More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0065 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  100 
 
 
381 aa  757    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  51.03 
 
 
386 aa  388  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  54.12 
 
 
390 aa  384  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  48.13 
 
 
399 aa  365  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  49.38 
 
 
397 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  45.23 
 
 
397 aa  319  3.9999999999999996e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1024  hypothetical protein  42.43 
 
 
402 aa  300  3e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.210647  normal  0.67232 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  41.56 
 
 
396 aa  298  1e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  44.51 
 
 
430 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  44.67 
 
 
408 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  37.43 
 
 
387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2040  hypothetical protein  40.39 
 
 
410 aa  251  1e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11269  normal  0.213161 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0755  hypothetical protein  40.35 
 
 
407 aa  249  4e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.951595  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  40.56 
 
 
393 aa  237  3e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  35.43 
 
 
413 aa  229  8e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  35.34 
 
 
367 aa  204  3e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  34.99 
 
 
379 aa  187  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2169  protein of unknown function DUF214  34.9 
 
 
448 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  33.67 
 
 
400 aa  166  8e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  31.39 
 
 
397 aa  159  6e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  31.31 
 
 
400 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  29.9 
 
 
402 aa  151  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  31.6 
 
 
400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  31.09 
 
 
402 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  28.96 
 
 
397 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  33.33 
 
 
400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  28.82 
 
 
443 aa  145  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  27.99 
 
 
397 aa  145  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  31.58 
 
 
402 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  31.58 
 
 
402 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  30.73 
 
 
401 aa  144  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  30.62 
 
 
400 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  29.19 
 
 
397 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  28.19 
 
 
408 aa  141  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  29.14 
 
 
403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  26.92 
 
 
391 aa  139  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  29.07 
 
 
402 aa  139  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  28.93 
 
 
397 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  30.28 
 
 
371 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  29.06 
 
 
407 aa  138  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  29.85 
 
 
401 aa  138  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  28.21 
 
 
402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
405 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  29.07 
 
 
397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  30.38 
 
 
403 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  27.6 
 
 
412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  29.8 
 
 
397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  26.17 
 
 
647 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  27.71 
 
 
392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  27.68 
 
 
653 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  28.22 
 
 
397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  31.42 
 
 
408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  28.87 
 
 
643 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  29.27 
 
 
405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  28.53 
 
 
395 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  33.2 
 
 
411 aa  126  8.000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  34.41 
 
 
403 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  28.26 
 
 
404 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  27.57 
 
 
413 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  27.01 
 
 
456 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  27.75 
 
 
397 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2149  hypothetical protein  28.22 
 
 
402 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531927  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  29.85 
 
 
397 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  28.26 
 
 
404 aa  124  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  27.9 
 
 
670 aa  123  5e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  27.38 
 
 
397 aa  123  5e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  26.98 
 
 
397 aa  123  5e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  28.54 
 
 
406 aa  122  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  27.48 
 
 
657 aa  122  7e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  27.02 
 
 
667 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  26.57 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  27.86 
 
 
415 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  30.74 
 
 
656 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  27.02 
 
 
667 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  28.13 
 
 
395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  27.32 
 
 
642 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  25.13 
 
 
385 aa  121  3e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  27.45 
 
 
412 aa  121  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  27.27 
 
 
404 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  26.77 
 
 
682 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  26.77 
 
 
682 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  25.89 
 
 
405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  27.38 
 
 
414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  26.04 
 
 
404 aa  119  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  27.3 
 
 
648 aa  119  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  28.07 
 
 
417 aa  119  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  25.87 
 
 
397 aa  119  9e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  28.36 
 
 
414 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  26.2 
 
 
678 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  26.02 
 
 
393 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  28.1 
 
 
653 aa  118  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.2 
 
 
678 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  28.11 
 
 
409 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  26.4 
 
 
648 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3478  protein of unknown function DUF214  29.29 
 
 
402 aa  119  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  26.4 
 
 
648 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  26.2 
 
 
678 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  25.51 
 
 
404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  27.08 
 
 
406 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  27.74 
 
 
404 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>