More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0677 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 		 387 aa  768    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0895  hypothetical protein  69.25 
 
 		 387 aa  528  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0198854  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1894  protein of unknown function DUF214  64.6 
 
 		 385 aa  457  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  29.41 
 
 		 389 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  29.87 
 
 		 386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  28.85 
 
 		 397 aa  159  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  28.22 
 
 		 397 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  26.98 
 
 		 386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  27.64 
 
 		 386 aa  143  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  28.85 
 
 		 386 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  28.78 
 
 		 397 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  29.38 
 
 		 386 aa  136  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  29.18 
 
 		 397 aa  135  9e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  25.31 
 
 		 395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 		 386 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  29.57 
 
 		 385 aa  134  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  27.34 
 
 		 391 aa  133  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  27.43 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  28.11 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  27.2 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  29.43 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  27.16 
 
 		 397 aa  129  6e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  28.07 
 
 		 405 aa  129  7.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  28.61 
 
 		 401 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  31.84 
 
 		 414 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  29.26 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  28.86 
 
 		 397 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  25.96 
 
 		 397 aa  126  6e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  26.11 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  26.21 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  25.63 
 
 		 371 aa  123  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  27.64 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  27.44 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  25.43 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  27.4 
 
 		 404 aa  120  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  25.94 
 
 		 387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  29.1 
 
 		 392 aa  119  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  26.82 
 
 		 386 aa  119  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  29.92 
 
 		 394 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  27.47 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  28.81 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  26.97 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.25 
 
 		 420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  33.2 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  29.18 
 
 		 408 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  29.23 
 
 		 415 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  28.54 
 
 		 385 aa  117  5e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  27.34 
 
 		 401 aa  117  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  28.16 
 
 		 403 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  27.14 
 
 		 443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  33.21 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  30.66 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  26.39 
 
 		 411 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  28.79 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  27.06 
 
 		 418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  26.27 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  27.42 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  24.77 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  29.67 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  26.43 
 
 		 400 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  29 
 
 		 657 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  26.65 
 
 		 402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  26.71 
 
 		 397 aa  110  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  26.08 
 
 		 400 aa  110  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  26.29 
 
 		 397 aa  109  7.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  30.56 
 
 		 661 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  26.62 
 
 		 403 aa  109  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  27.94 
 
 		 644 aa  109  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  28.47 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  27.65 
 
 		 408 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1000  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.96 
 
 		 439 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.14096 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  28.28 
 
 		 651 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  28.86 
 
 		 654 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  30.48 
 
 		 671 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  25.78 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  24.46 
 
 		 406 aa  107  5e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  25.49 
 
 		 405 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0585  hypothetical protein  26.24 
 
 		 402 aa  107  5e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000219996  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  26.2 
 
 		 389 aa  106  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  27.61 
 
 		 408 aa  106  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  25.37 
 
 		 378 aa  106  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  27.05 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  26.93 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  27.2 
 
 		 645 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  29.1 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  26.65 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  28.95 
 
 		 658 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.84 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  26.65 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  28.4 
 
 		 409 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  27.38 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2359  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  30.48 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  27.12 
 
 		 403 aa  104  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  28.1 
 
 		 417 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  25.72 
 
 		 410 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  25.18 
 
 		 414 aa  104  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.64 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.998701  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  30.39 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  25.12 
 
 		 414 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>