More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2006 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  100 
 
 
395 aa  781    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0166  hypothetical protein  52.41 
 
 
395 aa  385  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2015  hypothetical protein  44.02 
 
 
411 aa  302  9e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0449562 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1518  permease, putative  33.51 
 
 
403 aa  224  3e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000418137  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1562  hypothetical protein  31.79 
 
 
403 aa  209  8e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00597787  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3474  protein of unknown function DUF214  31.28 
 
 
399 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0625  ABC-type transport system for lysophospholipase L1 biosynthesis permease  28.5 
 
 
405 aa  162  8.000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0260119  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0200  protein of unknown function DUF214  27.41 
 
 
400 aa  160  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0367  efflux ABC transporter, permease protein  29.31 
 
 
403 aa  160  5e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3893  protein of unknown function DUF214  27.55 
 
 
406 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1922  protein of unknown function DUF214  28.88 
 
 
400 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  24.04 
 
 
386 aa  94  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  26.88 
 
 
387 aa  92  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  24.94 
 
 
389 aa  90.9  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  25.2 
 
 
386 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  23.75 
 
 
386 aa  87  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  30.17 
 
 
394 aa  86.3  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  24.11 
 
 
386 aa  86.3  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  23.71 
 
 
386 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  24.63 
 
 
386 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.12 
 
 
386 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  23.22 
 
 
386 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  24.75 
 
 
371 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1894  protein of unknown function DUF214  26.72 
 
 
385 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  28.96 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  35.53 
 
 
452 aa  74.3  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  25.19 
 
 
386 aa  73.6  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.43 
 
 
419 aa  73.2  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.81 
 
 
411 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  25.44 
 
 
378 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  25.38 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.52 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  25.48 
 
 
403 aa  70.1  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  26.93 
 
 
408 aa  69.3  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  36.46 
 
 
855 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  25.55 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  24.13 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01070  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  32.65 
 
 
1207 aa  67.4  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  33.89 
 
 
418 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  23.62 
 
 
415 aa  66.2  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2215  protein of unknown function DUF214  26.69 
 
 
402 aa  65.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.556165  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  24.92 
 
 
397 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  30.08 
 
 
395 aa  65.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.47 
 
 
805 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  24.64 
 
 
406 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  31.87 
 
 
413 aa  65.5  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1663  protein of unknown function DUF214  34.96 
 
 
535 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  22.51 
 
 
391 aa  64.7  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  34.96 
 
 
830 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  24.84 
 
 
414 aa  63.5  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  38.26 
 
 
443 aa  63.5  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  24.35 
 
 
405 aa  63.5  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3520  protein of unknown function DUF214  28.94 
 
 
416 aa  63.5  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0642417  normal  0.207368 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  25.52 
 
 
411 aa  63.5  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  28.98 
 
 
841 aa  63.2  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  25.95 
 
 
453 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  25.38 
 
 
397 aa  63.2  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  37.61 
 
 
417 aa  63.2  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  39.29 
 
 
421 aa  62.8  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  23.18 
 
 
397 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1714  hypothetical protein  24.37 
 
 
395 aa  62.4  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0633161 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  35.07 
 
 
404 aa  62.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  29.94 
 
 
408 aa  62.8  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  21.96 
 
 
410 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2259  protein of unknown function DUF214  28.16 
 
 
379 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241243  normal  0.64676 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  26.55 
 
 
406 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  34.48 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  27.8 
 
 
393 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  24.02 
 
 
408 aa  62  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  35.97 
 
 
416 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  31.28 
 
 
408 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  23.42 
 
 
403 aa  61.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  25.1 
 
 
381 aa  61.2  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0774  hypothetical protein  24.76 
 
 
407 aa  61.6  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.98334  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  22.66 
 
 
401 aa  61.6  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  21.8 
 
 
409 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  27.12 
 
 
1090 aa  60.8  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3734  hypothetical protein  36.59 
 
 
412 aa  60.5  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637974  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5053  hypothetical protein  32.87 
 
 
414 aa  60.5  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.662722  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2581  protein of unknown function DUF214  27.88 
 
 
379 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  24.72 
 
 
408 aa  60.1  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2927  protein of unknown function DUF214  38.26 
 
 
409 aa  60.1  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.58384  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  20.8 
 
 
410 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  22.25 
 
 
398 aa  60.1  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3659  protein of unknown function DUF214  37.19 
 
 
462 aa  60.1  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.410687  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.51 
 
 
437 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  28.22 
 
 
1130 aa  59.7  0.00000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  35.04 
 
 
397 aa  59.7  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  24.61 
 
 
405 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  38.98 
 
 
383 aa  60.1  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  34.48 
 
 
413 aa  59.7  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3777  hypothetical protein  24.58 
 
 
383 aa  59.7  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  26.72 
 
 
379 aa  58.9  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  24.61 
 
 
405 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0218  protein of unknown function DUF214  25.47 
 
 
379 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181881 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  25.82 
 
 
417 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.11 
 
 
413 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0895  hypothetical protein  24.5 
 
 
387 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0198854  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2994  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  28.22 
 
 
417 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  21.41 
 
 
488 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>