More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1822 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  801    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  50.86 
 
 
393 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0755  hypothetical protein  49.76 
 
 
407 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.951595  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  45.7 
 
 
396 aa  347  2e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2040  hypothetical protein  47.36 
 
 
410 aa  345  1e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11269  normal  0.213161 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  39.95 
 
 
386 aa  310  2e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  44.36 
 
 
390 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  43.63 
 
 
397 aa  294  2e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1024  hypothetical protein  44.85 
 
 
402 aa  290  2e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.210647  normal  0.67232 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  44.91 
 
 
381 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  38.85 
 
 
413 aa  275  7e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  38.16 
 
 
399 aa  257  3e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  44.34 
 
 
430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  40.05 
 
 
397 aa  243  3e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  31.45 
 
 
387 aa  222  9e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  33.25 
 
 
379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  28.75 
 
 
367 aa  160  3e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  30.64 
 
 
405 aa  157  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2169  protein of unknown function DUF214  29.17 
 
 
448 aa  140  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  31.37 
 
 
400 aa  139  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  27.96 
 
 
397 aa  138  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  29.08 
 
 
401 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  28.64 
 
 
403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  29.46 
 
 
397 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  30.99 
 
 
400 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  29.74 
 
 
401 aa  133  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  30.48 
 
 
400 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  28.61 
 
 
397 aa  132  9e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  30.14 
 
 
400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  30.63 
 
 
414 aa  131  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  29.43 
 
 
402 aa  130  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  29.52 
 
 
402 aa  130  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  28.67 
 
 
408 aa  129  8.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  29.34 
 
 
443 aa  129  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  30.48 
 
 
391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  26.67 
 
 
397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  28.54 
 
 
397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  28.77 
 
 
644 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  31.68 
 
 
399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  29.85 
 
 
400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  28.33 
 
 
404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  29.71 
 
 
414 aa  126  6e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  43.14 
 
 
452 aa  125  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  27.92 
 
 
404 aa  125  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  30.38 
 
 
414 aa  124  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  28.7 
 
 
415 aa  123  5e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3708  ABC transporter permease protein  29.02 
 
 
399 aa  123  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  30.19 
 
 
397 aa  123  7e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  30.14 
 
 
397 aa  123  8e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0585  hypothetical protein  30.07 
 
 
402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000219996  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  29.65 
 
 
397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  27.34 
 
 
656 aa  120  6e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  28.77 
 
 
402 aa  119  9e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 
443 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  27.51 
 
 
412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  28.54 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  27.62 
 
 
670 aa  117  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  28.7 
 
 
414 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  28.77 
 
 
406 aa  117  5e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  29.29 
 
 
387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  27.38 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  27.36 
 
 
405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  27.96 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  29.33 
 
 
403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  27.9 
 
 
402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  26.29 
 
 
642 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  27.9 
 
 
402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  28.67 
 
 
397 aa  113  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  29.36 
 
 
403 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  28.06 
 
 
392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  28.88 
 
 
643 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  28.43 
 
 
658 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3479  protein of unknown function DUF214  28.54 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  28.2 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  27.14 
 
 
393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  28.29 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  30 
 
 
418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  26.43 
 
 
696 aa  110  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  27.66 
 
 
405 aa  111  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  35.79 
 
 
413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  24.76 
 
 
656 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  28.77 
 
 
404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  28.5 
 
 
410 aa  109  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  38.71 
 
 
408 aa  109  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  28.33 
 
 
397 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  26.83 
 
 
412 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  24.52 
 
 
682 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  26.4 
 
 
657 aa  109  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  24.52 
 
 
682 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  24.52 
 
 
667 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  24.52 
 
 
667 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  25.87 
 
 
417 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  24.83 
 
 
406 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  25.37 
 
 
715 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  26.76 
 
 
423 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  30.94 
 
 
403 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  31.11 
 
 
405 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  27.08 
 
 
654 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  28.13 
 
 
410 aa  106  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  27.46 
 
 
409 aa  106  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>