218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1276 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1276  hypothetical protein  100 
 
 		 838 aa  1582    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53995  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1394  hypothetical protein  40.96 
 
 		 858 aa  506  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.472262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  37.53 
 
 		 856 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5469  hypothetical protein  38.6 
 
 		 862 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18562  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1778  protein of unknown function DUF214  38.84 
 
 		 863 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  37.78 
 
 		 851 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1016  hypothetical protein  38.99 
 
 		 858 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331004  normal  0.145704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0387  putative ABC transporter, permease protein  36.57 
 
 		 856 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4056  protein of unknown function DUF214  36.2 
 
 		 847 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3733  protein of unknown function DUF214  36.79 
 
 		 847 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0124  hypothetical protein  39.23 
 
 		 831 aa  434  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0544905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4181  hypothetical protein  37.9 
 
 		 848 aa  430  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.821525  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0414  hypothetical protein  37.69 
 
 		 851 aa  426  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.336355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0286  hypothetical protein  36.51 
 
 		 860 aa  426  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463422  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_004310  BR0087  ABC transporter, permease protein  35.15 
 
 		 849 aa  422  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2226  protein of unknown function DUF214  39.24 
 
 		 862 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0961704 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3075  hypothetical protein  37.25 
 
 		 863 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1671  protein of unknown function DUF214  35.54 
 
 		 844 aa  412  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0107522  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0099  hypothetical protein  35.07 
 
 		 849 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0829  hypothetical protein  35.78 
 
 		 871 aa  408  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270904  normal  0.305315 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0550  hypothetical protein  35.33 
 
 		 858 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2271  hypothetical protein  37.17 
 
 		 842 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276468  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2679  putative ABC transporter permease  37.02 
 
 		 842 aa  405  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0339343  normal  0.926867 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3653  hypothetical protein  39.98 
 
 		 847 aa  404  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3603  eflux ABC transporter inner membrane protein  37.34 
 
 		 835 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.217562  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1757  hypothetical protein  36.82 
 
 		 851 aa  396  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0085  ABC transporter, permease protein  35.15 
 
 		 849 aa  398  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3288  hypothetical protein  37.22 
 
 		 835 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3687  hypothetical protein  38.27 
 
 		 840 aa  392  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3352  hypothetical protein  36.24 
 
 		 869 aa  379  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2222  protein of unknown function DUF214  34.5 
 
 		 935 aa  360  4e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0411  hypothetical protein  33.37 
 
 		 852 aa  345  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.773219  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1929  protein of unknown function DUF214  35.6 
 
 		 864 aa  340  7e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316143  normal  0.35107 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1150  hypothetical protein  36.06 
 
 		 847 aa  328  3e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0698  hypothetical protein  39.63 
 
 		 833 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2269  hypothetical protein  42.45 
 
 		 892 aa  253  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2544  protein of unknown function DUF214  42.45 
 
 		 860 aa  251  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519388  normal  0.0357395 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3957  hypothetical protein  43.27 
 
 		 835 aa  242  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  41.12 
 
 		 864 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  27.84 
 
 		 829 aa  226  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6498  protein of unknown function DUF214  26.84 
 
 		 835 aa  220  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1913  protein of unknown function DUF214  37.99 
 
 		 882 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.549699 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2414  hypothetical protein  26.61 
 
 		 832 aa  217  9e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459172  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  30.26 
 
 		 840 aa  204  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1597  protein of unknown function DUF214  25.2 
 
 		 861 aa  204  8e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  27.2 
 
 		 841 aa  201  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2108  protein of unknown function DUF214  25.71 
 
 		 832 aa  197  9e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0542  protein of unknown function DUF214  29.49 
 
 		 843 aa  187  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2110  protein of unknown function DUF214  25.09 
 
 		 833 aa  187  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  26.23 
 
 		 835 aa  187  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  28.02 
 
 		 835 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2785  protein of unknown function DUF214  28.69 
 
 		 857 aa  183  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.482364  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4056  protein of unknown function DUF214  29.15 
 
 		 838 aa  182  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  23.8 
 
 		 836 aa  180  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3458  hypothetical protein  28.57 
 
 		 857 aa  180  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.840481  normal  0.470717 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  26.47 
 
 		 832 aa  176  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  26.52 
 
 		 844 aa  174  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3255  hypothetical protein  28.66 
 
 		 839 aa  172  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0335123  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  27 
 
 		 870 aa  171  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  25.06 
 
 		 842 aa  170  8e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2015  hypothetical protein  27.97 
 
 		 844 aa  169  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  27.53 
 
 		 861 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  27.95 
 
 		 860 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  27.45 
 
 		 831 aa  167  8e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1046  hypothetical protein  26.82 
 
 		 828 aa  166  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  26.83 
 
 		 858 aa  166  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1918  hypothetical protein  28.84 
 
 		 835 aa  164  9e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695603  hitchhiker  0.000000000000882803 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3824  hypothetical protein  28.55 
 
 		 843 aa  162  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  26.38 
 
 		 838 aa  161  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2316  hypothetical protein  29.37 
 
 		 832 aa  161  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000697167 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  29.77 
 
 		 874 aa  160  8e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  26.41 
 
 		 843 aa  160  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4016  hypothetical protein  27.5 
 
 		 834 aa  160  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401086  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3453  hypothetical protein  29.49 
 
 		 832 aa  160  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000113684 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  26.27 
 
 		 826 aa  160  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  26.69 
 
 		 838 aa  158  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  29.3 
 
 		 863 aa  157  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0008  protein of unknown function DUF214  27.02 
 
 		 836 aa  156  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  24.23 
 
 		 804 aa  157  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23050  hypothetical protein  28.7 
 
 		 833 aa  154  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.636342  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  27.4 
 
 		 827 aa  154  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  29.1 
 
 		 871 aa  154  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1029  hypothetical protein  28.63 
 
 		 869 aa  153  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  23.94 
 
 		 840 aa  153  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  28.85 
 
 		 856 aa  152  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  26.52 
 
 		 844 aa  150  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0557  efflux ABC transporter permease  25.12 
 
 		 804 aa  150  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  27.24 
 
 		 840 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0562  efflux ABC transporter permease protein  25.12 
 
 		 804 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27140  hypothetical protein  28.5 
 
 		 830 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0572  efflux ABC transporter permease  25 
 
 		 804 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.868504 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0944  hypothetical protein  26.86 
 
 		 853 aa  149  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.69332 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2296  hypothetical protein  28.5 
 
 		 833 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1668  hypothetical protein  28.75 
 
 		 871 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2280  hypothetical protein  28.75 
 
 		 871 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0616  efflux ABC transporter permease  25.06 
 
 		 804 aa  148  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0555  efflux ABC transporter, permease protein  24.94 
 
 		 804 aa  147  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3446  ABC transporter, permease protein, putative  25.56 
 
 		 828 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000339618  hitchhiker  0.000208184 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2318  hypothetical protein  28.21 
 
 		 871 aa  145  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2196  hypothetical protein  28.09 
 
 		 834 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>