174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2401 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2783  hypothetical protein  76.98 
 
 		 837 aa  1192    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.667381  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2926  ABC transporter, permease, putative  78.25 
 
 		 835 aa  1169    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1680  protein of unknown function DUF214  76.88 
 
 		 842 aa  1199    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.432743  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1662  hypothetical protein  77.91 
 
 		 817 aa  1171    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000552359  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2896  hypothetical protein  79.46 
 
 		 821 aa  1250    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431502 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2366  hypothetical protein  74.3 
 
 		 827 aa  1139    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.197088  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1480  hypothetical protein  78.43 
 
 		 833 aa  1199    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1545  hypothetical protein  78.55 
 
 		 833 aa  1201    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2566  hypothetical protein  76 
 
 		 827 aa  1158    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1539  hypothetical protein  78.43 
 
 		 833 aa  1199    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274903 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1487  ABC transporter, permease, putative  66.92 
 
 		 818 aa  1043    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2686  hypothetical protein  76.64 
 
 		 842 aa  1195    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2401  hypothetical protein  100 
 
 		 816 aa  1633    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.678425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2390  hypothetical protein  77.29 
 
 		 831 aa  1160    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.652609  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2707  hypothetical protein  76.83 
 
 		 836 aa  1192    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1698  hypothetical protein  76.74 
 
 		 823 aa  1206    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.405062 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  40.57 
 
 		 840 aa  631  1e-179  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  40.58 
 
 		 842 aa  616  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  39.16 
 
 		 836 aa  577  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  36.65 
 
 		 804 aa  481  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00447  predicted inner membrane protein  35.43 
 
 		 804 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3114  protein of unknown function DUF214  35.43 
 
 		 804 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0600  efflux ABC transporter, permease protein  35.55 
 
 		 804 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.77559 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0545  efflux ABC transporter, permease protein  35.68 
 
 		 804 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00452  hypothetical protein  35.43 
 
 		 804 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3120  hypothetical protein  35.43 
 
 		 804 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749019 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0575  efflux ABC transporter, permease protein  35.43 
 
 		 804 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0535  efflux ABC transporter, permease protein  35.43 
 
 		 804 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0557  efflux ABC transporter permease  36.15 
 
 		 804 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0616  efflux ABC transporter permease  36.02 
 
 		 804 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0572  efflux ABC transporter permease  36.15 
 
 		 804 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.868504 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0555  efflux ABC transporter, permease protein  36.15 
 
 		 804 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0431  efflux ABC transporter, permease protein  35.42 
 
 		 805 aa  452  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0562  efflux ABC transporter permease protein  36.15 
 
 		 804 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3157  hypothetical protein  36.83 
 
 		 809 aa  443  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.513308  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3019  efflux ABC transporter, permease protein  36.83 
 
 		 809 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00602267  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1273  efflux ABC transporter permease  36.71 
 
 		 809 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.924579 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1124  hypothetical protein  35.19 
 
 		 809 aa  437  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.101154  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3191  protein of unknown function DUF214  35.31 
 
 		 809 aa  433  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0495543  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1056  protein of unknown function DUF214  36.94 
 
 		 810 aa  430  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2209  hypothetical protein  34.02 
 
 		 819 aa  422  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.795386  normal  0.224518 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1159  hypothetical protein  36.88 
 
 		 810 aa  411  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184343 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3003  protein of unknown function DUF214  34.94 
 
 		 810 aa  410  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.558274  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3446  ABC transporter, permease protein, putative  32.97 
 
 		 828 aa  405  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000339618  hitchhiker  0.000208184 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0684  hypothetical protein  35.26 
 
 		 829 aa  393  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.852275  normal  0.517784 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1046  hypothetical protein  35.43 
 
 		 828 aa  395  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1399  ABC transporter, permease protein  31.69 
 
 		 830 aa  389  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  32.93 
 
 		 838 aa  392  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  32.61 
 
 		 838 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2957  hypothetical protein  32.29 
 
 		 810 aa  379  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133946  normal  0.10767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1918  hypothetical protein  33.58 
 
 		 835 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695603  hitchhiker  0.000000000000882803 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4016  hypothetical protein  33.12 
 
 		 834 aa  375  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401086  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27140  hypothetical protein  34.27 
 
 		 830 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2296  hypothetical protein  34.39 
 
 		 833 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23050  hypothetical protein  35.15 
 
 		 833 aa  371  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.636342  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3453  hypothetical protein  32.94 
 
 		 832 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000113684 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2316  hypothetical protein  32.61 
 
 		 832 aa  366  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000697167 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0287  predicted permease  30.88 
 
 		 815 aa  362  2e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  31.78 
 
 		 835 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2618  hypothetical protein  33.93 
 
 		 842 aa  353  8.999999999999999e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.855589  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  32.23 
 
 		 829 aa  352  2e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1758  hypothetical protein  33.21 
 
 		 835 aa  346  8e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293557  hitchhiker  0.00000000277599 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  32.53 
 
 		 827 aa  346  1e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  30.26 
 
 		 835 aa  345  2e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05800  hypothetical protein  31.17 
 
 		 818 aa  343  9e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000166  predicted ABC-type transport system permease component  30.16 
 
 		 818 aa  337  5e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  31.45 
 
 		 858 aa  337  7e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2560  hypothetical protein  34.75 
 
 		 834 aa  335  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00315514  hitchhiker  0.00000000000119307 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0722  hypothetical protein  30.47 
 
 		 815 aa  333  5e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000480127  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  32.27 
 
 		 831 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  32.68 
 
 		 826 aa  330  5.0000000000000004e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0944  hypothetical protein  30.56 
 
 		 853 aa  328  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.69332 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4056  protein of unknown function DUF214  31.4 
 
 		 838 aa  325  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  31.42 
 
 		 840 aa  321  3e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  31.42 
 
 		 869 aa  321  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  30.65 
 
 		 844 aa  320  6e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  30.33 
 
 		 840 aa  320  7.999999999999999e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3824  hypothetical protein  31.26 
 
 		 843 aa  317  7e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  30.65 
 
 		 844 aa  316  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  30.95 
 
 		 843 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2015  hypothetical protein  30.75 
 
 		 844 aa  314  4.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  30.42 
 
 		 870 aa  313  7.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0533  hypothetical protein  32.04 
 
 		 840 aa  308  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0008  protein of unknown function DUF214  31.4 
 
 		 836 aa  302  1e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0649  protein of unknown function DUF214  33.73 
 
 		 838 aa  301  4e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  31.44 
 
 		 861 aa  299  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3255  hypothetical protein  31.03 
 
 		 839 aa  299  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0335123  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  29.02 
 
 		 832 aa  296  7e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0898  hypothetical protein  30.73 
 
 		 851 aa  295  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2785  protein of unknown function DUF214  30.46 
 
 		 857 aa  294  6e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.482364  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3458  hypothetical protein  30.34 
 
 		 857 aa  291  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.840481  normal  0.470717 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  31.11 
 
 		 860 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  30.81 
 
 		 874 aa  286  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  30.05 
 
 		 871 aa  280  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  30.51 
 
 		 863 aa  278  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2066  hypothetical protein  31.32 
 
 		 835 aa  278  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1668  hypothetical protein  29.83 
 
 		 871 aa  278  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2280  hypothetical protein  29.83 
 
 		 871 aa  278  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04662  oxidoreductase  30.98 
 
 		 824 aa  278  4e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  30.94 
 
 		 856 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>