205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3075 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0087  ABC transporter, permease protein  61.47 
 
 		 849 aa  983    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5469  hypothetical protein  51.06 
 
 		 862 aa  739    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18562  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0414  hypothetical protein  50.12 
 
 		 851 aa  716    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.336355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2269  hypothetical protein  51.53 
 
 		 892 aa  678    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0286  hypothetical protein  51.07 
 
 		 860 aa  725    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463422  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  50.83 
 
 		 851 aa  764    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4056  protein of unknown function DUF214  72.77 
 
 		 847 aa  1169    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  51.31 
 
 		 864 aa  748    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0550  hypothetical protein  49.52 
 
 		 858 aa  723    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3352  hypothetical protein  64.57 
 
 		 869 aa  976    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2226  protein of unknown function DUF214  51.61 
 
 		 862 aa  673    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0961704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2544  protein of unknown function DUF214  51.53 
 
 		 860 aa  678    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519388  normal  0.0357395 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1757  hypothetical protein  49.17 
 
 		 851 aa  640    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1778  protein of unknown function DUF214  51.88 
 
 		 863 aa  731    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4181  hypothetical protein  67.34 
 
 		 848 aa  1082    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.821525  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1394  hypothetical protein  51.96 
 
 		 858 aa  750    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.472262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1016  hypothetical protein  51.72 
 
 		 858 aa  733    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331004  normal  0.145704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0387  putative ABC transporter, permease protein  49.69 
 
 		 856 aa  724    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0085  ABC transporter, permease protein  61.47 
 
 		 849 aa  952    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3075  hypothetical protein  100 
 
 		 863 aa  1689    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  52.26 
 
 		 856 aa  797    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0829  hypothetical protein  46.68 
 
 		 871 aa  638    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270904  normal  0.305315 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0099  hypothetical protein  61.36 
 
 		 849 aa  980    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3733  protein of unknown function DUF214  72.41 
 
 		 847 aa  1142    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1913  protein of unknown function DUF214  49.07 
 
 		 882 aa  634  1e-180  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.549699 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1671  protein of unknown function DUF214  38.86 
 
 		 844 aa  553  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0107522  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2679  putative ABC transporter permease  42.38 
 
 		 842 aa  553  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0339343  normal  0.926867 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3653  hypothetical protein  43.21 
 
 		 847 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3957  hypothetical protein  41.67 
 
 		 835 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3603  eflux ABC transporter inner membrane protein  41.31 
 
 		 835 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.217562  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0124  hypothetical protein  41.68 
 
 		 831 aa  504  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0544905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2271  hypothetical protein  39.48 
 
 		 842 aa  501  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276468  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3288  hypothetical protein  41.31 
 
 		 835 aa  501  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0698  hypothetical protein  40.52 
 
 		 833 aa  496  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3687  hypothetical protein  39.41 
 
 		 840 aa  476  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0411  hypothetical protein  37.94 
 
 		 852 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.773219  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1929  protein of unknown function DUF214  37.59 
 
 		 864 aa  424  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316143  normal  0.35107 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1150  hypothetical protein  38.04 
 
 		 847 aa  408  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1276  hypothetical protein  37.59 
 
 		 838 aa  375  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53995  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2222  protein of unknown function DUF214  35.02 
 
 		 935 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  30.76 
 
 		 841 aa  274  6e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6498  protein of unknown function DUF214  27.52 
 
 		 835 aa  267  5.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1597  protein of unknown function DUF214  26.35 
 
 		 861 aa  254  6e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0542  protein of unknown function DUF214  28.52 
 
 		 843 aa  244  5e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  26.87 
 
 		 835 aa  244  6e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1399  ABC transporter, permease protein  27.81 
 
 		 830 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  28.05 
 
 		 829 aa  234  5e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2110  protein of unknown function DUF214  25.26 
 
 		 833 aa  228  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2108  protein of unknown function DUF214  24.38 
 
 		 832 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  27.37 
 
 		 831 aa  220  7.999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  26.9 
 
 		 842 aa  219  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  26.31 
 
 		 832 aa  217  8e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  28.85 
 
 		 826 aa  216  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  28.61 
 
 		 840 aa  215  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  26.12 
 
 		 835 aa  210  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2414  hypothetical protein  24.78 
 
 		 832 aa  209  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459172  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3446  ABC transporter, permease protein, putative  25.18 
 
 		 828 aa  199  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000339618  hitchhiker  0.000208184 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  24.16 
 
 		 836 aa  198  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  25.88 
 
 		 804 aa  197  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  28.04 
 
 		 838 aa  195  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1918  hypothetical protein  27.29 
 
 		 835 aa  194  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695603  hitchhiker  0.000000000000882803 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23050  hypothetical protein  28.7 
 
 		 833 aa  194  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.636342  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1046  hypothetical protein  27.58 
 
 		 828 aa  194  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2618  hypothetical protein  27.5 
 
 		 842 aa  194  9e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.855589  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2316  hypothetical protein  27.65 
 
 		 832 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000697167 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  25.73 
 
 		 843 aa  192  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  26.82 
 
 		 838 aa  191  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3453  hypothetical protein  27.72 
 
 		 832 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000113684 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  26.61 
 
 		 844 aa  188  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3191  protein of unknown function DUF214  25.68 
 
 		 809 aa  187  8e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0495543  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1159  hypothetical protein  27.52 
 
 		 810 aa  186  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184343 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0555  efflux ABC transporter, permease protein  26.28 
 
 		 804 aa  183  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0572  efflux ABC transporter permease  26.28 
 
 		 804 aa  183  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.868504 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1124  hypothetical protein  25.76 
 
 		 809 aa  182  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.101154  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2015  hypothetical protein  27.48 
 
 		 844 aa  182  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0562  efflux ABC transporter permease protein  26.28 
 
 		 804 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0557  efflux ABC transporter permease  26.28 
 
 		 804 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0616  efflux ABC transporter permease  26.28 
 
 		 804 aa  182  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3019  efflux ABC transporter, permease protein  26.91 
 
 		 809 aa  182  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00602267  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27140  hypothetical protein  27.82 
 
 		 830 aa  181  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3157  hypothetical protein  27 
 
 		 809 aa  181  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.513308  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  25.66 
 
 		 827 aa  181  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  24.16 
 
 		 840 aa  181  5.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1273  efflux ABC transporter permease  26.73 
 
 		 809 aa  180  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.924579 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  26.67 
 
 		 869 aa  180  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2957  hypothetical protein  24.11 
 
 		 810 aa  180  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133946  normal  0.10767 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0600  efflux ABC transporter, permease protein  25.03 
 
 		 804 aa  179  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.77559 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0545  efflux ABC transporter, permease protein  25.03 
 
 		 804 aa  179  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2318  hypothetical protein  28.39 
 
 		 871 aa  177  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2196  hypothetical protein  28.01 
 
 		 834 aa  177  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2785  protein of unknown function DUF214  26.74 
 
 		 857 aa  177  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.482364  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2896  hypothetical protein  25.52 
 
 		 821 aa  177  7e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431502 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00447  predicted inner membrane protein  24.85 
 
 		 804 aa  176  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0287  predicted permease  23.51 
 
 		 815 aa  176  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00452  hypothetical protein  24.85 
 
 		 804 aa  176  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0722  hypothetical protein  25.16 
 
 		 815 aa  176  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000480127  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3114  protein of unknown function DUF214  24.91 
 
 		 804 aa  175  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0535  efflux ABC transporter, permease protein  24.91 
 
 		 804 aa  175  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  28.22 
 
 		 863 aa  175  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0575  efflux ABC transporter, permease protein  24.91 
 
 		 804 aa  174  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>