More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2137 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  760    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 376 aa  761    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  84.14 
 
 		 379 aa  626  1e-178  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  83.6 
 
 		 379 aa  623  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  46.51 
 
 		 393 aa  347  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0767  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  37.17 
 
 		 380 aa  262  8e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.016013  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0429  hydrogenase 4 membrane subunit  36.91 
 
 		 380 aa  258  1e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100883  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0528  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  33.42 
 
 		 376 aa  224  3e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.284767  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1166  ABC transporter, permease protein  35.11 
 
 		 371 aa  220  3e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0446  integral membrane protein-permease component  32.27 
 
 		 373 aa  216  4e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1653  ABC transporter, permease protein  31.66 
 
 		 372 aa  182  8.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1834  ABC transporter, permease protein  32 
 
 		 372 aa  182  1e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2022  ABC transporter, permease protein  32 
 
 		 372 aa  168  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1515  permease domain protein  25.53 
 
 		 373 aa  163  5.0000000000000005e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000964832  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1252  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  28.34 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.888586  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1514  permease domain protein  25.64 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3550  protein of unknown function DUF214  29.44 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1869  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.25 
 
 		 418 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  27.8 
 
 		 429 aa  150  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  27.74 
 
 		 430 aa  150  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  27.74 
 
 		 430 aa  150  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  27.1 
 
 		 429 aa  149  9e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1868  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.77 
 
 		 370 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  25 
 
 		 430 aa  139  6e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3549  protein of unknown function DUF214  27.6 
 
 		 386 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0527  ABC transport permease protein  24.65 
 
 		 414 aa  134  3e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0117375  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0163  efflux ABC transporter, permease protein  25.79 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  24.24 
 
 		 430 aa  126  7e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0447  ABC transport permease protein  25.53 
 
 		 426 aa  122  8e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2021  ABC transporter, permease protein  22.86 
 
 		 429 aa  117  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1652  ABC transporter, permease protein  22.63 
 
 		 429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1833  ABC transporter, permease protein  22.4 
 
 		 429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1251  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  23.6 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.430375  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  26.11 
 
 		 386 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  24.74 
 
 		 386 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2806  hypothetical protein  25.38 
 
 		 429 aa  99.8  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.398602  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  23.1 
 
 		 386 aa  99.4  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1167  ABC transporter, permease protein  22.39 
 
 		 430 aa  95.9  9e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  22.91 
 
 		 386 aa  92.8  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  25.94 
 
 		 386 aa  90.9  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  22.7 
 
 		 386 aa  90.9  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  22.6 
 
 		 386 aa  89.7  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  23.35 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  21.5 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2135  lipoprotein ABC transporter permease  25.66 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.142253 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  24.68 
 
 		 389 aa  82.8  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  21.64 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  22.79 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  23.5 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0692  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  24.65 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.374483  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  24.6 
 
 		 794 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0164  efflux ABC transporter, permease protein  29.79 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  23.79 
 
 		 850 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  21.27 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  27.95 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  24.06 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  22.92 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  26.63 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  26.21 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  28.23 
 
 		 852 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  26.15 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  24.29 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1776  hypothetical protein  27.3 
 
 		 383 aa  69.3  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2105  protein of unknown function DUF214  26.14 
 
 		 462 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00482864  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2954  protein of unknown function DUF214  27.03 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0954365 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  33.08 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1446  protein of unknown function DUF214  26.14 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  26.46 
 
 		 398 aa  67  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  24.57 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  25.77 
 
 		 405 aa  67  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  24.57 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3748  hypothetical protein  25.55 
 
 		 416 aa  66.2  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  22.49 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2861  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  27.25 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.304015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1709  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  27.54 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.105135  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1602  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  27.25 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0219168  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1894  protein of unknown function DUF214  22.08 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0895  hypothetical protein  26.63 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00465052  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2111  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  25.09 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.386264  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  22.17 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  22.22 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1012  hypothetical protein  24.6 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000255652 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  23.6 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.99 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  20.55 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  25.38 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2175  hypothetical protein  25.84 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  25.12 
 
 		 657 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0320  hypothetical protein  33.06 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.895075  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  25.97 
 
 		 827 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  21.24 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.27 
 
 		 805 aa  63.2  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1575  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 402 aa  62.8  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000796219  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  32.14 
 
 		 413 aa  62.8  0.000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  23.72 
 
 		 654 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  31.06 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  22.47 
 
 		 656 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1906  hypothetical protein  24.31 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000396781  hitchhiker  0.00508578 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  22.8 
 
 		 653 aa  62  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1449  hypothetical protein  25.25 
 
 		 378 aa  62  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>