More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2169 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2169  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
448 aa  849    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  40.21 
 
 
379 aa  233  7.000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  34.68 
 
 
399 aa  207  4e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  32.91 
 
 
386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  28.65 
 
 
367 aa  191  2e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  28.83 
 
 
387 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  34.82 
 
 
381 aa  177  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  33.5 
 
 
397 aa  173  5e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  31.83 
 
 
390 aa  169  7e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  29.9 
 
 
413 aa  164  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  29.66 
 
 
408 aa  159  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  31.62 
 
 
397 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1024  hypothetical protein  30.9 
 
 
402 aa  147  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.210647  normal  0.67232 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  27.43 
 
 
396 aa  133  5e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  26 
 
 
397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  29.11 
 
 
393 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  28.5 
 
 
397 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  30.26 
 
 
430 aa  124  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  26.25 
 
 
397 aa  124  4e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  29.46 
 
 
397 aa  123  5e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  27.05 
 
 
397 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2040  hypothetical protein  26.81 
 
 
410 aa  120  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11269  normal  0.213161 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  27.82 
 
 
397 aa  121  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  25.87 
 
 
397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0755  hypothetical protein  26.63 
 
 
407 aa  120  7e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.951595  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  26.34 
 
 
405 aa  119  7.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  26.8 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  30.05 
 
 
407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  26.7 
 
 
397 aa  113  6e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  25.23 
 
 
408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  27.36 
 
 
397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  30.14 
 
 
412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  28.64 
 
 
391 aa  110  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  45.83 
 
 
452 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  25.74 
 
 
403 aa  108  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  26.33 
 
 
397 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  45.07 
 
 
443 aa  107  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  28.88 
 
 
407 aa  107  6e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  28.5 
 
 
403 aa  106  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  27.14 
 
 
401 aa  106  9e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  29.37 
 
 
400 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  26.73 
 
 
397 aa  106  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  29.9 
 
 
400 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  28.12 
 
 
400 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  27.78 
 
 
387 aa  104  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  28.33 
 
 
399 aa  103  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  24.52 
 
 
417 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  26.91 
 
 
404 aa  102  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  26.91 
 
 
404 aa  102  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  30.31 
 
 
420 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  30.31 
 
 
420 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  26.55 
 
 
402 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  26.51 
 
 
401 aa  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  30.07 
 
 
420 aa  99.8  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  25.97 
 
 
400 aa  99.8  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  25.64 
 
 
419 aa  99.4  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  27.59 
 
 
392 aa  99.4  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  28.47 
 
 
648 aa  99.4  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  26.86 
 
 
400 aa  99  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 
410 aa  98.6  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  26.27 
 
 
406 aa  98.6  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  28.47 
 
 
648 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  28.47 
 
 
648 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  28.47 
 
 
648 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  25.84 
 
 
443 aa  97.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  23.65 
 
 
414 aa  98.2  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  28.22 
 
 
648 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  28.47 
 
 
648 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  28.47 
 
 
648 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  28.47 
 
 
648 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  26.29 
 
 
413 aa  97.1  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  28.47 
 
 
405 aa  96.3  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  27.01 
 
 
648 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  27.01 
 
 
648 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  28.18 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  27.11 
 
 
648 aa  95.1  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  28.61 
 
 
402 aa  94.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  27.38 
 
 
402 aa  94.4  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0722  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.86 
 
 
420 aa  94.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  28.29 
 
 
402 aa  94.4  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  28.29 
 
 
402 aa  94.4  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  28.87 
 
 
412 aa  94  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  26.49 
 
 
652 aa  94  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  27.16 
 
 
404 aa  93.6  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  22.73 
 
 
414 aa  93.6  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  23.44 
 
 
414 aa  93.2  7e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2610  protein of unknown function DUF214  27.74 
 
 
395 aa  93.6  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2953  protein of unknown function DUF214  29.19 
 
 
406 aa  93.2  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  24.64 
 
 
406 aa  93.2  8e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  26.02 
 
 
411 aa  92.8  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4297  hypothetical protein  28.29 
 
 
420 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105525  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  26.9 
 
 
412 aa  92.4  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  26.87 
 
 
400 aa  92.8  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  24.08 
 
 
696 aa  92.8  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  26.41 
 
 
410 aa  92.8  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  25.06 
 
 
641 aa  92  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  25.06 
 
 
641 aa  91.7  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  25.92 
 
 
398 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0078  hypothetical protein  25.74 
 
 
404 aa  91.7  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000923125  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  22.91 
 
 
414 aa  91.7  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>