254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0447 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0447  ABC transport permease protein  100 
 
 		 426 aa  845    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0527  ABC transport permease protein  57.41 
 
 		 414 aa  485  1e-136  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0117375  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  53.85 
 
 		 430 aa  462  1e-129  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  53.61 
 
 		 430 aa  458  1e-127  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1167  ABC transporter, permease protein  46.51 
 
 		 430 aa  374  1e-102  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2021  ABC transporter, permease protein  49.52 
 
 		 429 aa  369  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1833  ABC transporter, permease protein  49.28 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1652  ABC transporter, permease protein  49.28 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  35.43 
 
 		 429 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  34.73 
 
 		 429 aa  298  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  35.12 
 
 		 430 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  35.12 
 
 		 430 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2806  hypothetical protein  38.46 
 
 		 429 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.398602  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1252  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  35.32 
 
 		 434 aa  265  1e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.888586  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1869  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.57 
 
 		 418 aa  247  4e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1514  permease domain protein  35.13 
 
 		 425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0163  efflux ABC transporter, permease protein  33.71 
 
 		 444 aa  237  2e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2135  lipoprotein ABC transporter permease  35.08 
 
 		 314 aa  209  9e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.142253 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3550  protein of unknown function DUF214  31.07 
 
 		 408 aa  205  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  25.74 
 
 		 376 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  25.74 
 
 		 393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  25.41 
 
 		 379 aa  126  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  25.17 
 
 		 379 aa  123  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0767  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  25.23 
 
 		 380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.016013  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1515  permease domain protein  23.53 
 
 		 373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000964832  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0429  hydrogenase 4 membrane subunit  25.4 
 
 		 380 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100883  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0446  integral membrane protein-permease component  26.1 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  22.94 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3549  protein of unknown function DUF214  21.85 
 
 		 386 aa  103  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1166  ABC transporter, permease protein  27.48 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0528  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  27.19 
 
 		 376 aa  99.8  8e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.284767  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1653  ABC transporter, permease protein  26.3 
 
 		 372 aa  86.3  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  23.1 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1834  ABC transporter, permease protein  25.71 
 
 		 372 aa  82.8  0.000000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2022  ABC transporter, permease protein  26.3 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1251  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  22.3 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.430375  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  23.94 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  22.03 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  22.08 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  21.77 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  21.56 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  21.83 
 
 		 386 aa  67  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0164  efflux ABC transporter, permease protein  22.22 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  22.14 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  19.41 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  22.02 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0349  protein of unknown function DUF214  23.56 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  19.55 
 
 		 386 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  22.32 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2105  protein of unknown function DUF214  22.47 
 
 		 462 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00482864  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  22.93 
 
 		 849 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  23.75 
 
 		 850 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  24.51 
 
 		 794 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  20.18 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  20.16 
 
 		 386 aa  59.7  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2749  hypothetical protein  24.56 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0349567  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  26.17 
 
 		 788 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  29.13 
 
 		 662 aa  58.2  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  34.62 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3722  ABC transporter related  31.01 
 
 		 779 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1840  peptide ABC transporter ATPase  37.04 
 
 		 779 aa  55.5  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0302017 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  23.31 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  20.86 
 
 		 880 aa  55.1  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  24.01 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  22.46 
 
 		 863 aa  53.1  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0609  protein of unknown function DUF214  24.6 
 
 		 422 aa  53.1  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000928533  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  22.26 
 
 		 852 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  33.08 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  29.52 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  19.61 
 
 		 397 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  32.28 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  24.44 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  28.71 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1809  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  23.52 
 
 		 414 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  26.87 
 
 		 419 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  21.49 
 
 		 488 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  24.84 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4005  protein of unknown function DUF214  26.67 
 
 		 301 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0585  hypothetical protein  22.64 
 
 		 402 aa  51.2  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000219996  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  20.23 
 
 		 397 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  22.07 
 
 		 404 aa  51.6  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  26.43 
 
 		 399 aa  50.8  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4329  protein of unknown function DUF214  23.93 
 
 		 407 aa  51.2  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  21.24 
 
 		 847 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1776  hypothetical protein  24.26 
 
 		 383 aa  51.2  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  34.12 
 
 		 401 aa  50.8  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  28.21 
 
 		 443 aa  50.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1100  cell division ABC transporter, permease  23.36 
 
 		 309 aa  50.4  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0179229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  29.2 
 
 		 452 aa  50.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  23.08 
 
 		 648 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  23.41 
 
 		 664 aa  49.7  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  21.8 
 
 		 404 aa  49.7  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  20.54 
 
 		 847 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1454  Cell division protein-like protein  26.23 
 
 		 301 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.805507 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  30.58 
 
 		 421 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1868  ABC efflux pump, inner membrane subunit  19.69 
 
 		 370 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01070  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  27.14 
 
 		 1207 aa  49.3  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  28.33 
 
 		 415 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  32 
 
 		 415 aa  48.9  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>