292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0829 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009505  BOV_0085  ABC transporter, permease protein  47.05 
 
 		 849 aa  691    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  51.99 
 
 		 856 aa  800    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2269  hypothetical protein  52.22 
 
 		 892 aa  697    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_004310  BR0087  ABC transporter, permease protein  47.05 
 
 		 849 aa  723    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5469  hypothetical protein  54.94 
 
 		 862 aa  824    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18562  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1394  hypothetical protein  46.65 
 
 		 858 aa  673    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.472262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2226  protein of unknown function DUF214  52.1 
 
 		 862 aa  699    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0961704 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0414  hypothetical protein  51.11 
 
 		 851 aa  730    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.336355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0099  hypothetical protein  47.79 
 
 		 849 aa  731    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0286  hypothetical protein  51.47 
 
 		 860 aa  741    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463422  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0387  putative ABC transporter, permease protein  51.46 
 
 		 856 aa  756    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  51.57 
 
 		 851 aa  780    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  51.32 
 
 		 864 aa  769    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3075  hypothetical protein  47.03 
 
 		 863 aa  638    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0550  hypothetical protein  51.18 
 
 		 858 aa  738    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2544  protein of unknown function DUF214  52.45 
 
 		 860 aa  705    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519388  normal  0.0357395 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1778  protein of unknown function DUF214  55.13 
 
 		 863 aa  808    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3352  hypothetical protein  47.43 
 
 		 869 aa  675    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1757  hypothetical protein  48.77 
 
 		 851 aa  654    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1016  hypothetical protein  54.79 
 
 		 858 aa  811    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331004  normal  0.145704 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3733  protein of unknown function DUF214  47.09 
 
 		 847 aa  656    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4181  hypothetical protein  46.38 
 
 		 848 aa  662    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.821525  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0829  hypothetical protein  100 
 
 		 871 aa  1696    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270904  normal  0.305315 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1913  protein of unknown function DUF214  55.09 
 
 		 882 aa  768    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.549699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4056  protein of unknown function DUF214  46.85 
 
 		 847 aa  663    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3653  hypothetical protein  42.76 
 
 		 847 aa  520  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1671  protein of unknown function DUF214  36.89 
 
 		 844 aa  511  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0107522  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2222  protein of unknown function DUF214  34.93 
 
 		 935 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2679  putative ABC transporter permease  39.88 
 
 		 842 aa  487  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0339343  normal  0.926867 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3603  eflux ABC transporter inner membrane protein  42.01 
 
 		 835 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.217562  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3288  hypothetical protein  42.01 
 
 		 835 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3957  hypothetical protein  41.16 
 
 		 835 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2271  hypothetical protein  38.49 
 
 		 842 aa  476  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276468  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0411  hypothetical protein  35.51 
 
 		 852 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.773219  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0698  hypothetical protein  36.36 
 
 		 833 aa  455  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0124  hypothetical protein  38.74 
 
 		 831 aa  419  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0544905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3687  hypothetical protein  36.95 
 
 		 840 aa  414  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1929  protein of unknown function DUF214  37.12 
 
 		 864 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316143  normal  0.35107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1276  hypothetical protein  36.1 
 
 		 838 aa  347  6e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53995  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6498  protein of unknown function DUF214  27.94 
 
 		 835 aa  268  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  29.14 
 
 		 835 aa  259  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1150  hypothetical protein  37.28 
 
 		 847 aa  258  4e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  30.26 
 
 		 841 aa  255  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1597  protein of unknown function DUF214  25.87 
 
 		 861 aa  243  7.999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2108  protein of unknown function DUF214  24.68 
 
 		 832 aa  243  9e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  27.58 
 
 		 832 aa  238  5.0000000000000005e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  27.15 
 
 		 829 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2110  protein of unknown function DUF214  25.32 
 
 		 833 aa  230  7e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0542  protein of unknown function DUF214  27.87 
 
 		 843 aa  226  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  28.94 
 
 		 831 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  29.27 
 
 		 838 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  28.08 
 
 		 840 aa  221  5e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1918  hypothetical protein  28.77 
 
 		 835 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695603  hitchhiker  0.000000000000882803 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  29.34 
 
 		 838 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27140  hypothetical protein  30.07 
 
 		 830 aa  217  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  29.07 
 
 		 835 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  28.21 
 
 		 844 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  25.64 
 
 		 842 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2414  hypothetical protein  26.12 
 
 		 832 aa  215  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459172  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1399  ABC transporter, permease protein  27.33 
 
 		 830 aa  213  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  29.36 
 
 		 858 aa  213  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  28.97 
 
 		 826 aa  211  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4016  hypothetical protein  28.44 
 
 		 834 aa  211  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401086  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2015  hypothetical protein  30.16 
 
 		 844 aa  210  8e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2296  hypothetical protein  29.95 
 
 		 833 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  23.89 
 
 		 840 aa  209  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  27.11 
 
 		 843 aa  206  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2618  hypothetical protein  28.15 
 
 		 842 aa  207  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.855589  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  27.44 
 
 		 844 aa  203  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  25.63 
 
 		 804 aa  196  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0073  hypothetical protein  25.56 
 
 		 884 aa  196  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  28.61 
 
 		 874 aa  195  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  27.99 
 
 		 840 aa  195  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23050  hypothetical protein  29.71 
 
 		 833 aa  195  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.636342  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3824  hypothetical protein  29.16 
 
 		 843 aa  194  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  25.44 
 
 		 836 aa  194  6e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1046  hypothetical protein  27.64 
 
 		 828 aa  190  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0545  efflux ABC transporter, permease protein  26.28 
 
 		 804 aa  188  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2785  protein of unknown function DUF214  28.4 
 
 		 857 aa  188  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.482364  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3255  hypothetical protein  29.15 
 
 		 839 aa  187  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0335123  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0572  efflux ABC transporter permease  26.37 
 
 		 804 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.868504 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0557  efflux ABC transporter permease  26.25 
 
 		 804 aa  187  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0562  efflux ABC transporter permease protein  25.98 
 
 		 804 aa  187  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336553  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00447  predicted inner membrane protein  26.16 
 
 		 804 aa  186  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3114  protein of unknown function DUF214  26.16 
 
 		 804 aa  186  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2436  hypothetical protein  24.88 
 
 		 870 aa  186  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00452  hypothetical protein  26.16 
 
 		 804 aa  186  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0535  efflux ABC transporter, permease protein  26.37 
 
 		 804 aa  186  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0600  efflux ABC transporter, permease protein  25.74 
 
 		 804 aa  186  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.77559 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0575  efflux ABC transporter, permease protein  26.16 
 
 		 804 aa  185  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0616  efflux ABC transporter permease  26.35 
 
 		 804 aa  185  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3120  hypothetical protein  26.16 
 
 		 804 aa  185  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749019 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0431  efflux ABC transporter, permease protein  25.83 
 
 		 805 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0555  efflux ABC transporter, permease protein  26.25 
 
 		 804 aa  184  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  27.46 
 
 		 861 aa  184  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4056  protein of unknown function DUF214  27.74 
 
 		 838 aa  183  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3458  hypothetical protein  28.14 
 
 		 857 aa  183  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.840481  normal  0.470717 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  27.25 
 
 		 869 aa  182  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  25.17 
 
 		 870 aa  182  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2115  ABC efflux transporter, fused inner membrane subunits  24.91 
 
 		 882 aa  182  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.675122  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>