More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2105 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2105  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 462 aa  923    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00482864  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  42.52 
 
 		 488 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  55.12 
 
 		 397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  37.19 
 
 		 386 aa  162  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  37.85 
 
 		 386 aa  159  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  37.34 
 
 		 386 aa  157  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  36.51 
 
 		 386 aa  146  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  36.44 
 
 		 386 aa  146  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  36.51 
 
 		 386 aa  146  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  36.89 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  32.66 
 
 		 386 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  35.32 
 
 		 385 aa  131  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1869  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.63 
 
 		 418 aa  90.5  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  30.38 
 
 		 387 aa  90.1  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  25.36 
 
 		 430 aa  88.6  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  25.36 
 
 		 430 aa  88.6  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0895  hypothetical protein  29.45 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0198854  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  29.66 
 
 		 404 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  31.76 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  23.86 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  30.93 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  24.05 
 
 		 397 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  28.05 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1894  protein of unknown function DUF214  30.57 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  28.94 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2021  ABC transporter, permease protein  22.12 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  27.16 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  26.07 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3549  protein of unknown function DUF214  35 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  25.83 
 
 		 376 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  30.08 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  27.46 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  29.69 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  28.15 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1868  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.99 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1652  ABC transporter, permease protein  21.88 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1833  ABC transporter, permease protein  21.65 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  26.15 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  24.34 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  30.77 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  24.82 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  29.18 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  22.52 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  29.15 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  23.05 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  30.59 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  30.77 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  27.8 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  31.2 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  28.46 
 
 		 397 aa  67  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  25.4 
 
 		 430 aa  67  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  29.46 
 
 		 406 aa  67  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  23.53 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2806  hypothetical protein  22.47 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.398602  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  23.96 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  27.95 
 
 		 397 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  28.85 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  28.75 
 
 		 409 aa  66.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0164  efflux ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 455 aa  65.9  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  29.66 
 
 		 418 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  28.15 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  24.8 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0200  protein of unknown function DUF214  29.1 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  23.74 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  29.18 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  31.87 
 
 		 847 aa  65.5  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3708  ABC transporter permease protein  28.51 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 452 aa  65.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0527  ABC transport permease protein  23.31 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0117375  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  28.24 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  30.8 
 
 		 653 aa  64.7  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3474  protein of unknown function DUF214  28.76 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  29.2 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  26.01 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  30.74 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  36.9 
 
 		 838 aa  63.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  28.05 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  32.37 
 
 		 885 aa  63.5  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  26.97 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  30.05 
 
 		 847 aa  63.2  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1177  protein of unknown function DUF214  27.32 
 
 		 484 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000214205 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25280  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  32.31 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.45906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0426  predicted permease  24.75 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  31.43 
 
 		 443 aa  62.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0086  hypothetical protein  28.75 
 
 		 438 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3550  protein of unknown function DUF214  28.69 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0163  efflux ABC transporter, permease protein  28.02 
 
 		 444 aa  62  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  23.38 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  31.4 
 
 		 654 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  24.28 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  24.28 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7809  protein of unknown function DUF214  28.79 
 
 		 775 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  23.71 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5053  hypothetical protein  25 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.662722  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  30.26 
 
 		 843 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  28.34 
 
 		 652 aa  61.6  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  32.53 
 
 		 1090 aa  61.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2749  hypothetical protein  29.15 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0349567  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  29.17 
 
 		 842 aa  61.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  26.22 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.395515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>