190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2679 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3603  eflux ABC transporter inner membrane protein  69.81 
 
 		 835 aa  986    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.217562  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3687  hypothetical protein  65.6 
 
 		 840 aa  904    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2679  putative ABC transporter permease  100 
 
 		 842 aa  1613    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0339343  normal  0.926867 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2271  hypothetical protein  62.4 
 
 		 842 aa  922    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276468  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3288  hypothetical protein  69.81 
 
 		 835 aa  985    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3957  hypothetical protein  69.81 
 
 		 835 aa  999    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1394  hypothetical protein  45.59 
 
 		 858 aa  606  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.472262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  41.2 
 
 		 856 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0087  ABC transporter, permease protein  41.18 
 
 		 849 aa  551  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  40.3 
 
 		 851 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3352  hypothetical protein  42.52 
 
 		 869 aa  536  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0387  putative ABC transporter, permease protein  40.81 
 
 		 856 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  39.67 
 
 		 864 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0099  hypothetical protein  40.07 
 
 		 849 aa  535  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3075  hypothetical protein  42.38 
 
 		 863 aa  531  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4056  protein of unknown function DUF214  40.59 
 
 		 847 aa  525  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0085  ABC transporter, permease protein  41.06 
 
 		 849 aa  525  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0286  hypothetical protein  40.5 
 
 		 860 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463422  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0550  hypothetical protein  40.36 
 
 		 858 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4181  hypothetical protein  41.37 
 
 		 848 aa  514  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.821525  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0414  hypothetical protein  41.32 
 
 		 851 aa  514  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.336355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3733  protein of unknown function DUF214  40.12 
 
 		 847 aa  505  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0829  hypothetical protein  39.67 
 
 		 871 aa  487  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270904  normal  0.305315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5469  hypothetical protein  40.47 
 
 		 862 aa  488  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18562  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1778  protein of unknown function DUF214  39.58 
 
 		 863 aa  475  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1016  hypothetical protein  38.75 
 
 		 858 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331004  normal  0.145704 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3653  hypothetical protein  42.14 
 
 		 847 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2222  protein of unknown function DUF214  35.07 
 
 		 935 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1757  hypothetical protein  41.68 
 
 		 851 aa  442  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2269  hypothetical protein  40.12 
 
 		 892 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2544  protein of unknown function DUF214  40 
 
 		 860 aa  439  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519388  normal  0.0357395 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1913  protein of unknown function DUF214  39.63 
 
 		 882 aa  432  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.549699 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1671  protein of unknown function DUF214  35.58 
 
 		 844 aa  429  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0107522  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2226  protein of unknown function DUF214  40.33 
 
 		 862 aa  431  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0961704 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0698  hypothetical protein  36.8 
 
 		 833 aa  426  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0124  hypothetical protein  38.78 
 
 		 831 aa  426  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0544905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0411  hypothetical protein  36.67 
 
 		 852 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.773219  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1929  protein of unknown function DUF214  33.37 
 
 		 864 aa  358  2.9999999999999997e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316143  normal  0.35107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1276  hypothetical protein  36.95 
 
 		 838 aa  351  2e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53995  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1150  hypothetical protein  35.05 
 
 		 847 aa  305  3.0000000000000004e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  29.43 
 
 		 835 aa  250  9e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2414  hypothetical protein  28.99 
 
 		 832 aa  244  6e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459172  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2110  protein of unknown function DUF214  26.23 
 
 		 833 aa  233  9e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2108  protein of unknown function DUF214  25.76 
 
 		 832 aa  230  9e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  28.39 
 
 		 832 aa  227  5.0000000000000005e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  28.28 
 
 		 829 aa  226  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  27.68 
 
 		 841 aa  218  4e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  28.71 
 
 		 840 aa  208  4e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  26 
 
 		 840 aa  204  5e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  29.17 
 
 		 843 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  28.52 
 
 		 844 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1046  hypothetical protein  28.36 
 
 		 828 aa  196  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  27.73 
 
 		 835 aa  192  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  31.03 
 
 		 863 aa  189  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  28.01 
 
 		 861 aa  187  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  27.62 
 
 		 844 aa  187  8e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2896  hypothetical protein  25.8 
 
 		 821 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431502 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  29.12 
 
 		 831 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  27.21 
 
 		 858 aa  184  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1539  hypothetical protein  25.72 
 
 		 833 aa  184  7e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274903 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  28.11 
 
 		 860 aa  183  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  29.48 
 
 		 826 aa  183  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  25.34 
 
 		 842 aa  182  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1545  hypothetical protein  25.61 
 
 		 833 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1480  hypothetical protein  25.61 
 
 		 833 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  26.24 
 
 		 870 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6498  protein of unknown function DUF214  24.7 
 
 		 835 aa  179  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1029  hypothetical protein  28.59 
 
 		 869 aa  178  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  29.68 
 
 		 874 aa  177  5e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5607  hypothetical protein  30.04 
 
 		 871 aa  178  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4056  protein of unknown function DUF214  26.96 
 
 		 838 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2209  hypothetical protein  24.54 
 
 		 819 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.795386  normal  0.224518 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  29.75 
 
 		 871 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1668  hypothetical protein  29.61 
 
 		 871 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2280  hypothetical protein  29.61 
 
 		 871 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1698  hypothetical protein  25.69 
 
 		 823 aa  174  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.405062 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0542  protein of unknown function DUF214  27.65 
 
 		 843 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  28.39 
 
 		 869 aa  172  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2196  hypothetical protein  30.31 
 
 		 834 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2318  hypothetical protein  30.22 
 
 		 871 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  26.26 
 
 		 827 aa  171  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1662  hypothetical protein  26.02 
 
 		 817 aa  170  8e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000552359  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1259  efflux ABC transporter, permease protein  28.53 
 
 		 880 aa  170  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356208  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1251  efflux ABC transporter, permease protein  28.43 
 
 		 883 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1124  hypothetical protein  26.03 
 
 		 809 aa  169  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.101154  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1400  putative permease  28.44 
 
 		 1108 aa  168  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  29.13 
 
 		 856 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1597  protein of unknown function DUF214  23.22 
 
 		 861 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2015  hypothetical protein  28.12 
 
 		 844 aa  165  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  25.66 
 
 		 804 aa  164  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3191  protein of unknown function DUF214  25.67 
 
 		 809 aa  163  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0495543  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1273  efflux ABC transporter permease  25.4 
 
 		 809 aa  162  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.924579 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3824  hypothetical protein  28.16 
 
 		 843 aa  161  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2926  ABC transporter, permease, putative  25.91 
 
 		 835 aa  161  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0944  hypothetical protein  27.62 
 
 		 853 aa  161  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.69332 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2707  hypothetical protein  25.29 
 
 		 836 aa  160  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1680  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 842 aa  160  9e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.432743  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2686  hypothetical protein  25.43 
 
 		 842 aa  160  9e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2401  hypothetical protein  24.71 
 
 		 816 aa  160  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.678425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2390  hypothetical protein  25.63 
 
 		 831 aa  160  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.652609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>