168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_2115 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_2115  ABC efflux transporter, fused inner membrane subunits  100 
 
 		 882 aa  1759    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.675122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2436  hypothetical protein  95.63 
 
 		 870 aa  1595    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0073  hypothetical protein  58.72 
 
 		 884 aa  1012    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2108  protein of unknown function DUF214  28.09 
 
 		 832 aa  313  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2414  hypothetical protein  28.7 
 
 		 832 aa  299  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459172  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2110  protein of unknown function DUF214  27.94 
 
 		 833 aa  298  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  26.92 
 
 		 832 aa  207  6e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  27.91 
 
 		 870 aa  200  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  25.12 
 
 		 804 aa  196  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  22.81 
 
 		 841 aa  194  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  24.85 
 
 		 856 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  26.81 
 
 		 826 aa  187  6e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  26.86 
 
 		 861 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0829  hypothetical protein  24.85 
 
 		 871 aa  182  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270904  normal  0.305315 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3120  hypothetical protein  24.88 
 
 		 804 aa  181  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749019 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3114  protein of unknown function DUF214  24.88 
 
 		 804 aa  181  5.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0575  efflux ABC transporter, permease protein  24.88 
 
 		 804 aa  181  7e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  27.01 
 
 		 827 aa  181  8e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  24.91 
 
 		 829 aa  180  9e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0545  efflux ABC transporter, permease protein  24.88 
 
 		 804 aa  180  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00447  predicted inner membrane protein  24.91 
 
 		 804 aa  179  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00452  hypothetical protein  24.91 
 
 		 804 aa  179  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0431  efflux ABC transporter, permease protein  24.8 
 
 		 805 aa  179  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1029  hypothetical protein  28.43 
 
 		 869 aa  177  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0600  efflux ABC transporter, permease protein  24.76 
 
 		 804 aa  177  8e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.77559 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0535  efflux ABC transporter, permease protein  24.65 
 
 		 804 aa  177  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3191  protein of unknown function DUF214  25.83 
 
 		 809 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0495543  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0287  predicted permease  23.29 
 
 		 815 aa  176  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  27.73 
 
 		 860 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  24.5 
 
 		 864 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1056  protein of unknown function DUF214  24.97 
 
 		 810 aa  174  6.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  25.93 
 
 		 835 aa  173  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  22.55 
 
 		 836 aa  172  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1597  protein of unknown function DUF214  23.15 
 
 		 861 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1159  hypothetical protein  25.24 
 
 		 810 aa  172  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184343 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  25.63 
 
 		 831 aa  172  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1251  efflux ABC transporter, permease protein  28.28 
 
 		 883 aa  172  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0387  putative ABC transporter, permease protein  23.28 
 
 		 856 aa  172  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  25.33 
 
 		 844 aa  171  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0550  hypothetical protein  23.86 
 
 		 858 aa  171  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1259  efflux ABC transporter, permease protein  28.28 
 
 		 880 aa  171  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356208  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  27.11 
 
 		 863 aa  171  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1668  hypothetical protein  27.91 
 
 		 871 aa  171  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2280  hypothetical protein  27.91 
 
 		 871 aa  171  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1124  hypothetical protein  24.7 
 
 		 809 aa  170  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.101154  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  26.66 
 
 		 871 aa  170  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  24.13 
 
 		 835 aa  169  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2957  hypothetical protein  23.57 
 
 		 810 aa  169  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133946  normal  0.10767 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  25.42 
 
 		 843 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3157  hypothetical protein  24.72 
 
 		 809 aa  169  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.513308  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3019  efflux ABC transporter, permease protein  24.72 
 
 		 809 aa  168  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00602267  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1273  efflux ABC transporter permease  24.94 
 
 		 809 aa  168  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.924579 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3446  ABC transporter, permease protein, putative  25.73 
 
 		 828 aa  168  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000339618  hitchhiker  0.000208184 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4181  hypothetical protein  26.64 
 
 		 848 aa  167  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.821525  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1400  putative permease  28.28 
 
 		 1108 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  23.49 
 
 		 842 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2196  hypothetical protein  28.12 
 
 		 834 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  25.09 
 
 		 844 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  24.58 
 
 		 851 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0286  hypothetical protein  24.32 
 
 		 860 aa  165  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463422  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0557  efflux ABC transporter permease  24.72 
 
 		 804 aa  165  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2318  hypothetical protein  28.36 
 
 		 871 aa  166  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0562  efflux ABC transporter permease protein  24.73 
 
 		 804 aa  164  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0555  efflux ABC transporter, permease protein  24.73 
 
 		 804 aa  164  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  25 
 
 		 840 aa  164  8.000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3653  hypothetical protein  24.66 
 
 		 847 aa  163  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0616  efflux ABC transporter permease  24.73 
 
 		 804 aa  163  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1394  hypothetical protein  22.41 
 
 		 858 aa  163  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.472262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0572  efflux ABC transporter permease  24.6 
 
 		 804 aa  162  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.868504 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2209  hypothetical protein  24.8 
 
 		 819 aa  160  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.795386  normal  0.224518 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0542  protein of unknown function DUF214  25.45 
 
 		 843 aa  159  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1671  protein of unknown function DUF214  21.89 
 
 		 844 aa  159  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0107522  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1016  hypothetical protein  23.59 
 
 		 858 aa  158  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331004  normal  0.145704 
 
 
-
 
NC_004310  BR0087  ABC transporter, permease protein  23.98 
 
 		 849 aa  157  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3733  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 847 aa  157  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0722  hypothetical protein  24.12 
 
 		 815 aa  157  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000480127  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2896  hypothetical protein  23.66 
 
 		 821 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431502 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000166  predicted ABC-type transport system permease component  23.51 
 
 		 818 aa  155  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05800  hypothetical protein  23.57 
 
 		 818 aa  153  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0099  hypothetical protein  23.4 
 
 		 849 aa  153  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4056  protein of unknown function DUF214  25.44 
 
 		 847 aa  152  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4056  protein of unknown function DUF214  25.86 
 
 		 838 aa  152  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5607  hypothetical protein  26.72 
 
 		 871 aa  152  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6498  protein of unknown function DUF214  23.81 
 
 		 835 aa  151  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0124  hypothetical protein  24.32 
 
 		 831 aa  151  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0544905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0414  hypothetical protein  24.02 
 
 		 851 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.336355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  25.34 
 
 		 874 aa  148  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2679  putative ABC transporter permease  23.88 
 
 		 842 aa  147  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0339343  normal  0.926867 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0008  protein of unknown function DUF214  26.71 
 
 		 836 aa  147  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1046  hypothetical protein  24.36 
 
 		 828 aa  146  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0411  hypothetical protein  22.78 
 
 		 852 aa  145  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.773219  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0085  ABC transporter, permease protein  23.86 
 
 		 849 aa  144  8e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  23.73 
 
 		 858 aa  143  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1757  hypothetical protein  22.81 
 
 		 851 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2271  hypothetical protein  23.72 
 
 		 842 aa  142  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276468  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2222  protein of unknown function DUF214  23.01 
 
 		 935 aa  141  6e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1698  hypothetical protein  22.94 
 
 		 823 aa  140  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.405062 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3824  hypothetical protein  24.65 
 
 		 843 aa  139  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2401  hypothetical protein  23.78 
 
 		 816 aa  138  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.678425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1662  hypothetical protein  23.51 
 
 		 817 aa  138  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000552359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>