More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0545 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
386 aa  761    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  58.29 
 
 
386 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  55.18 
 
 
386 aa  448  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  56.22 
 
 
386 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  55.96 
 
 
386 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  54.92 
 
 
386 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  55.96 
 
 
386 aa  437  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  47.12 
 
 
385 aa  325  6e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  35.03 
 
 
386 aa  233  6e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  34.19 
 
 
378 aa  225  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  35.5 
 
 
397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  37.45 
 
 
488 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  28.85 
 
 
387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2105  protein of unknown function DUF214  39.01 
 
 
462 aa  126  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00482864  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1894  protein of unknown function DUF214  28.47 
 
 
385 aa  124  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1869  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.47 
 
 
418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431923  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0895  hypothetical protein  26.77 
 
 
387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0198854  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3549  protein of unknown function DUF214  30.49 
 
 
386 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  25.94 
 
 
389 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  27.83 
 
 
429 aa  106  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  27.48 
 
 
430 aa  105  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  27.48 
 
 
430 aa  105  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  27.83 
 
 
429 aa  100  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  22.75 
 
 
397 aa  100  6e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3550  protein of unknown function DUF214  24.47 
 
 
408 aa  97.4  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  23.51 
 
 
397 aa  95.5  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  23.19 
 
 
397 aa  94.7  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  23.57 
 
 
397 aa  92.8  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  23.3 
 
 
395 aa  92.4  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  24.4 
 
 
405 aa  92  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  25.06 
 
 
393 aa  92  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  27.34 
 
 
409 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  28.21 
 
 
409 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  22.64 
 
 
397 aa  90.9  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  23.65 
 
 
397 aa  90.5  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  23.02 
 
 
397 aa  89.7  8e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  26.87 
 
 
409 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  24.22 
 
 
430 aa  89  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  21 
 
 
397 aa  89  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0527  ABC transport permease protein  25.61 
 
 
414 aa  88.2  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0117375  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  21.5 
 
 
397 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1515  permease domain protein  20.2 
 
 
373 aa  87  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000964832  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  26.03 
 
 
376 aa  87  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  26.03 
 
 
393 aa  87  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  23.75 
 
 
371 aa  87  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  30.18 
 
 
398 aa  86.7  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  21 
 
 
397 aa  86.3  8e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  22.79 
 
 
397 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1514  permease domain protein  24.54 
 
 
425 aa  84.7  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  20.75 
 
 
387 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  23.44 
 
 
430 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0446  integral membrane protein-permease component  22.5 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.69 
 
 
386 aa  83.6  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  27.78 
 
 
399 aa  83.2  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2806  hypothetical protein  25.84 
 
 
429 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.398602  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  24.63 
 
 
395 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2021  ABC transporter, permease protein  23.6 
 
 
429 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3708  ABC transporter permease protein  28.92 
 
 
399 aa  82.4  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  30.89 
 
 
379 aa  82.4  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  25.38 
 
 
379 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1833  ABC transporter, permease protein  23.4 
 
 
429 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  36.19 
 
 
394 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1652  ABC transporter, permease protein  23.6 
 
 
429 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  28.26 
 
 
420 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1251  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  21.77 
 
 
407 aa  81.3  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.430375  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1252  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  24.93 
 
 
434 aa  81.3  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.888586  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  24.77 
 
 
379 aa  80.5  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  23.17 
 
 
414 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0375  protein of unknown function DUF214  28.79 
 
 
380 aa  79.7  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.421228  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  28.02 
 
 
420 aa  79.3  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  25.06 
 
 
409 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  28.02 
 
 
420 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  26.64 
 
 
397 aa  78.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  22.47 
 
 
386 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  26.23 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0200  protein of unknown function DUF214  25.25 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  26.01 
 
 
402 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  27.27 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  28.3 
 
 
401 aa  76.3  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  23.41 
 
 
394 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  25 
 
 
393 aa  75.5  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3474  protein of unknown function DUF214  25.12 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  24.88 
 
 
852 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  25.43 
 
 
404 aa  73.9  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  27.09 
 
 
400 aa  73.9  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  26.1 
 
 
400 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  26.76 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1868  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.48 
 
 
370 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  25.86 
 
 
397 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  25.91 
 
 
410 aa  72.4  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  27.02 
 
 
855 aa  72.4  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  23.43 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  24.03 
 
 
414 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0767  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  24.34 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.016013  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  25.96 
 
 
390 aa  71.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  27.46 
 
 
836 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2135  lipoprotein ABC transporter permease  29.2 
 
 
314 aa  70.9  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.142253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  24.46 
 
 
406 aa  70.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  24.02 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  25.64 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>