
 
 		 661 aa  172  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  33.42 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  32.01 
 
 		 410 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  30.23 
 
 		 408 aa  170  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  32.09 
 
 		 409 aa  170  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.49 
 
 		 656 aa  170  5e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  33.83 
 
 		 415 aa  170  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  32.3 
 
 		 402 aa  169  7e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  32.3 
 
 		 402 aa  169  7e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  30.65 
 
 		 666 aa  169  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  30.38 
 
 		 398 aa  168  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  32.35 
 
 		 409 aa  169  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  28.8 
 
 		 394 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  30.15 
 
 		 412 aa  169  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  32.24 
 
 		 656 aa  169  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  32.09 
 
 		 412 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  30.53 
 
 		 400 aa  168  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1168  hypothetical protein  31.84 
 
 		 406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.69946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  29.46 
 
 		 402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  32.38 
 
 		 417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  30.83 
 
 		 644 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  29.52 
 
 		 652 aa  166  8e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  30.75 
 
 		 400 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  31.87 
 
 		 404 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  30.28 
 
 		 653 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  29.44 
 
 		 643 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  32.16 
 
 		 667 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  32.16 
 
 		 667 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  32.16 
 
 		 682 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  30.62 
 
 		 413 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  30.79 
 
 		 647 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>