More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1792 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  92.7 
 
 
397 aa  707    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  100 
 
 
397 aa  780    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  94.71 
 
 
397 aa  722    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  73.8 
 
 
397 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  75.31 
 
 
397 aa  590  1e-167  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  74.06 
 
 
397 aa  588  1e-167  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  74.56 
 
 
397 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  71.79 
 
 
397 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  72.29 
 
 
397 aa  567  1e-161  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  71.79 
 
 
397 aa  565  1e-160  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  71.03 
 
 
397 aa  555  1e-157  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  55.67 
 
 
395 aa  421  1e-117  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 
414 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  30.71 
 
 
414 aa  179  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  30.75 
 
 
414 aa  177  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  29.83 
 
 
414 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  31.83 
 
 
415 aa  170  4e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  29.88 
 
 
409 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  31.19 
 
 
400 aa  169  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  29.7 
 
 
401 aa  168  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  29.8 
 
 
400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  30.15 
 
 
402 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  30.56 
 
 
399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  28.33 
 
 
409 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  30.05 
 
 
402 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0585  hypothetical protein  29.3 
 
 
402 aa  160  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000219996  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  30.05 
 
 
402 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  29.93 
 
 
400 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  29.64 
 
 
443 aa  159  9e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  29.76 
 
 
400 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  29.24 
 
 
400 aa  158  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  29.19 
 
 
403 aa  157  4e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  29.31 
 
 
401 aa  157  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  28.97 
 
 
644 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  28.35 
 
 
387 aa  155  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  27.72 
 
 
643 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  28.36 
 
 
401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  28.95 
 
 
410 aa  153  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  27.71 
 
 
402 aa  152  7e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  27.63 
 
 
658 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  29.15 
 
 
408 aa  152  8.999999999999999e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  28.92 
 
 
398 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  30.2 
 
 
641 aa  152  1e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  27.96 
 
 
410 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  27.96 
 
 
410 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  28.85 
 
 
401 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  28.85 
 
 
401 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  27.01 
 
 
411 aa  149  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  29.15 
 
 
404 aa  149  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  28.37 
 
 
406 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  26.44 
 
 
402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3479  protein of unknown function DUF214  26.08 
 
 
399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  29.37 
 
 
406 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  29.26 
 
 
642 aa  145  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  27.87 
 
 
657 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  29.23 
 
 
641 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0635  ABC transporter, inner membrane subunit  27.83 
 
 
435 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000706682  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  29.22 
 
 
405 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  29.22 
 
 
405 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  28.17 
 
 
415 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1676  hypothetical protein  28.88 
 
 
412 aa  144  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.503245  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  28.74 
 
 
405 aa  144  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0746  putative ABC transport system permease protein  31.93 
 
 
403 aa  144  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.489511 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3708  ABC transporter permease protein  25.49 
 
 
399 aa  144  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  29.23 
 
 
641 aa  143  6e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  28.89 
 
 
409 aa  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  28.89 
 
 
409 aa  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  29.41 
 
 
647 aa  142  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  26.68 
 
 
406 aa  142  9e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  28.21 
 
 
414 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  26.39 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  27.87 
 
 
407 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0954  hypothetical protein  26.59 
 
 
399 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  28.99 
 
 
641 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  26.88 
 
 
402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  27.38 
 
 
431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  28.31 
 
 
406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  28.92 
 
 
395 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  26.62 
 
 
456 aa  140  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  27.7 
 
 
408 aa  140  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  28.32 
 
 
392 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  26.77 
 
 
419 aa  139  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  29.83 
 
 
399 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  26.22 
 
 
371 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  28.4 
 
 
391 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  27.03 
 
 
397 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  26.97 
 
 
652 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  27.23 
 
 
402 aa  139  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  28.11 
 
 
656 aa  139  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  27.05 
 
 
647 aa  138  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  30.53 
 
 
670 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  26.49 
 
 
409 aa  138  2e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  25.73 
 
 
403 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  28.74 
 
 
402 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  27.49 
 
 
405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  29.19 
 
 
398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  28.92 
 
 
409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  27.41 
 
 
387 aa  137  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  27.49 
 
 
682 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  30.45 
 
 
386 aa  137  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>