273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3653 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3653  hypothetical protein  100 
 
 		 847 aa  1615    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1394  hypothetical protein  48.14 
 
 		 858 aa  690    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.472262  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0087  ABC transporter, permease protein  44.88 
 
 		 849 aa  631  1e-179  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0099  hypothetical protein  43.97 
 
 		 849 aa  619  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4056  protein of unknown function DUF214  44.17 
 
 		 847 aa  618  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4181  hypothetical protein  44.66 
 
 		 848 aa  600  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.821525  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  44.67 
 
 		 856 aa  601  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0085  ABC transporter, permease protein  44.64 
 
 		 849 aa  601  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3733  protein of unknown function DUF214  43.93 
 
 		 847 aa  595  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  44.34 
 
 		 851 aa  591  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1016  hypothetical protein  45.4 
 
 		 858 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331004  normal  0.145704 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5469  hypothetical protein  43.86 
 
 		 862 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18562  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1671  protein of unknown function DUF214  43.38 
 
 		 844 aa  585  1.0000000000000001e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0107522  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3352  hypothetical protein  43.99 
 
 		 869 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1778  protein of unknown function DUF214  43.87 
 
 		 863 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3075  hypothetical protein  43.3 
 
 		 863 aa  565  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  43.32 
 
 		 864 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0387  putative ABC transporter, permease protein  42.48 
 
 		 856 aa  553  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0286  hypothetical protein  44.91 
 
 		 860 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463422  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0829  hypothetical protein  42.01 
 
 		 871 aa  546  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270904  normal  0.305315 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0414  hypothetical protein  43.18 
 
 		 851 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.336355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0550  hypothetical protein  42.33 
 
 		 858 aa  536  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2544  protein of unknown function DUF214  43.55 
 
 		 860 aa  521  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519388  normal  0.0357395 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2226  protein of unknown function DUF214  43.33 
 
 		 862 aa  520  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0961704 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2269  hypothetical protein  43.2 
 
 		 892 aa  513  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2679  putative ABC transporter permease  42.99 
 
 		 842 aa  511  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0339343  normal  0.926867 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1913  protein of unknown function DUF214  41.65 
 
 		 882 aa  501  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.549699 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2222  protein of unknown function DUF214  38.35 
 
 		 935 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3603  eflux ABC transporter inner membrane protein  42.67 
 
 		 835 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.217562  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2271  hypothetical protein  42.13 
 
 		 842 aa  488  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276468  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3288  hypothetical protein  42.79 
 
 		 835 aa  489  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0411  hypothetical protein  39.86 
 
 		 852 aa  485  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.773219  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1757  hypothetical protein  42.92 
 
 		 851 aa  484  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3957  hypothetical protein  40.18 
 
 		 835 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3687  hypothetical protein  41.11 
 
 		 840 aa  466  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0124  hypothetical protein  40.55 
 
 		 831 aa  457  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0544905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0698  hypothetical protein  37.14 
 
 		 833 aa  442  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1929  protein of unknown function DUF214  37.84 
 
 		 864 aa  403  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316143  normal  0.35107 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1150  hypothetical protein  38.01 
 
 		 847 aa  394  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1276  hypothetical protein  41.04 
 
 		 838 aa  391  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53995  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2108  protein of unknown function DUF214  28.86 
 
 		 832 aa  291  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2110  protein of unknown function DUF214  28.94 
 
 		 833 aa  278  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2414  hypothetical protein  29.2 
 
 		 832 aa  262  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459172  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  30.52 
 
 		 835 aa  252  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  31.77 
 
 		 840 aa  248  3e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  29.23 
 
 		 841 aa  242  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  28.37 
 
 		 829 aa  228  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  29.96 
 
 		 826 aa  226  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6498  protein of unknown function DUF214  26.88 
 
 		 835 aa  226  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0542  protein of unknown function DUF214  30.76 
 
 		 843 aa  221  5e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1597  protein of unknown function DUF214  25.67 
 
 		 861 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  29.72 
 
 		 861 aa  213  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  28.27 
 
 		 843 aa  211  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  29.68 
 
 		 858 aa  210  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  30.34 
 
 		 831 aa  209  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  29.43 
 
 		 835 aa  208  4e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  28.25 
 
 		 844 aa  206  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  29.61 
 
 		 860 aa  205  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  26.72 
 
 		 832 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2115  ABC efflux transporter, fused inner membrane subunits  26.1 
 
 		 882 aa  198  3e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.675122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  28.52 
 
 		 844 aa  198  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  32.93 
 
 		 874 aa  197  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  31.47 
 
 		 871 aa  197  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  27.72 
 
 		 838 aa  197  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  24.57 
 
 		 836 aa  196  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  31.61 
 
 		 863 aa  196  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  27.93 
 
 		 838 aa  195  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1918  hypothetical protein  27.33 
 
 		 835 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695603  hitchhiker  0.000000000000882803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0944  hypothetical protein  30.82 
 
 		 853 aa  194  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.69332 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  26.77 
 
 		 840 aa  193  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1668  hypothetical protein  31.3 
 
 		 871 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2280  hypothetical protein  31.3 
 
 		 871 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2015  hypothetical protein  29.45 
 
 		 844 aa  192  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1029  hypothetical protein  31.91 
 
 		 869 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2618  hypothetical protein  29.32 
 
 		 842 aa  191  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.855589  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1399  ABC transporter, permease protein  26.59 
 
 		 830 aa  190  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4056  protein of unknown function DUF214  28.63 
 
 		 838 aa  189  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  24.97 
 
 		 842 aa  187  9e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5607  hypothetical protein  31.11 
 
 		 871 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1273  efflux ABC transporter permease  27.68 
 
 		 809 aa  186  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.924579 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  28.61 
 
 		 827 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2436  hypothetical protein  24.75 
 
 		 870 aa  183  9.000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  25.97 
 
 		 804 aa  182  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  31.18 
 
 		 856 aa  182  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3019  efflux ABC transporter, permease protein  27.43 
 
 		 809 aa  181  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00602267  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2318  hypothetical protein  30.4 
 
 		 871 aa  180  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2196  hypothetical protein  30.69 
 
 		 834 aa  180  9e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2785  protein of unknown function DUF214  28.66 
 
 		 857 aa  180  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.482364  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1259  efflux ABC transporter, permease protein  32.17 
 
 		 880 aa  179  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356208  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3157  hypothetical protein  26.97 
 
 		 809 aa  179  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.513308  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000166  predicted ABC-type transport system permease component  25.2 
 
 		 818 aa  178  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0572  efflux ABC transporter permease  27.23 
 
 		 804 aa  177  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.868504 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0287  predicted permease  24.91 
 
 		 815 aa  176  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1400  putative permease  32.17 
 
 		 1108 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3458  hypothetical protein  28.78 
 
 		 857 aa  177  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.840481  normal  0.470717 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0545  efflux ABC transporter, permease protein  26.4 
 
 		 804 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3824  hypothetical protein  30.12 
 
 		 843 aa  176  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  27.22 
 
 		 870 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0555  efflux ABC transporter, permease protein  26.88 
 
 		 804 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0557  efflux ABC transporter permease  27.11 
 
 		 804 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>