205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3352 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0829  hypothetical protein  47.22 
 
 		 871 aa  677    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270904  normal  0.305315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2269  hypothetical protein  50.88 
 
 		 892 aa  671    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_004310  BR0087  ABC transporter, permease protein  65.36 
 
 		 849 aa  1058    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1394  hypothetical protein  49.11 
 
 		 858 aa  731    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.472262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0414  hypothetical protein  48.52 
 
 		 851 aa  711    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.336355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0286  hypothetical protein  50.3 
 
 		 860 aa  722    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463422  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  49.76 
 
 		 851 aa  768    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  50.35 
 
 		 864 aa  748    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0550  hypothetical protein  49.28 
 
 		 858 aa  731    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3352  hypothetical protein  100 
 
 		 869 aa  1699    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2544  protein of unknown function DUF214  51.23 
 
 		 860 aa  680    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519388  normal  0.0357395 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4056  protein of unknown function DUF214  64.37 
 
 		 847 aa  1018    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2226  protein of unknown function DUF214  50.36 
 
 		 862 aa  667    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0961704 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  51.53 
 
 		 856 aa  805    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4181  hypothetical protein  62.26 
 
 		 848 aa  969    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.821525  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1016  hypothetical protein  50.18 
 
 		 858 aa  719    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331004  normal  0.145704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0387  putative ABC transporter, permease protein  49.32 
 
 		 856 aa  724    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0085  ABC transporter, permease protein  65.36 
 
 		 849 aa  1025    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3733  protein of unknown function DUF214  64.61 
 
 		 847 aa  1002    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1757  hypothetical protein  50 
 
 		 851 aa  648    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3075  hypothetical protein  64.45 
 
 		 863 aa  976    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5469  hypothetical protein  50.64 
 
 		 862 aa  756    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18562  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1778  protein of unknown function DUF214  52.04 
 
 		 863 aa  758    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0099  hypothetical protein  64.15 
 
 		 849 aa  1053    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1913  protein of unknown function DUF214  47.96 
 
 		 882 aa  633  1e-180  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.549699 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2679  putative ABC transporter permease  42.64 
 
 		 842 aa  550  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0339343  normal  0.926867 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3653  hypothetical protein  43.92 
 
 		 847 aa  549  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1671  protein of unknown function DUF214  38.72 
 
 		 844 aa  551  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0107522  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0124  hypothetical protein  42 
 
 		 831 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0544905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0698  hypothetical protein  41.07 
 
 		 833 aa  511  1e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2271  hypothetical protein  39.84 
 
 		 842 aa  507  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276468  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3603  eflux ABC transporter inner membrane protein  42.37 
 
 		 835 aa  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.217562  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3288  hypothetical protein  42.24 
 
 		 835 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3687  hypothetical protein  40.26 
 
 		 840 aa  481  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3957  hypothetical protein  40.97 
 
 		 835 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0411  hypothetical protein  37.28 
 
 		 852 aa  477  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.773219  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2222  protein of unknown function DUF214  33.01 
 
 		 935 aa  438  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1929  protein of unknown function DUF214  37.26 
 
 		 864 aa  410  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316143  normal  0.35107 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1150  hypothetical protein  37.53 
 
 		 847 aa  407  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1276  hypothetical protein  36.63 
 
 		 838 aa  349  1e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53995  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  31.55 
 
 		 841 aa  270  7e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0542  protein of unknown function DUF214  29.47 
 
 		 843 aa  252  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  29.17 
 
 		 835 aa  251  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2108  protein of unknown function DUF214  26.59 
 
 		 832 aa  241  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  28.99 
 
 		 838 aa  240  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1159  hypothetical protein  30.05 
 
 		 810 aa  239  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184343 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6498  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 		 835 aa  238  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  29.67 
 
 		 831 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1597  protein of unknown function DUF214  25.86 
 
 		 861 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  28.94 
 
 		 804 aa  234  4.0000000000000004e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  28.7 
 
 		 838 aa  234  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  26.4 
 
 		 829 aa  232  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3191  protein of unknown function DUF214  27.61 
 
 		 809 aa  229  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0495543  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  26.4 
 
 		 836 aa  228  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1124  hypothetical protein  27.16 
 
 		 809 aa  228  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.101154  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2110  protein of unknown function DUF214  27.83 
 
 		 833 aa  228  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1273  efflux ABC transporter permease  27.61 
 
 		 809 aa  224  4e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.924579 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1918  hypothetical protein  27.6 
 
 		 835 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695603  hitchhiker  0.000000000000882803 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2414  hypothetical protein  27.7 
 
 		 832 aa  223  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459172  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2316  hypothetical protein  27.57 
 
 		 832 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000697167 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3019  efflux ABC transporter, permease protein  27.93 
 
 		 809 aa  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00602267  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3157  hypothetical protein  28.27 
 
 		 809 aa  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.513308  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3453  hypothetical protein  27.72 
 
 		 832 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000113684 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  25.89 
 
 		 842 aa  221  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0535  efflux ABC transporter, permease protein  28.3 
 
 		 804 aa  221  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0616  efflux ABC transporter permease  29.13 
 
 		 804 aa  221  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3114  protein of unknown function DUF214  28.18 
 
 		 804 aa  220  8.999999999999998e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0575  efflux ABC transporter, permease protein  28.18 
 
 		 804 aa  220  8.999999999999998e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1056  protein of unknown function DUF214  29.21 
 
 		 810 aa  219  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  26.18 
 
 		 832 aa  219  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0557  efflux ABC transporter permease  28.96 
 
 		 804 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0600  efflux ABC transporter, permease protein  28.14 
 
 		 804 aa  218  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.77559 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0545  efflux ABC transporter, permease protein  28.07 
 
 		 804 aa  218  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0572  efflux ABC transporter permease  28.84 
 
 		 804 aa  218  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.868504 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0562  efflux ABC transporter permease protein  28.72 
 
 		 804 aa  217  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  25.98 
 
 		 840 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0555  efflux ABC transporter, permease protein  28.84 
 
 		 804 aa  216  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3120  hypothetical protein  27.9 
 
 		 804 aa  215  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749019 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  27.77 
 
 		 835 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2296  hypothetical protein  29.14 
 
 		 833 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27140  hypothetical protein  28.89 
 
 		 830 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1046  hypothetical protein  28.54 
 
 		 828 aa  214  5.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  29.47 
 
 		 840 aa  214  7e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0431  efflux ABC transporter, permease protein  27.88 
 
 		 805 aa  214  7.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00447  predicted inner membrane protein  27.8 
 
 		 804 aa  212  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00452  hypothetical protein  27.8 
 
 		 804 aa  212  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1399  ABC transporter, permease protein  25.47 
 
 		 830 aa  211  6e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4016  hypothetical protein  27.47 
 
 		 834 aa  210  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401086  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3003  protein of unknown function DUF214  28.61 
 
 		 810 aa  209  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.558274  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0287  predicted permease  24.08 
 
 		 815 aa  206  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  26.99 
 
 		 843 aa  205  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  26.89 
 
 		 844 aa  203  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23050  hypothetical protein  28.64 
 
 		 833 aa  200  7.999999999999999e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.636342  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2957  hypothetical protein  25.12 
 
 		 810 aa  195  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133946  normal  0.10767 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  27.04 
 
 		 869 aa  193  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  29.84 
 
 		 826 aa  193  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2896  hypothetical protein  25.06 
 
 		 821 aa  192  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431502 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  26.6 
 
 		 844 aa  191  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1758  hypothetical protein  26.93 
 
 		 835 aa  190  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293557  hitchhiker  0.00000000277599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2015  hypothetical protein  28.93 
 
 		 844 aa  186  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>