More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1251 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1251  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  100 
 
 
407 aa  823    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.430375  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0164  efflux ABC transporter, permease protein  57.56 
 
 
455 aa  497  1e-139  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1515  permease domain protein  35.89 
 
 
373 aa  224  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000964832  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  29.61 
 
 
393 aa  160  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  26.3 
 
 
430 aa  127  5e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0767  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  24.94 
 
 
380 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.016013  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  22.76 
 
 
429 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  25.06 
 
 
379 aa  120  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  22.76 
 
 
429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0429  hydrogenase 4 membrane subunit  26.68 
 
 
380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100883  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1868  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.94 
 
 
370 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  23.36 
 
 
430 aa  116  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  23.36 
 
 
430 aa  116  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  24.39 
 
 
379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  23.6 
 
 
393 aa  111  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  23.6 
 
 
376 aa  110  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1166  ABC transporter, permease protein  24.28 
 
 
371 aa  109  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1869  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.63 
 
 
418 aa  106  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431923  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  24.32 
 
 
430 aa  105  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0446  integral membrane protein-permease component  23.72 
 
 
373 aa  103  6e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0528  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  23.98 
 
 
376 aa  102  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.284767  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1514  permease domain protein  24.07 
 
 
425 aa  100  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  25.36 
 
 
386 aa  100  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  23.97 
 
 
386 aa  96.7  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1653  ABC transporter, permease protein  23.41 
 
 
372 aa  95.5  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1834  ABC transporter, permease protein  23.41 
 
 
372 aa  94.4  4e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0527  ABC transport permease protein  21.96 
 
 
414 aa  93.6  5e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0117375  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  23.19 
 
 
386 aa  93.2  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  32.46 
 
 
398 aa  89  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  21.77 
 
 
386 aa  87.8  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  23.75 
 
 
386 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  32.14 
 
 
395 aa  87.4  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2022  ABC transporter, permease protein  23.41 
 
 
372 aa  87  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2021  ABC transporter, permease protein  20.09 
 
 
429 aa  86.7  7e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3550  protein of unknown function DUF214  23.25 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3549  protein of unknown function DUF214  23.21 
 
 
386 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  36.84 
 
 
394 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1652  ABC transporter, permease protein  19.64 
 
 
429 aa  84  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  23.81 
 
 
411 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1833  ABC transporter, permease protein  19.64 
 
 
429 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  23 
 
 
386 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0163  efflux ABC transporter, permease protein  22.03 
 
 
444 aa  81.6  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  22.76 
 
 
386 aa  80.1  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  31.14 
 
 
394 aa  79.7  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2806  hypothetical protein  24.78 
 
 
429 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.398602  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  32.33 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  36.3 
 
 
400 aa  79.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  30.65 
 
 
406 aa  79  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  22.36 
 
 
386 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  26.57 
 
 
411 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  25.42 
 
 
400 aa  77  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  33.13 
 
 
383 aa  77  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8555  ABC transporter related protein  34.29 
 
 
391 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  23.19 
 
 
652 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  21.14 
 
 
389 aa  75.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  31.9 
 
 
383 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  31.9 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  31.9 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  31.9 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  31.9 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  31.9 
 
 
384 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  31.9 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  31.9 
 
 
383 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1252  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  21.15 
 
 
434 aa  75.5  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.888586  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1167  ABC transporter, permease protein  19.5 
 
 
430 aa  73.9  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  31.29 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  22.76 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  24.57 
 
 
404 aa  73.6  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  27.19 
 
 
393 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  29.61 
 
 
423 aa  73.2  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  39.6 
 
 
409 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  32.9 
 
 
401 aa  72.4  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5053  hypothetical protein  27.46 
 
 
414 aa  72.8  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.662722  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4329  protein of unknown function DUF214  29.44 
 
 
407 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  33.95 
 
 
715 aa  72  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  22.53 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  23.84 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  42.42 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  30.97 
 
 
401 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  22.01 
 
 
394 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  41.58 
 
 
417 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0447  ABC transport permease protein  21.85 
 
 
426 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  37.19 
 
 
407 aa  70.5  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2283  permease, putative  33.1 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.14949  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  28.76 
 
 
453 aa  70.5  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  27.98 
 
 
452 aa  70.1  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  22.32 
 
 
419 aa  69.7  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8189  ABC transporter related protein  41.28 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  30.82 
 
 
410 aa  69.7  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0938  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25 
 
 
414 aa  68.6  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1046  lipoprotein releasing system transmembrane protein  25 
 
 
414 aa  68.6  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2964  protein of unknown function DUF214  39.6 
 
 
415 aa  68.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036613 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  29.18 
 
 
409 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.82 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  27.19 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  33.33 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  23.53 
 
 
406 aa  67.8  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  29.71 
 
 
848 aa  67.4  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  24.01 
 
 
400 aa  67  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>