More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0192 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0829  hypothetical protein  51.83 
 
 		 871 aa  766    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270904  normal  0.305315 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4181  hypothetical protein  51.07 
 
 		 848 aa  748    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.821525  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0087  ABC transporter, permease protein  50.41 
 
 		 849 aa  793    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2226  protein of unknown function DUF214  54.83 
 
 		 862 aa  758    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0961704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0387  putative ABC transporter, permease protein  74.29 
 
 		 856 aa  1200    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0414  hypothetical protein  75.39 
 
 		 851 aa  1188    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.336355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1778  protein of unknown function DUF214  55.01 
 
 		 863 aa  830    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2269  hypothetical protein  54.75 
 
 		 892 aa  769    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1016  hypothetical protein  55.15 
 
 		 858 aa  830    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331004  normal  0.145704 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1394  hypothetical protein  51.65 
 
 		 858 aa  774    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.472262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5469  hypothetical protein  55.88 
 
 		 862 aa  853    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18562  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0286  hypothetical protein  85.11 
 
 		 860 aa  1340    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463422  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  77.29 
 
 		 851 aa  1243    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2544  protein of unknown function DUF214  55.1 
 
 		 860 aa  778    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519388  normal  0.0357395 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4056  protein of unknown function DUF214  51.65 
 
 		 847 aa  780    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0099  hypothetical protein  51.12 
 
 		 849 aa  800    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  85.63 
 
 		 864 aa  1345    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0550  hypothetical protein  76.24 
 
 		 858 aa  1186    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3352  hypothetical protein  51.53 
 
 		 869 aa  766    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1757  hypothetical protein  52.98 
 
 		 851 aa  775    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0085  ABC transporter, permease protein  50.41 
 
 		 849 aa  759    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3075  hypothetical protein  52.26 
 
 		 863 aa  753    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1913  protein of unknown function DUF214  52.32 
 
 		 882 aa  732    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.549699 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 856 aa  1663    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3733  protein of unknown function DUF214  51.42 
 
 		 847 aa  761    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2679  putative ABC transporter permease  40.8 
 
 		 842 aa  538  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0339343  normal  0.926867 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3653  hypothetical protein  44.67 
 
 		 847 aa  535  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1671  protein of unknown function DUF214  36.92 
 
 		 844 aa  520  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0107522  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0698  hypothetical protein  39.64 
 
 		 833 aa  515  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2222  protein of unknown function DUF214  36.05 
 
 		 935 aa  500  1e-140  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3603  eflux ABC transporter inner membrane protein  40.17 
 
 		 835 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.217562  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2271  hypothetical protein  39.46 
 
 		 842 aa  490  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276468  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0124  hypothetical protein  42.57 
 
 		 831 aa  491  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0544905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3288  hypothetical protein  39.81 
 
 		 835 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3957  hypothetical protein  39.5 
 
 		 835 aa  478  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3687  hypothetical protein  40.71 
 
 		 840 aa  477  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0411  hypothetical protein  37.87 
 
 		 852 aa  475  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.773219  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1150  hypothetical protein  35.71 
 
 		 847 aa  405  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1929  protein of unknown function DUF214  36.23 
 
 		 864 aa  385  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316143  normal  0.35107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1276  hypothetical protein  37.13 
 
 		 838 aa  366  1e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53995  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6498  protein of unknown function DUF214  26.96 
 
 		 835 aa  249  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  27.29 
 
 		 835 aa  249  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  28.68 
 
 		 841 aa  239  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2108  protein of unknown function DUF214  24.97 
 
 		 832 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  27.05 
 
 		 832 aa  232  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  26.81 
 
 		 829 aa  231  4e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1597  protein of unknown function DUF214  24.83 
 
 		 861 aa  229  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  27.06 
 
 		 835 aa  229  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  30.1 
 
 		 826 aa  227  7e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2110  protein of unknown function DUF214  25.73 
 
 		 833 aa  226  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0542  protein of unknown function DUF214  28.06 
 
 		 843 aa  219  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  27.98 
 
 		 840 aa  219  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  30.69 
 
 		 874 aa  217  9e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 		 844 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  27.2 
 
 		 842 aa  211  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  26.92 
 
 		 869 aa  209  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3019  efflux ABC transporter, permease protein  27.51 
 
 		 809 aa  208  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00602267  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1273  efflux ABC transporter permease  27.86 
 
 		 809 aa  207  5e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.924579 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3157  hypothetical protein  27.33 
 
 		 809 aa  206  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.513308  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2414  hypothetical protein  27.47 
 
 		 832 aa  205  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459172  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5607  hypothetical protein  29.79 
 
 		 871 aa  205  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3255  hypothetical protein  29.95 
 
 		 839 aa  205  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0335123  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  28.68 
 
 		 871 aa  205  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  25.63 
 
 		 836 aa  204  6e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2785  protein of unknown function DUF214  28.97 
 
 		 857 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.482364  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1159  hypothetical protein  26.65 
 
 		 810 aa  201  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184343 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  29.1 
 
 		 856 aa  201  5e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  26.66 
 
 		 844 aa  201  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27140  hypothetical protein  28.82 
 
 		 830 aa  200  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  27.55 
 
 		 870 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  28.86 
 
 		 863 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  26.26 
 
 		 804 aa  199  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1056  protein of unknown function DUF214  28.24 
 
 		 810 aa  198  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3458  hypothetical protein  28.85 
 
 		 857 aa  199  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.840481  normal  0.470717 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  25.88 
 
 		 843 aa  198  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  27.97 
 
 		 831 aa  197  9e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1668  hypothetical protein  28.64 
 
 		 871 aa  197  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2280  hypothetical protein  28.64 
 
 		 871 aa  197  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  28.18 
 
 		 858 aa  196  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  26.49 
 
 		 838 aa  196  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0600  efflux ABC transporter, permease protein  26.11 
 
 		 804 aa  195  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.77559 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  25.46 
 
 		 840 aa  194  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2296  hypothetical protein  29.07 
 
 		 833 aa  194  9e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0545  efflux ABC transporter, permease protein  26.11 
 
 		 804 aa  193  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0431  efflux ABC transporter, permease protein  25.93 
 
 		 805 aa  192  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0535  efflux ABC transporter, permease protein  25.99 
 
 		 804 aa  192  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3191  protein of unknown function DUF214  25.48 
 
 		 809 aa  192  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0495543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2196  hypothetical protein  28.64 
 
 		 834 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1124  hypothetical protein  25.66 
 
 		 809 aa  192  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.101154  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2115  ABC efflux transporter, fused inner membrane subunits  24.33 
 
 		 882 aa  192  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.675122  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00447  predicted inner membrane protein  25.99 
 
 		 804 aa  191  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3114  protein of unknown function DUF214  25.99 
 
 		 804 aa  191  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00452  hypothetical protein  25.99 
 
 		 804 aa  191  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  25.51 
 
 		 827 aa  191  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1029  hypothetical protein  28.85 
 
 		 869 aa  191  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0575  efflux ABC transporter, permease protein  25.87 
 
 		 804 aa  189  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0562  efflux ABC transporter permease protein  26.45 
 
 		 804 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3120  hypothetical protein  25.87 
 
 		 804 aa  188  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749019 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1046  hypothetical protein  25.42 
 
 		 828 aa  188  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  26.42 
 
 		 838 aa  188  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>