More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0746 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0746  putative ABC transport system permease protein  100 
 
 
403 aa  805    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.489511 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  55.2 
 
 
404 aa  462  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  55.69 
 
 
404 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0078  hypothetical protein  51.36 
 
 
404 aa  389  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000923125  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  47.77 
 
 
404 aa  374  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  34.57 
 
 
391 aa  199  6e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  32.05 
 
 
401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  31.12 
 
 
400 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  31.57 
 
 
406 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  30.86 
 
 
409 aa  176  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  29.51 
 
 
401 aa  176  8e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  30.19 
 
 
405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  32.13 
 
 
402 aa  172  6.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  32.79 
 
 
412 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  31.95 
 
 
409 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  31.75 
 
 
443 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  32.06 
 
 
410 aa  169  9e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  29.98 
 
 
410 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  32.07 
 
 
658 aa  168  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  31.48 
 
 
406 aa  167  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  30.56 
 
 
412 aa  167  4e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  33.73 
 
 
405 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  30.22 
 
 
405 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  32.69 
 
 
397 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  30.75 
 
 
400 aa  166  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  33.73 
 
 
405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  29.06 
 
 
406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  31.54 
 
 
405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  31.55 
 
 
397 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  32.53 
 
 
402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  28.92 
 
 
400 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  31.33 
 
 
402 aa  164  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  30.68 
 
 
400 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  29.76 
 
 
398 aa  162  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  30.24 
 
 
410 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  31.46 
 
 
397 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  29.01 
 
 
411 aa  162  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  29.21 
 
 
394 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  30.24 
 
 
410 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  31.86 
 
 
394 aa  160  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  30.28 
 
 
401 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  31.75 
 
 
409 aa  160  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  30.28 
 
 
401 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0585  hypothetical protein  28.78 
 
 
402 aa  160  4e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000219996  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  30.79 
 
 
397 aa  158  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  30.4 
 
 
409 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  29.63 
 
 
401 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  31.46 
 
 
414 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  30.3 
 
 
409 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  31.91 
 
 
420 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  29.22 
 
 
405 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  29.64 
 
 
403 aa  155  9e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  31.91 
 
 
420 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  31.58 
 
 
420 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  29.65 
 
 
656 aa  154  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  32.05 
 
 
405 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  28.37 
 
 
403 aa  155  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  31.14 
 
 
407 aa  155  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  27.47 
 
 
406 aa  155  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  29.53 
 
 
414 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  29.44 
 
 
409 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  32.05 
 
 
405 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  30.99 
 
 
657 aa  155  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  30.4 
 
 
405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  28.61 
 
 
402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  28.61 
 
 
402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  31.18 
 
 
443 aa  154  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  30.27 
 
 
397 aa  154  4e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  30.98 
 
 
397 aa  154  4e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  31.22 
 
 
397 aa  153  5e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  29.98 
 
 
394 aa  153  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  29.37 
 
 
395 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  29.4 
 
 
653 aa  152  7e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  29.98 
 
 
415 aa  152  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  28.36 
 
 
402 aa  153  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  31.29 
 
 
409 aa  152  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  29.8 
 
 
654 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  31.02 
 
 
409 aa  151  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  30.49 
 
 
397 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  26.68 
 
 
402 aa  150  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  29.88 
 
 
405 aa  150  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  30.17 
 
 
663 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  30.17 
 
 
663 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  29.62 
 
 
409 aa  149  7e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  29.78 
 
 
397 aa  149  7e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  30.32 
 
 
400 aa  149  9e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  30.07 
 
 
393 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  30.14 
 
 
409 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  30.14 
 
 
409 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  29.59 
 
 
657 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  31.4 
 
 
418 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  29.2 
 
 
657 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  28.16 
 
 
647 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2927  protein of unknown function DUF214  31.43 
 
 
409 aa  146  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.58384  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  29.04 
 
 
408 aa  146  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  30 
 
 
670 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  32.23 
 
 
398 aa  146  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  31.22 
 
 
414 aa  145  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  27.67 
 
 
400 aa  145  9e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  28.61 
 
 
409 aa  145  1e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>