294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2110 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2414  hypothetical protein  56.45 
 
 		 832 aa  854    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459172  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2110  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 833 aa  1665    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2108  protein of unknown function DUF214  92.68 
 
 		 832 aa  1515    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0073  hypothetical protein  28.03 
 
 		 884 aa  311  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2436  hypothetical protein  27.59 
 
 		 870 aa  289  1e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2115  ABC efflux transporter, fused inner membrane subunits  27.5 
 
 		 882 aa  288  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.675122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  30 
 
 		 844 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  28 
 
 		 841 aa  267  8e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  30.16 
 
 		 870 aa  263  8e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  29.66 
 
 		 861 aa  260  8e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  30.43 
 
 		 860 aa  259  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  28.08 
 
 		 843 aa  255  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  29.08 
 
 		 844 aa  254  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6498  protein of unknown function DUF214  27.41 
 
 		 835 aa  253  8.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  29.56 
 
 		 871 aa  252  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  27.11 
 
 		 832 aa  252  3e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0387  putative ABC transporter, permease protein  26.16 
 
 		 856 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1668  hypothetical protein  29.54 
 
 		 871 aa  248  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2280  hypothetical protein  29.54 
 
 		 871 aa  248  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  27.36 
 
 		 829 aa  244  5e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2318  hypothetical protein  28.84 
 
 		 871 aa  244  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1671  protein of unknown function DUF214  27.68 
 
 		 844 aa  243  7.999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0107522  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1597  protein of unknown function DUF214  25.88 
 
 		 861 aa  243  7.999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  29.04 
 
 		 863 aa  242  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2196  hypothetical protein  28.48 
 
 		 834 aa  242  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3653  hypothetical protein  28.94 
 
 		 847 aa  238  5.0000000000000005e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5607  hypothetical protein  28.99 
 
 		 871 aa  235  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1394  hypothetical protein  26.33 
 
 		 858 aa  234  5e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.472262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0286  hypothetical protein  26.38 
 
 		 860 aa  234  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463422  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2222  protein of unknown function DUF214  24.87 
 
 		 935 aa  233  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4056  protein of unknown function DUF214  26.81 
 
 		 847 aa  230  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  26.09 
 
 		 864 aa  230  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0087  ABC transporter, permease protein  26.83 
 
 		 849 aa  229  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  25.41 
 
 		 856 aa  228  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3733  protein of unknown function DUF214  26 
 
 		 847 aa  227  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  26.08 
 
 		 851 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0099  hypothetical protein  26.78 
 
 		 849 aa  225  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1029  hypothetical protein  28.5 
 
 		 869 aa  225  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  26.52 
 
 		 840 aa  224  7e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  29.31 
 
 		 831 aa  223  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  27.21 
 
 		 869 aa  222  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0085  ABC transporter, permease protein  26.83 
 
 		 849 aa  221  5e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2679  putative ABC transporter permease  26.38 
 
 		 842 aa  221  6e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0339343  normal  0.926867 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0829  hypothetical protein  25.65 
 
 		 871 aa  220  7.999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270904  normal  0.305315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5469  hypothetical protein  26.27 
 
 		 862 aa  219  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18562  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0411  hypothetical protein  25.52 
 
 		 852 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.773219  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1259  efflux ABC transporter, permease protein  29.37 
 
 		 880 aa  218  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356208  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1251  efflux ABC transporter, permease protein  29.26 
 
 		 883 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  27.49 
 
 		 840 aa  217  8e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0542  protein of unknown function DUF214  28.24 
 
 		 843 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1400  putative permease  29.37 
 
 		 1108 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  26.32 
 
 		 835 aa  215  2.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2785  protein of unknown function DUF214  26.36 
 
 		 857 aa  214  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.482364  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1778  protein of unknown function DUF214  26.08 
 
 		 863 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1016  hypothetical protein  25.38 
 
 		 858 aa  213  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331004  normal  0.145704 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0898  hypothetical protein  26.83 
 
 		 851 aa  213  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3075  hypothetical protein  25.58 
 
 		 863 aa  211  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2271  hypothetical protein  26.32 
 
 		 842 aa  211  6e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276468  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3458  hypothetical protein  26.1 
 
 		 857 aa  209  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.840481  normal  0.470717 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  25.89 
 
 		 858 aa  209  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  26.97 
 
 		 838 aa  209  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  27.6 
 
 		 856 aa  209  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  26.02 
 
 		 835 aa  209  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4056  protein of unknown function DUF214  25.52 
 
 		 838 aa  208  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  28.66 
 
 		 874 aa  207  7e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3957  hypothetical protein  27.52 
 
 		 835 aa  207  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3824  hypothetical protein  26.03 
 
 		 843 aa  207  9e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  26.53 
 
 		 838 aa  206  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3352  hypothetical protein  26.89 
 
 		 869 aa  205  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2015  hypothetical protein  25.55 
 
 		 844 aa  204  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0287  predicted permease  26.01 
 
 		 815 aa  203  9e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4181  hypothetical protein  25.12 
 
 		 848 aa  203  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.821525  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2618  hypothetical protein  27.76 
 
 		 842 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.855589  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1757  hypothetical protein  26.95 
 
 		 851 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1399  ABC transporter, permease protein  24.56 
 
 		 830 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1918  hypothetical protein  26.32 
 
 		 835 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695603  hitchhiker  0.000000000000882803 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  24.84 
 
 		 842 aa  197  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0550  hypothetical protein  26.59 
 
 		 858 aa  197  7e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0414  hypothetical protein  25.09 
 
 		 851 aa  197  8.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.336355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3446  ABC transporter, permease protein, putative  25.94 
 
 		 828 aa  197  8.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000339618  hitchhiker  0.000208184 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23050  hypothetical protein  27.55 
 
 		 833 aa  196  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.636342  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2209  hypothetical protein  23.91 
 
 		 819 aa  194  6e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.795386  normal  0.224518 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3019  efflux ABC transporter, permease protein  25.65 
 
 		 809 aa  194  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00602267  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0533  hypothetical protein  25.84 
 
 		 840 aa  193  9e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3157  hypothetical protein  25.65 
 
 		 809 aa  193  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.513308  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3603  eflux ABC transporter inner membrane protein  26.92 
 
 		 835 aa  193  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.217562  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1273  efflux ABC transporter permease  25.52 
 
 		 809 aa  192  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.924579 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  25.15 
 
 		 826 aa  192  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3288  hypothetical protein  26.43 
 
 		 835 aa  191  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3255  hypothetical protein  25.45 
 
 		 839 aa  189  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0335123  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4016  hypothetical protein  26.5 
 
 		 834 aa  187  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401086  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2316  hypothetical protein  25.53 
 
 		 832 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000697167 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27140  hypothetical protein  27.13 
 
 		 830 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3453  hypothetical protein  25.53 
 
 		 832 aa  185  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000113684 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0944  hypothetical protein  25.61 
 
 		 853 aa  184  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.69332 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  26.87 
 
 		 840 aa  184  5.0000000000000004e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  24.47 
 
 		 836 aa  184  8.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2957  hypothetical protein  26.17 
 
 		 810 aa  181  4.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133946  normal  0.10767 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  24.54 
 
 		 804 aa  179  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1159  hypothetical protein  26.43 
 
 		 810 aa  179  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>