More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0119 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  93.45 
 
 
397 aa  713    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  95.47 
 
 
397 aa  719    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  100 
 
 
397 aa  783    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  74.56 
 
 
397 aa  596  1e-169  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  74.56 
 
 
397 aa  589  1e-167  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  74.31 
 
 
397 aa  587  1e-166  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  68.51 
 
 
397 aa  558  1e-158  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  66.5 
 
 
397 aa  542  1e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  68.77 
 
 
397 aa  530  1e-149  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  69.52 
 
 
397 aa  529  1e-149  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  68.51 
 
 
397 aa  526  1e-148  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  54.41 
 
 
395 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  30.98 
 
 
399 aa  179  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  31.26 
 
 
414 aa  179  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  31.59 
 
 
414 aa  179  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  29.27 
 
 
400 aa  176  8e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  30.64 
 
 
400 aa  173  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  30 
 
 
414 aa  171  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  30.59 
 
 
415 aa  169  7e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  29.58 
 
 
400 aa  166  9e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  29.3 
 
 
403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  28.68 
 
 
402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  28.87 
 
 
414 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  29.12 
 
 
405 aa  164  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  30.09 
 
 
410 aa  162  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  33 
 
 
398 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  29.24 
 
 
401 aa  159  6e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  29.54 
 
 
400 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 
402 aa  159  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3708  ABC transporter permease protein  27.9 
 
 
399 aa  159  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  28.57 
 
 
402 aa  159  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  26.92 
 
 
402 aa  157  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  29.26 
 
 
400 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3479  protein of unknown function DUF214  29.12 
 
 
399 aa  156  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  29.53 
 
 
409 aa  155  9e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  26.75 
 
 
387 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  28.61 
 
 
405 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  28.05 
 
 
401 aa  155  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  30.59 
 
 
443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  27.79 
 
 
408 aa  153  5e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  29.2 
 
 
409 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  27.4 
 
 
406 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  28.43 
 
 
397 aa  149  6e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  29.37 
 
 
404 aa  149  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  28.75 
 
 
401 aa  150  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  31.64 
 
 
399 aa  149  8e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  26.54 
 
 
658 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  26.7 
 
 
402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  26.72 
 
 
402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  28.75 
 
 
391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0954  hypothetical protein  27.14 
 
 
399 aa  146  6e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  27.41 
 
 
404 aa  145  9e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  28.18 
 
 
401 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  28.18 
 
 
401 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0585  hypothetical protein  27.78 
 
 
402 aa  144  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000219996  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  27.16 
 
 
404 aa  144  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  28.29 
 
 
409 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  28.29 
 
 
409 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0635  ABC transporter, inner membrane subunit  28.47 
 
 
435 aa  143  5e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000706682  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  29.85 
 
 
387 aa  143  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1676  hypothetical protein  28.84 
 
 
412 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.503245  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  27.34 
 
 
402 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  30.07 
 
 
394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  26.76 
 
 
657 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  28.37 
 
 
405 aa  140  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  27.55 
 
 
406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  26.52 
 
 
643 aa  140  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  25.4 
 
 
431 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  28.39 
 
 
696 aa  139  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  26.83 
 
 
408 aa  139  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  27.49 
 
 
656 aa  138  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  28.31 
 
 
417 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  28.02 
 
 
409 aa  137  2e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  29.38 
 
 
392 aa  138  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  27.14 
 
 
644 aa  138  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  28.87 
 
 
412 aa  137  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3478  protein of unknown function DUF214  26.21 
 
 
402 aa  137  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  29.08 
 
 
405 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  29.27 
 
 
409 aa  137  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  26.52 
 
 
652 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  26.23 
 
 
419 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0746  putative ABC transport system permease protein  30.32 
 
 
403 aa  135  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.489511 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  26.33 
 
 
656 aa  135  9e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  28.21 
 
 
642 aa  135  9e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  27.92 
 
 
406 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  28 
 
 
647 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  26.53 
 
 
641 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  29.7 
 
 
405 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  29.7 
 
 
405 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  27.25 
 
 
394 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  26.28 
 
 
649 aa  134  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  24.46 
 
 
647 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  25.49 
 
 
403 aa  134  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  25.78 
 
 
456 aa  134  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  25.99 
 
 
667 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  28.75 
 
 
413 aa  133  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  26.59 
 
 
650 aa  133  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  26.33 
 
 
407 aa  132  7.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  28.5 
 
 
415 aa  132  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  24.88 
 
 
411 aa  132  9e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>