More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1340 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 386 aa  775    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  77.2 
 
 		 386 aa  617  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  76.17 
 
 		 386 aa  610  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  75.91 
 
 		 386 aa  591  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  74.87 
 
 		 386 aa  589  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  74.87 
 
 		 386 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  55.96 
 
 		 386 aa  437  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  47.15 
 
 		 385 aa  352  5e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  38.35 
 
 		 386 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  35.01 
 
 		 397 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  32.73 
 
 		 378 aa  212  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  37.92 
 
 		 488 aa  176  6e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  29.87 
 
 		 387 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2105  protein of unknown function DUF214  40.5 
 
 		 462 aa  143  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00482864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0895  hypothetical protein  27.89 
 
 		 387 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0198854  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  24.87 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1894  protein of unknown function DUF214  30.05 
 
 		 385 aa  133  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1869  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.85 
 
 		 418 aa  131  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  26.56 
 
 		 393 aa  113  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3549  protein of unknown function DUF214  26.61 
 
 		 386 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  25.32 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  24.69 
 
 		 397 aa  104  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3550  protein of unknown function DUF214  24.35 
 
 		 408 aa  103  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  25.88 
 
 		 405 aa  100  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  25.79 
 
 		 393 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  25.79 
 
 		 376 aa  100  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  24.3 
 
 		 429 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  23.82 
 
 		 397 aa  97.4  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  24.24 
 
 		 429 aa  97.8  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  25.06 
 
 		 430 aa  96.7  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  25.06 
 
 		 430 aa  96.7  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  26.7 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  23.93 
 
 		 397 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.24 
 
 		 386 aa  94.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  21.95 
 
 		 397 aa  94.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  23.5 
 
 		 397 aa  93.2  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1251  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  24.94 
 
 		 407 aa  93.2  6e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.430375  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  26.78 
 
 		 398 aa  92.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2806  hypothetical protein  26.05 
 
 		 429 aa  92.4  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.398602  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  21.57 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1515  permease domain protein  23.02 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000964832  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1514  permease domain protein  23 
 
 		 425 aa  90.9  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3708  ABC transporter permease protein  27.38 
 
 		 399 aa  91.3  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  27.21 
 
 		 405 aa  90.5  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  23.68 
 
 		 430 aa  90.1  5e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  24.43 
 
 		 386 aa  90.5  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  26.85 
 
 		 407 aa  89.7  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  26.05 
 
 		 401 aa  89.4  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  26.85 
 
 		 379 aa  89.4  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  25.44 
 
 		 379 aa  89.4  9e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1000  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.66 
 
 		 439 aa  89  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.14096 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  23.06 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  27.04 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  21.52 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1652  ABC transporter, permease protein  22.67 
 
 		 429 aa  88.2  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  23.02 
 
 		 397 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.47 
 
 		 437 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  28.75 
 
 		 855 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  26.07 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  29.17 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  23.75 
 
 		 395 aa  87  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  26.09 
 
 		 393 aa  87  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  25.36 
 
 		 406 aa  87  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2021  ABC transporter, permease protein  22.4 
 
 		 429 aa  86.7  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  21.69 
 
 		 397 aa  86.7  6e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  24.45 
 
 		 394 aa  86.3  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  32.44 
 
 		 394 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  26.62 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1833  ABC transporter, permease protein  22.4 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1065  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.04 
 
 		 439 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.123078 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  26.62 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  26.9 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1195  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.79 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  22.46 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0527  ABC transport permease protein  23.39 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0117375  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  25.18 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0721  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.3 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  22.66 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0163  efflux ABC transporter, permease protein  22.8 
 
 		 444 aa  83.6  0.000000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  24.35 
 
 		 394 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  25.18 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  24.82 
 
 		 406 aa  82.8  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  24.63 
 
 		 391 aa  82.8  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  24.24 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0446  integral membrane protein-permease component  22.31 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4530  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.52 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  24.88 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  27.17 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13630  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  29.97 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.422121 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  24.94 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  25.12 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  25.78 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  28.36 
 
 		 852 aa  80.9  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  23.68 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  24.88 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3567  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.77 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.756596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  32.47 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.12 
 
 		 426 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.172929  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  23.61 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.49 
 
 		 422 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.998701  normal  0.300269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>