216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4056 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0829  hypothetical protein  46.52 
 
 		 871 aa  638    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270904  normal  0.305315 
 
 
-
 
NC_004310  BR0087  ABC transporter, permease protein  62.11 
 
 		 849 aa  979    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1778  protein of unknown function DUF214  53.13 
 
 		 863 aa  758    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3733  protein of unknown function DUF214  95.87 
 
 		 847 aa  1511    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0414  hypothetical protein  49.58 
 
 		 851 aa  724    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.336355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0286  hypothetical protein  50.89 
 
 		 860 aa  723    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463422  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  52.49 
 
 		 851 aa  786    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0099  hypothetical protein  61.76 
 
 		 849 aa  977    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  51.3 
 
 		 864 aa  744    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0550  hypothetical protein  50.12 
 
 		 858 aa  734    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3352  hypothetical protein  64.37 
 
 		 869 aa  975    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2269  hypothetical protein  51.18 
 
 		 892 aa  682    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2544  protein of unknown function DUF214  51.18 
 
 		 860 aa  683    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519388  normal  0.0357395 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2226  protein of unknown function DUF214  50.95 
 
 		 862 aa  680    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0961704 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1016  hypothetical protein  52.36 
 
 		 858 aa  764    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331004  normal  0.145704 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4056  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 847 aa  1669    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4181  hypothetical protein  72.21 
 
 		 848 aa  1158    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.821525  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  51.65 
 
 		 856 aa  786    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0387  putative ABC transporter, permease protein  50.48 
 
 		 856 aa  752    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3075  hypothetical protein  72.77 
 
 		 863 aa  1133    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0085  ABC transporter, permease protein  62.11 
 
 		 849 aa  947    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1394  hypothetical protein  48.58 
 
 		 858 aa  709    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.472262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5469  hypothetical protein  51.24 
 
 		 862 aa  747    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18562  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1913  protein of unknown function DUF214  48.96 
 
 		 882 aa  630  1e-179  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.549699 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1757  hypothetical protein  47.87 
 
 		 851 aa  626  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3653  hypothetical protein  43.93 
 
 		 847 aa  554  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1671  protein of unknown function DUF214  36.82 
 
 		 844 aa  523  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0107522  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2679  putative ABC transporter permease  40.24 
 
 		 842 aa  515  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0339343  normal  0.926867 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2271  hypothetical protein  39.84 
 
 		 842 aa  488  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276468  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0124  hypothetical protein  39.5 
 
 		 831 aa  489  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0544905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3288  hypothetical protein  40.24 
 
 		 835 aa  478  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2222  protein of unknown function DUF214  34.62 
 
 		 935 aa  474  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3603  eflux ABC transporter inner membrane protein  40.12 
 
 		 835 aa  475  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.217562  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0698  hypothetical protein  38.19 
 
 		 833 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3957  hypothetical protein  39.29 
 
 		 835 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0411  hypothetical protein  36.55 
 
 		 852 aa  451  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.773219  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1150  hypothetical protein  37.89 
 
 		 847 aa  421  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1929  protein of unknown function DUF214  37.94 
 
 		 864 aa  401  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316143  normal  0.35107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1276  hypothetical protein  36.2 
 
 		 838 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53995  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  29.82 
 
 		 841 aa  274  6e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6498  protein of unknown function DUF214  27.68 
 
 		 835 aa  266  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1597  protein of unknown function DUF214  26.57 
 
 		 861 aa  253  8.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0542  protein of unknown function DUF214  29.33 
 
 		 843 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3687  hypothetical protein  39.63 
 
 		 840 aa  241  4e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  28.29 
 
 		 829 aa  238  3e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2110  protein of unknown function DUF214  27.05 
 
 		 833 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  26.08 
 
 		 836 aa  234  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2108  protein of unknown function DUF214  25.62 
 
 		 832 aa  231  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  26.03 
 
 		 835 aa  228  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  25.56 
 
 		 842 aa  221  5e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  27.2 
 
 		 832 aa  221  5e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  25.58 
 
 		 840 aa  206  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1046  hypothetical protein  28.21 
 
 		 828 aa  205  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  28.42 
 
 		 826 aa  204  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1124  hypothetical protein  26.12 
 
 		 809 aa  202  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.101154  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  28.68 
 
 		 840 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  27.86 
 
 		 831 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3191  protein of unknown function DUF214  26.07 
 
 		 809 aa  198  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0495543  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  24.79 
 
 		 835 aa  198  4.0000000000000005e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  26.15 
 
 		 804 aa  197  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2618  hypothetical protein  26.8 
 
 		 842 aa  195  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.855589  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0557  efflux ABC transporter permease  27.61 
 
 		 804 aa  194  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3157  hypothetical protein  26.72 
 
 		 809 aa  193  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.513308  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3019  efflux ABC transporter, permease protein  26.72 
 
 		 809 aa  193  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00602267  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0562  efflux ABC transporter permease protein  27.61 
 
 		 804 aa  193  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0572  efflux ABC transporter permease  27.73 
 
 		 804 aa  192  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.868504 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27140  hypothetical protein  27.39 
 
 		 830 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0555  efflux ABC transporter, permease protein  27.73 
 
 		 804 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2957  hypothetical protein  24.27 
 
 		 810 aa  191  4e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133946  normal  0.10767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  27.1 
 
 		 838 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1273  efflux ABC transporter permease  27.19 
 
 		 809 aa  190  7e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.924579 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2414  hypothetical protein  24.91 
 
 		 832 aa  189  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459172  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0616  efflux ABC transporter permease  27.25 
 
 		 804 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4016  hypothetical protein  26.6 
 
 		 834 aa  189  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401086  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2896  hypothetical protein  24.8 
 
 		 821 aa  187  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431502 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  26.15 
 
 		 838 aa  187  9e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1159  hypothetical protein  27.25 
 
 		 810 aa  185  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184343 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1698  hypothetical protein  24.29 
 
 		 823 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.405062 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  26.79 
 
 		 843 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0722  hypothetical protein  24.43 
 
 		 815 aa  183  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000480127  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000166  predicted ABC-type transport system permease component  24.43 
 
 		 818 aa  182  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  25.99 
 
 		 844 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3446  ABC transporter, permease protein, putative  25.49 
 
 		 828 aa  181  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000339618  hitchhiker  0.000208184 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0287  predicted permease  22.67 
 
 		 815 aa  181  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0545  efflux ABC transporter, permease protein  26.72 
 
 		 804 aa  180  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05800  hypothetical protein  24.94 
 
 		 818 aa  179  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2318  hypothetical protein  26.77 
 
 		 871 aa  178  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3114  protein of unknown function DUF214  26.59 
 
 		 804 aa  178  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0575  efflux ABC transporter, permease protein  26.35 
 
 		 804 aa  178  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2196  hypothetical protein  27.43 
 
 		 834 aa  177  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0600  efflux ABC transporter, permease protein  26.24 
 
 		 804 aa  177  8e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.77559 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2785  protein of unknown function DUF214  25.98 
 
 		 857 aa  177  9e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.482364  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3120  hypothetical protein  26.35 
 
 		 804 aa  177  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749019 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0535  efflux ABC transporter, permease protein  26.47 
 
 		 804 aa  174  5.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0431  efflux ABC transporter, permease protein  26.26 
 
 		 805 aa  174  6.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00447  predicted inner membrane protein  26.47 
 
 		 804 aa  173  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00452  hypothetical protein  26.47 
 
 		 804 aa  173  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1487  ABC transporter, permease, putative  25.22 
 
 		 818 aa  172  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3458  hypothetical protein  25.98 
 
 		 857 aa  172  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.840481  normal  0.470717 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2560  hypothetical protein  27.74 
 
 		 834 aa  172  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00315514  hitchhiker  0.00000000000119307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>