289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1833 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1833  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 429 aa  858    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2021  ABC transporter, permease protein  98.37 
 
 		 429 aa  843    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1652  ABC transporter, permease protein  98.83 
 
 		 429 aa  847    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1167  ABC transporter, permease protein  57.14 
 
 		 430 aa  460  9.999999999999999e-129  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  52.22 
 
 		 430 aa  422  1e-117  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  52.09 
 
 		 430 aa  421  1e-117  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0527  ABC transport permease protein  51.63 
 
 		 414 aa  394  1e-108  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0117375  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0447  ABC transport permease protein  49.28 
 
 		 426 aa  354  2e-96  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  35.86 
 
 		 430 aa  282  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  35.86 
 
 		 430 aa  282  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  34.33 
 
 		 429 aa  278  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  34.56 
 
 		 429 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2806  hypothetical protein  36.51 
 
 		 429 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.398602  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1869  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.78 
 
 		 418 aa  246  8e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1514  permease domain protein  32.56 
 
 		 425 aa  224  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1252  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  29.89 
 
 		 434 aa  202  9.999999999999999e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.888586  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0163  efflux ABC transporter, permease protein  29.89 
 
 		 444 aa  195  2e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2135  lipoprotein ABC transporter permease  34.95 
 
 		 314 aa  193  6e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.142253 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3550  protein of unknown function DUF214  27.91 
 
 		 408 aa  190  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0446  integral membrane protein-permease component  26.26 
 
 		 373 aa  129  7.000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1653  ABC transporter, permease protein  28.07 
 
 		 372 aa  120  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1834  ABC transporter, permease protein  27.83 
 
 		 372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  22.71 
 
 		 393 aa  111  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  22.71 
 
 		 376 aa  111  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  21.53 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2022  ABC transporter, permease protein  28.3 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0429  hydrogenase 4 membrane subunit  24.47 
 
 		 380 aa  103  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100883  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0767  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  23.32 
 
 		 380 aa  103  6e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.016013  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  22.4 
 
 		 379 aa  99.8  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1166  ABC transporter, permease protein  25.69 
 
 		 371 aa  97.4  4e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  21.53 
 
 		 379 aa  96.7  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0528  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  25.65 
 
 		 376 aa  94.7  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.284767  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  24.17 
 
 		 386 aa  94.4  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3549  protein of unknown function DUF214  21.96 
 
 		 386 aa  93.6  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  22.62 
 
 		 386 aa  91.7  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  23.61 
 
 		 386 aa  90.1  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1515  permease domain protein  22.17 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000964832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  23.22 
 
 		 386 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  24.89 
 
 		 397 aa  87.4  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  23.61 
 
 		 386 aa  86.7  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  22.4 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  23.29 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  23.4 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  23.17 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  20.91 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1251  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  19.55 
 
 		 407 aa  70.1  0.00000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.430375  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2105  protein of unknown function DUF214  21.2 
 
 		 462 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00482864  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  20.17 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  22.14 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  20.41 
 
 		 385 aa  67  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1868  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25 
 
 		 370 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  22.5 
 
 		 397 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  22.57 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  22.09 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  21.68 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  22.5 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  22.02 
 
 		 656 aa  62.4  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  22.3 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  22.69 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  20.97 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  24.32 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  22.61 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  24.03 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  22.95 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  21.54 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  21.76 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  21.76 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  22.47 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  29.3 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  21.14 
 
 		 443 aa  56.6  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  32.17 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  30 
 
 		 488 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  21.59 
 
 		 657 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  23.65 
 
 		 431 aa  54.3  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  29.35 
 
 		 467 aa  54.3  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  26.36 
 
 		 852 aa  54.3  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  23 
 
 		 409 aa  53.5  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  24.07 
 
 		 856 aa  53.5  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  24.63 
 
 		 864 aa  53.5  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  23.18 
 
 		 648 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  23.02 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  31.62 
 
 		 653 aa  52.8  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  18.82 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  23.14 
 
 		 854 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  21.9 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  22.73 
 
 		 648 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  20.37 
 
 		 648 aa  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3165  protein of unknown function DUF214  25.23 
 
 		 422 aa  52.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.296163  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  22.73 
 
 		 648 aa  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  23.13 
 
 		 856 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  22.73 
 
 		 648 aa  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  22.73 
 
 		 648 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2729  protein of unknown function DUF214  21.67 
 
 		 796 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  22.73 
 
 		 648 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  23.67 
 
 		 858 aa  51.6  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  25.72 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  21.36 
 
 		 863 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  30.77 
 
 		 415 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  20.54 
 
 		 401 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0490  protein of unknown function DUF214  33 
 
 		 443 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>