More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1514 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1514  permease domain protein  100 
 
 		 425 aa  866    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1252  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  42.99 
 
 		 434 aa  346  5e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.888586  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0163  efflux ABC transporter, permease protein  42.4 
 
 		 444 aa  342  1e-92  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  37.44 
 
 		 430 aa  299  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  37.44 
 
 		 430 aa  299  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  39.24 
 
 		 430 aa  298  8e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  37.59 
 
 		 429 aa  294  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  37.35 
 
 		 429 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1869  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.24 
 
 		 418 aa  288  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  36.53 
 
 		 430 aa  266  4e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1167  ABC transporter, permease protein  35.36 
 
 		 430 aa  253  3e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3550  protein of unknown function DUF214  36.15 
 
 		 408 aa  250  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0527  ABC transport permease protein  35.28 
 
 		 414 aa  246  6.999999999999999e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0117375  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2806  hypothetical protein  37.3 
 
 		 429 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.398602  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2021  ABC transporter, permease protein  33.26 
 
 		 429 aa  232  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1652  ABC transporter, permease protein  33.02 
 
 		 429 aa  229  5e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0447  ABC transport permease protein  35.13 
 
 		 426 aa  228  2e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1833  ABC transporter, permease protein  32.56 
 
 		 429 aa  224  2e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2135  lipoprotein ABC transporter permease  36.74 
 
 		 314 aa  206  5e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.142253 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  27.52 
 
 		 393 aa  150  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  25.64 
 
 		 376 aa  142  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  25.64 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  26.33 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  26.33 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3549  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0767  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  25.17 
 
 		 380 aa  120  6e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.016013  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0429  hydrogenase 4 membrane subunit  25.12 
 
 		 380 aa  116  7.999999999999999e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100883  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1515  permease domain protein  23.26 
 
 		 373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000964832  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1868  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.76 
 
 		 370 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1166  ABC transporter, permease protein  25.23 
 
 		 371 aa  99  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0446  integral membrane protein-permease component  22.09 
 
 		 373 aa  99  1e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  23 
 
 		 386 aa  90.9  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  24.11 
 
 		 386 aa  90.9  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1251  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  23.85 
 
 		 407 aa  90.9  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.430375  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  23.88 
 
 		 386 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1653  ABC transporter, permease protein  24.12 
 
 		 372 aa  89  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1834  ABC transporter, permease protein  23.89 
 
 		 372 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  24.54 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  24.04 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  23.04 
 
 		 386 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  24.48 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  22.68 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  23.76 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0528  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  22.2 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.284767  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2022  ABC transporter, permease protein  23.64 
 
 		 372 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.26 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  28.75 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  23.04 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  25.17 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  21.27 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  24.92 
 
 		 397 aa  67  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  25.45 
 
 		 405 aa  67  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  22.79 
 
 		 405 aa  67  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  24.18 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  24.28 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  27.7 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  32.74 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  25.09 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  25.99 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  22.95 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  27.36 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  31.48 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3570  protein of unknown function DUF214  28.11 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  25.25 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  21.14 
 
 		 658 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  29.32 
 
 		 413 aa  63.2  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  23.02 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  23.95 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  31.93 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  22.08 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  22.08 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  32.56 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  26.04 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  24.83 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  26.76 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0164  efflux ABC transporter, permease protein  21.23 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  30.28 
 
 		 696 aa  59.7  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  35.43 
 
 		 421 aa  59.7  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  29.03 
 
 		 454 aa  59.7  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  23.98 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  21.8 
 
 		 397 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  25.2 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  31.72 
 
 		 641 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  32.59 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  31.85 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  34.38 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  25.99 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5199  putative permease of ABC transporter  33.8 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0520248  normal  0.0790722 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  30.72 
 
 		 648 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  30.72 
 
 		 648 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  25.43 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.83 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2105  protein of unknown function DUF214  24.76 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00482864  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3275  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.22 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314483  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  26.49 
 
 		 653 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  24.32 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  25.41 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  26.74 
 
 		 642 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2185  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  26.49 
 
 		 653 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0926  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  26.49 
 
 		 653 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>