More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0059 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  100 
 
 
397 aa  803    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1024  hypothetical protein  79.1 
 
 
402 aa  602  1.0000000000000001e-171  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.210647  normal  0.67232 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  50.38 
 
 
386 aa  369  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  51.26 
 
 
390 aa  355  7.999999999999999e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  45.73 
 
 
381 aa  316  5e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  44.12 
 
 
408 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  51.24 
 
 
430 aa  305  7e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  41.19 
 
 
396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  39.07 
 
 
399 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  43.14 
 
 
393 aa  278  8e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2040  hypothetical protein  40.49 
 
 
410 aa  259  5.0000000000000005e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11269  normal  0.213161 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0755  hypothetical protein  40.83 
 
 
407 aa  259  6e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.951595  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  35.18 
 
 
387 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  37.68 
 
 
397 aa  233  5e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  34.32 
 
 
413 aa  228  1e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  33.5 
 
 
367 aa  209  6e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2169  protein of unknown function DUF214  30.96 
 
 
448 aa  151  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  31.03 
 
 
400 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  29.28 
 
 
379 aa  144  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  27.97 
 
 
397 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  28.99 
 
 
401 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  28.61 
 
 
443 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  31.01 
 
 
400 aa  141  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  30.19 
 
 
402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  26.42 
 
 
397 aa  136  8e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  29.68 
 
 
400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  27.54 
 
 
401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  29.78 
 
 
402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  30 
 
 
391 aa  133  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  27.48 
 
 
397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  27.64 
 
 
397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  26.35 
 
 
405 aa  130  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0585  hypothetical protein  28.43 
 
 
402 aa  130  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000219996  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  28 
 
 
397 aa  131  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  27.97 
 
 
402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  29.43 
 
 
421 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  27.08 
 
 
403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  27.32 
 
 
397 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  26.59 
 
 
452 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  29.62 
 
 
400 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  27.23 
 
 
397 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  29.13 
 
 
406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  29.48 
 
 
400 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  26.76 
 
 
402 aa  126  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  28.57 
 
 
403 aa  126  7e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  29.13 
 
 
402 aa  126  9e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  29.13 
 
 
402 aa  126  9e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  28.54 
 
 
413 aa  125  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  26.85 
 
 
397 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  27.79 
 
 
397 aa  123  7e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  28.26 
 
 
406 aa  123  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  27.96 
 
 
406 aa  122  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  27.64 
 
 
409 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  27.54 
 
 
397 aa  119  6e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  27 
 
 
397 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  34.22 
 
 
443 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  27.4 
 
 
409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  27.1 
 
 
403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  29.43 
 
 
399 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0223  hypothetical protein  28.71 
 
 
401 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  26.24 
 
 
385 aa  117  5e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  28.81 
 
 
417 aa  117  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  25.74 
 
 
371 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  25.12 
 
 
411 aa  116  7.999999999999999e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  28.87 
 
 
409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  26.04 
 
 
404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  28.57 
 
 
421 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  26.41 
 
 
408 aa  114  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  26.19 
 
 
406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  26.47 
 
 
402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3708  ABC transporter permease protein  28.18 
 
 
399 aa  113  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  24.63 
 
 
404 aa  113  6e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  26.23 
 
 
411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0266  hypothetical protein  30.34 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17241  normal  0.0445989 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  24.63 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  26.92 
 
 
412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  26.25 
 
 
405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  26.28 
 
 
392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  27.51 
 
 
410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  27.25 
 
 
412 aa  110  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0269  hypothetical protein  29.02 
 
 
414 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831572  hitchhiker  0.00091516 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  27.38 
 
 
407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  26.21 
 
 
404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  24.94 
 
 
397 aa  109  8.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2440  protein of unknown function DUF214  28.44 
 
 
416 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.652514  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  27.85 
 
 
415 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  27.43 
 
 
401 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  27.45 
 
 
421 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  24.81 
 
 
397 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  31.86 
 
 
398 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  24.76 
 
 
412 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  26.2 
 
 
409 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  25.88 
 
 
667 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  26.88 
 
 
387 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  25.69 
 
 
394 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  25.89 
 
 
653 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  25.63 
 
 
667 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  27.53 
 
 
645 aa  107  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  25.44 
 
 
647 aa  106  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  26.18 
 
 
395 aa  106  9e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>