More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0542 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6498  protein of unknown function DUF214  46.14 
 
 		 835 aa  649    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0542  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 843 aa  1603    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  48.39 
 
 		 841 aa  659    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1597  protein of unknown function DUF214  41.92 
 
 		 861 aa  620  1e-176  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4181  hypothetical protein  30.77 
 
 		 848 aa  286  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.821525  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0087  ABC transporter, permease protein  29.38 
 
 		 849 aa  263  8e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3733  protein of unknown function DUF214  29.76 
 
 		 847 aa  263  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0099  hypothetical protein  29.45 
 
 		 849 aa  261  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4056  protein of unknown function DUF214  29.52 
 
 		 847 aa  258  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  29.18 
 
 		 829 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  30.04 
 
 		 840 aa  254  3e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  29.96 
 
 		 869 aa  254  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  31.48 
 
 		 860 aa  253  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  31.21 
 
 		 861 aa  252  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2108  protein of unknown function DUF214  27.31 
 
 		 832 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1918  hypothetical protein  30.62 
 
 		 835 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695603  hitchhiker  0.000000000000882803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1016  hypothetical protein  31.24 
 
 		 858 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331004  normal  0.145704 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2414  hypothetical protein  29.12 
 
 		 832 aa  245  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459172  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  29.84 
 
 		 844 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  29.75 
 
 		 870 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  29.03 
 
 		 851 aa  244  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3352  hypothetical protein  29.24 
 
 		 869 aa  244  6e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3075  hypothetical protein  28.44 
 
 		 863 aa  243  9e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  27.89 
 
 		 856 aa  242  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  28.92 
 
 		 844 aa  241  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  28.28 
 
 		 843 aa  241  5.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1394  hypothetical protein  28.83 
 
 		 858 aa  240  9e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.472262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0085  ABC transporter, permease protein  29.15 
 
 		 849 aa  239  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2110  protein of unknown function DUF214  27.95 
 
 		 833 aa  238  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0411  hypothetical protein  29.25 
 
 		 852 aa  238  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.773219  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0124  hypothetical protein  30.88 
 
 		 831 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0544905  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2316  hypothetical protein  30.32 
 
 		 832 aa  233  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000697167 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0898  hypothetical protein  30.06 
 
 		 851 aa  231  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3453  hypothetical protein  30.08 
 
 		 832 aa  227  9e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000113684 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  30.37 
 
 		 863 aa  227  9e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  28.51 
 
 		 835 aa  226  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  27.31 
 
 		 864 aa  225  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  28.92 
 
 		 835 aa  224  4e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2222  protein of unknown function DUF214  28.54 
 
 		 935 aa  224  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1668  hypothetical protein  29.7 
 
 		 871 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2280  hypothetical protein  29.7 
 
 		 871 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  31.62 
 
 		 831 aa  223  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  29.37 
 
 		 871 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5469  hypothetical protein  29.22 
 
 		 862 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18562  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1029  hypothetical protein  31.55 
 
 		 869 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2196  hypothetical protein  29.87 
 
 		 834 aa  221  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  30.93 
 
 		 840 aa  220  8.999999999999998e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1671  protein of unknown function DUF214  29.21 
 
 		 844 aa  219  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0107522  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  31.11 
 
 		 826 aa  219  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2318  hypothetical protein  30.54 
 
 		 871 aa  219  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5607  hypothetical protein  29.63 
 
 		 871 aa  218  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0286  hypothetical protein  27.91 
 
 		 860 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463422  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0387  putative ABC transporter, permease protein  27.35 
 
 		 856 aa  216  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2618  hypothetical protein  31.03 
 
 		 842 aa  216  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.855589  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  27.08 
 
 		 832 aa  216  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0829  hypothetical protein  26.89 
 
 		 871 aa  216  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270904  normal  0.305315 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0600  efflux ABC transporter, permease protein  27.92 
 
 		 804 aa  216  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.77559 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0545  efflux ABC transporter, permease protein  27.8 
 
 		 804 aa  215  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  28.52 
 
 		 804 aa  215  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3157  hypothetical protein  29.33 
 
 		 809 aa  214  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.513308  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  28.7 
 
 		 838 aa  212  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3019  efflux ABC transporter, permease protein  29.33 
 
 		 809 aa  212  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00602267  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0575  efflux ABC transporter, permease protein  27.68 
 
 		 804 aa  212  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3120  hypothetical protein  27.71 
 
 		 804 aa  212  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749019 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00447  predicted inner membrane protein  28.08 
 
 		 804 aa  211  4e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3114  protein of unknown function DUF214  27.68 
 
 		 804 aa  211  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00452  hypothetical protein  28.08 
 
 		 804 aa  211  4e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1259  efflux ABC transporter, permease protein  31.13 
 
 		 880 aa  211  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356208  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27140  hypothetical protein  30.96 
 
 		 830 aa  211  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0535  efflux ABC transporter, permease protein  27.68 
 
 		 804 aa  211  6e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1251  efflux ABC transporter, permease protein  30.75 
 
 		 883 aa  209  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4016  hypothetical protein  28.92 
 
 		 834 aa  209  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401086  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0431  efflux ABC transporter, permease protein  28.14 
 
 		 805 aa  209  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1400  putative permease  31.13 
 
 		 1108 aa  208  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2015  hypothetical protein  29.38 
 
 		 844 aa  207  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1273  efflux ABC transporter permease  29.09 
 
 		 809 aa  207  6e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.924579 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  28.83 
 
 		 827 aa  207  9e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1778  protein of unknown function DUF214  29.29 
 
 		 863 aa  207  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  28.1 
 
 		 838 aa  205  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3653  hypothetical protein  30.53 
 
 		 847 aa  205  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1399  ABC transporter, permease protein  27.61 
 
 		 830 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1150  hypothetical protein  30.38 
 
 		 847 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1124  hypothetical protein  27.8 
 
 		 809 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.101154  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3191  protein of unknown function DUF214  28.04 
 
 		 809 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0495543  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2957  hypothetical protein  24.53 
 
 		 810 aa  198  5.000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133946  normal  0.10767 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1758  hypothetical protein  29.6 
 
 		 835 aa  196  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293557  hitchhiker  0.00000000277599 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23050  hypothetical protein  30.94 
 
 		 833 aa  195  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.636342  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  29.72 
 
 		 874 aa  195  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1056  protein of unknown function DUF214  29.81 
 
 		 810 aa  194  7e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3603  eflux ABC transporter inner membrane protein  29.48 
 
 		 835 aa  194  7e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.217562  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4056  protein of unknown function DUF214  28.7 
 
 		 838 aa  194  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1757  hypothetical protein  29.02 
 
 		 851 aa  191  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0550  hypothetical protein  26.61 
 
 		 858 aa  190  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  28.64 
 
 		 858 aa  190  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0414  hypothetical protein  26.77 
 
 		 851 aa  189  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.336355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3255  hypothetical protein  28.43 
 
 		 839 aa  189  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0335123  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2436  hypothetical protein  26.25 
 
 		 870 aa  188  3e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1159  hypothetical protein  29.93 
 
 		 810 aa  188  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184343 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  24.88 
 
 		 840 aa  189  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3288  hypothetical protein  29.13 
 
 		 835 aa  188  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>