More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0494 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  788    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  48.77 
 
 		 397 aa  368  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  48.13 
 
 		 381 aa  342  5.999999999999999e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  43.47 
 
 		 386 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  47.38 
 
 		 390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  38.57 
 
 		 397 aa  261  2e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  36.7 
 
 		 396 aa  253  5.000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  37.47 
 
 		 408 aa  246  4e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  31.58 
 
 		 387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1024  hypothetical protein  37.32 
 
 		 402 aa  239  4e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.210647  normal  0.67232 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  35.83 
 
 		 430 aa  208  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  34.76 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2040  hypothetical protein  35.27 
 
 		 410 aa  205  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11269  normal  0.213161 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0755  hypothetical protein  34.95 
 
 		 407 aa  202  9e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.951595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  32.03 
 
 		 413 aa  194  3e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2169  protein of unknown function DUF214  34.43 
 
 		 448 aa  188  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  33.5 
 
 		 379 aa  186  5e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  29.75 
 
 		 367 aa  182  1e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  31.96 
 
 		 397 aa  157  4e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  29.4 
 
 		 397 aa  135  9e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  28.2 
 
 		 403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  30.17 
 
 		 399 aa  133  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  29.76 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  30.68 
 
 		 397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  29.58 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  30.1 
 
 		 397 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  25.48 
 
 		 405 aa  126  8.000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  28.84 
 
 		 401 aa  126  9e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  28.36 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  28.71 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  25.94 
 
 		 402 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  26.48 
 
 		 397 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  27.78 
 
 		 413 aa  125  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  29.22 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  27.86 
 
 		 400 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  27.71 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  28.88 
 
 		 400 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  27.62 
 
 		 406 aa  121  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  28.95 
 
 		 402 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  28.95 
 
 		 402 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  28.57 
 
 		 400 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3708  ABC transporter permease protein  28.88 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  26.45 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  27.23 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  25.12 
 
 		 409 aa  116  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  27.95 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  41.18 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  26.01 
 
 		 407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  26.07 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  27.95 
 
 		 404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  26.88 
 
 		 402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  41.18 
 
 		 443 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  29.24 
 
 		 413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  24.83 
 
 		 421 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  26.34 
 
 		 443 aa  113  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  27.58 
 
 		 409 aa  112  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  28.54 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  26.39 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  26.04 
 
 		 647 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  25.18 
 
 		 410 aa  111  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  28.37 
 
 		 409 aa  110  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  26.37 
 
 		 402 aa  111  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  27.12 
 
 		 649 aa  111  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  25.71 
 
 		 406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  23.28 
 
 		 391 aa  110  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  26.04 
 
 		 408 aa  110  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.28 
 
 		 649 aa  109  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  26.13 
 
 		 412 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  25.17 
 
 		 414 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  27.53 
 
 		 395 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  26.88 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0078  hypothetical protein  27.58 
 
 		 404 aa  109  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000923125  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  27.19 
 
 		 403 aa  109  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  27 
 
 		 687 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  26.43 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  28.54 
 
 		 414 aa  107  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  27 
 
 		 406 aa  107  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  25.06 
 
 		 414 aa  107  5e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0742  protein of unknown function DUF214  27.47 
 
 		 387 aa  107  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0302807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  27.21 
 
 		 663 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  25.28 
 
 		 421 aa  107  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  27.5 
 
 		 681 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  27.5 
 
 		 681 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  25.06 
 
 		 411 aa  106  7e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  25.64 
 
 		 410 aa  106  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  24.88 
 
 		 397 aa  106  9e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1676  hypothetical protein  25.06 
 
 		 412 aa  106  9e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.503245  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  25 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  26.82 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  24.94 
 
 		 653 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  27.29 
 
 		 405 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  28.86 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  29.17 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  28.86 
 
 		 420 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  27.32 
 
 		 663 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  24.52 
 
 		 656 aa  105  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  25.85 
 
 		 408 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  26.68 
 
 		 656 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  26.81 
 
 		 651 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  25.18 
 
 		 415 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>