More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0269 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
430 aa  848    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  44.65 
 
 
386 aa  359  5e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  46.33 
 
 
397 aa  335  7.999999999999999e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  43.49 
 
 
390 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  42.03 
 
 
381 aa  312  6.999999999999999e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1024  hypothetical protein  43.91 
 
 
402 aa  302  9e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.210647  normal  0.67232 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  41.01 
 
 
408 aa  287  2e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  38.3 
 
 
396 aa  272  6e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  36.28 
 
 
387 aa  259  7e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0755  hypothetical protein  39.5 
 
 
407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.951595  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  35.31 
 
 
399 aa  254  3e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2040  hypothetical protein  38.58 
 
 
410 aa  251  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11269  normal  0.213161 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  38.46 
 
 
393 aa  242  1e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  34.02 
 
 
397 aa  226  7e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  32.18 
 
 
413 aa  199  7e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  29.4 
 
 
367 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2169  protein of unknown function DUF214  29.47 
 
 
448 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  28.26 
 
 
401 aa  137  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  28.86 
 
 
402 aa  136  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  26.4 
 
 
379 aa  134  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  27.19 
 
 
403 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  29.58 
 
 
401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  27.68 
 
 
400 aa  131  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  28.15 
 
 
400 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  28.67 
 
 
402 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  28.67 
 
 
402 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  28.6 
 
 
400 aa  127  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  28.6 
 
 
400 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  27.45 
 
 
402 aa  124  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  26.97 
 
 
407 aa  124  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  27.8 
 
 
404 aa  124  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  27.42 
 
 
400 aa  124  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  27.8 
 
 
404 aa  123  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  27.03 
 
 
443 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  26.82 
 
 
391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  27.29 
 
 
412 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7079  protein of unknown function DUF214  25.11 
 
 
452 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  26.14 
 
 
406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  27.46 
 
 
405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  41.06 
 
 
452 aa  117  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  28.79 
 
 
413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  29.48 
 
 
414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  25.28 
 
 
405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  29.35 
 
 
409 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  27.35 
 
 
406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  24.88 
 
 
371 aa  114  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  24.85 
 
 
456 aa  113  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  29.12 
 
 
409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  28.67 
 
 
409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  28.22 
 
 
409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  38.29 
 
 
443 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  25.78 
 
 
412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  27.11 
 
 
399 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  28.25 
 
 
414 aa  111  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  26.68 
 
 
403 aa  111  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0585  hypothetical protein  26.91 
 
 
402 aa  111  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000219996  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3708  ABC transporter permease protein  28.14 
 
 
399 aa  111  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  30.86 
 
 
408 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  25.98 
 
 
406 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  27.78 
 
 
420 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  27.78 
 
 
420 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  27.8 
 
 
409 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  29.12 
 
 
409 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  25.51 
 
 
397 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  29.58 
 
 
420 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  24.49 
 
 
410 aa  109  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  26.56 
 
 
406 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  25.77 
 
 
412 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  27.58 
 
 
411 aa  107  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4297  hypothetical protein  30.83 
 
 
420 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105525  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  27.54 
 
 
409 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  28.08 
 
 
402 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  23.97 
 
 
670 aa  105  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  27.27 
 
 
401 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  25.23 
 
 
409 aa  103  7e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  29.96 
 
 
394 aa  103  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  26.44 
 
 
413 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5199  putative permease of ABC transporter  35.22 
 
 
423 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0520248  normal  0.0790722 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2927  protein of unknown function DUF214  24.72 
 
 
409 aa  102  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.58384  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3213  protein of unknown function DUF214  26.97 
 
 
411 aa  102  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.422328  normal  0.138688 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5378  ABC transporter permease protein  28.15 
 
 
400 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  27.81 
 
 
415 aa  101  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2606  hypothetical protein  29.77 
 
 
420 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000189226  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  27.95 
 
 
401 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  27.95 
 
 
401 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1359  permease, putative  25.27 
 
 
415 aa  100  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00178118  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  30.33 
 
 
454 aa  100  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  24.43 
 
 
395 aa  100  6e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0476  ABC transporter, permease protein  28.32 
 
 
399 aa  100  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  26.12 
 
 
410 aa  99.8  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  22.57 
 
 
405 aa  99.8  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  32.83 
 
 
405 aa  99.8  9e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4950  ABC transporter, permease  27.35 
 
 
400 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5426  ABC transporter, permease  27.35 
 
 
400 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5345  ABC transporter, permease  27.35 
 
 
400 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  24.45 
 
 
421 aa  99  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  24.89 
 
 
414 aa  98.2  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5578  ABC transporter, permease  26.61 
 
 
400 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.707712 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  24.45 
 
 
414 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  25.95 
 
 
397 aa  99  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>