More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1869 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1869  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 		 418 aa  834    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  40.79 
 
 		 429 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  41.03 
 
 		 429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2806  hypothetical protein  43.79 
 
 		 429 aa  310  5e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.398602  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  39.53 
 
 		 430 aa  306  6e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  39.53 
 
 		 430 aa  306  6e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1252  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  37.88 
 
 		 434 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.888586  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1514  permease domain protein  37.24 
 
 		 425 aa  303  3.0000000000000004e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  36.88 
 
 		 430 aa  289  8e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  36.41 
 
 		 430 aa  285  7e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0527  ABC transport permease protein  35.39 
 
 		 414 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0117375  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0163  efflux ABC transporter, permease protein  37.7 
 
 		 444 aa  278  1e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3550  protein of unknown function DUF214  39.29 
 
 		 408 aa  275  8e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1167  ABC transporter, permease protein  34.19 
 
 		 430 aa  267  2e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2021  ABC transporter, permease protein  32.01 
 
 		 429 aa  264  2e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1652  ABC transporter, permease protein  31.78 
 
 		 429 aa  263  6e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1833  ABC transporter, permease protein  31.78 
 
 		 429 aa  260  3e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0447  ABC transport permease protein  33.57 
 
 		 426 aa  250  4e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2135  lipoprotein ABC transporter permease  39.34 
 
 		 314 aa  218  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.142253 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  30.35 
 
 		 393 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  29.95 
 
 		 379 aa  160  6e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  29.72 
 
 		 379 aa  159  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3549  protein of unknown function DUF214  29.68 
 
 		 386 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  29.1 
 
 		 376 aa  152  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  29.1 
 
 		 393 aa  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1515  permease domain protein  26.06 
 
 		 373 aa  147  3e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000964832  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  28.85 
 
 		 386 aa  139  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0767  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  26.59 
 
 		 380 aa  136  7.000000000000001e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.016013  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  26.39 
 
 		 386 aa  133  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  28.96 
 
 		 386 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  27.4 
 
 		 386 aa  127  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0429  hydrogenase 4 membrane subunit  27.48 
 
 		 380 aa  127  5e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100883  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  27.4 
 
 		 386 aa  126  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  27.47 
 
 		 386 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  29.15 
 
 		 385 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  26.58 
 
 		 386 aa  123  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0446  integral membrane protein-permease component  27.25 
 
 		 373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0528  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  24.36 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.284767  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1653  ABC transporter, permease protein  23.42 
 
 		 372 aa  110  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1834  ABC transporter, permease protein  24.36 
 
 		 372 aa  109  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1251  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  21.63 
 
 		 407 aa  108  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.430375  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  24.19 
 
 		 386 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1166  ABC transporter, permease protein  25.12 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  26.42 
 
 		 397 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2022  ABC transporter, permease protein  23.42 
 
 		 372 aa  95.5  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1868  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.65 
 
 		 370 aa  95.5  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  24.02 
 
 		 397 aa  90.9  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  22.68 
 
 		 378 aa  90.9  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  24.94 
 
 		 397 aa  88.6  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  24.19 
 
 		 389 aa  81.6  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  27.05 
 
 		 488 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2105  protein of unknown function DUF214  24.37 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00482864  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  24.44 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  23.85 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  25.92 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  23.06 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2283  permease, putative  24.77 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.14949  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  29.18 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  22.01 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  25.66 
 
 		 827 aa  67.4  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0164  efflux ABC transporter, permease protein  23.87 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  22.65 
 
 		 397 aa  67  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  22.05 
 
 		 397 aa  67  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23240  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  23.64 
 
 		 415 aa  67  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0371  putative ABC transporter, integral membrane protein  23.65 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.258896  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  28.99 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  24.32 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1740  ABC transporter membrane spanning protein  24.41 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.147499  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0609  protein of unknown function DUF214  27.54 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000928533  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  28.99 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  24.42 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1776  hypothetical protein  25.09 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  22.86 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  33.57 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  23.88 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  21.64 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5053  hypothetical protein  21.85 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.662722  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1470  hypothetical protein  24.39 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  18.9 
 
 		 395 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  27.34 
 
 		 409 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  20.99 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1840  protein of unknown function DUF214  25.69 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  22.75 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  24.91 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3882  hypothetical protein  23.34 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00664536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  30.71 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  32.81 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  28.32 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  21.64 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  29.32 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  30.99 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  22.62 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  22.42 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0317  protein of unknown function DUF214  23.17 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1668  hypothetical protein  20.55 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  22.37 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1280  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.47 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0107812  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  31.16 
 
 		 452 aa  59.7  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  23.26 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3827  hypothetical protein  23.02 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>