More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0767 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0767  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  100 
 
 		 380 aa  750    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.016013  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0429  hydrogenase 4 membrane subunit  84.47 
 
 		 380 aa  653    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100883  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0528  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  51.31 
 
 		 376 aa  357  9.999999999999999e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.284767  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0446  integral membrane protein-permease component  48.67 
 
 		 373 aa  353  2.9999999999999997e-96  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1653  ABC transporter, permease protein  45.07 
 
 		 372 aa  317  3e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1834  ABC transporter, permease protein  45.07 
 
 		 372 aa  315  9.999999999999999e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1166  ABC transporter, permease protein  44.68 
 
 		 371 aa  305  7e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2022  ABC transporter, permease protein  45.07 
 
 		 372 aa  300  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  37.17 
 
 		 376 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  37.17 
 
 		 393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  37.92 
 
 		 379 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  37.92 
 
 		 379 aa  253  5.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  36.32 
 
 		 393 aa  249  8e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1515  permease domain protein  28.8 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000964832  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  25.54 
 
 		 430 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  25.54 
 
 		 430 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  25.12 
 
 		 429 aa  145  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  25.36 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  27.53 
 
 		 430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0527  ABC transport permease protein  27.03 
 
 		 414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0117375  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3550  protein of unknown function DUF214  27.23 
 
 		 408 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1869  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.59 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  25.92 
 
 		 430 aa  124  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1514  permease domain protein  25.17 
 
 		 425 aa  120  4.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3549  protein of unknown function DUF214  25.19 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1252  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  26.54 
 
 		 434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.888586  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0447  ABC transport permease protein  25.23 
 
 		 426 aa  106  7e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1167  ABC transporter, permease protein  26.62 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1833  ABC transporter, permease protein  23.32 
 
 		 429 aa  103  5e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2021  ABC transporter, permease protein  24.13 
 
 		 429 aa  103  5e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1652  ABC transporter, permease protein  23.67 
 
 		 429 aa  103  5e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0163  efflux ABC transporter, permease protein  24.88 
 
 		 444 aa  100  5e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1251  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  24.7 
 
 		 407 aa  100  5e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.430375  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1868  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.21 
 
 		 370 aa  93.6  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2806  hypothetical protein  24.36 
 
 		 429 aa  92  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.398602  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  21.27 
 
 		 386 aa  86.3  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  23.33 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  25.44 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  25.15 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  22.28 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  26.88 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  21.04 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  23.5 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  21.08 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2135  lipoprotein ABC transporter permease  24.1 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.142253 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3748  hypothetical protein  27.93 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  24.34 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  23.29 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  22.03 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  24.91 
 
 		 848 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  33.59 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  26.79 
 
 		 863 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  32.67 
 
 		 662 aa  63.9  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1280  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.2 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0107812  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4145  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.56 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  29.93 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1894  protein of unknown function DUF214  22.01 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  24.65 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  29.2 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4409  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.44 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1372  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.66 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0823  ABC transporter, permease protein  21.74 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395922  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.61 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  29.2 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1065  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.96 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.123078 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  23.83 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.7 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  24.52 
 
 		 855 aa  60.1  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  28.15 
 
 		 443 aa  59.7  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0755  hypothetical protein  25.19 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.951595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1000  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.72 
 
 		 439 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.14096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  25.81 
 
 		 836 aa  59.7  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  26.17 
 
 		 794 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  28.93 
 
 		 452 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0817  ABC transporter, permease protein  21.43 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3275  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.61 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314483  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  24.15 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  22.26 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  24.15 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  22.83 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4462  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.44 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  0.365763 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0164  efflux ABC transporter, permease protein  25.93 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  24.43 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3722  ABC transporter related  26.34 
 
 		 779 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2196  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.46 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00714902  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.33 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1840  peptide ABC transporter ATPase  32.19 
 
 		 779 aa  57.8  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0302017 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0718  protein of unknown function DUF214  22.46 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0857  protein of unknown function DUF214  25.17 
 
 		 459 aa  57.4  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.20592  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  29.87 
 
 		 401 aa  57  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  29.53 
 
 		 419 aa  57  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1117  lipoprotein releasing system transmembrane  21.61 
 
 		 416 aa  57  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0172186  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1195  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.47 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1139  conserved hypothetical integral membrane protein, putative permease  22.53 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0895  hypothetical protein  21.79 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0198854  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1472  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  20.96 
 
 		 414 aa  56.2  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2993  protein of unknown function DUF214  23.96 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  21.47 
 
 		 850 aa  56.2  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  30.58 
 
 		 834 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  24.01 
 
 		 411 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>