195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3603 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2679  putative ABC transporter permease  69.81 
 
 		 842 aa  1032    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0339343  normal  0.926867 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3603  eflux ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 		 835 aa  1593    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.217562  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2271  hypothetical protein  61.74 
 
 		 842 aa  893    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276468  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3288  hypothetical protein  99.16 
 
 		 835 aa  1578    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3957  hypothetical protein  91.26 
 
 		 835 aa  1292    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1394  hypothetical protein  44.5 
 
 		 858 aa  579  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.472262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  41 
 
 		 856 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0087  ABC transporter, permease protein  41.22 
 
 		 849 aa  538  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3075  hypothetical protein  41.9 
 
 		 863 aa  526  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4056  protein of unknown function DUF214  40.6 
 
 		 847 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0387  putative ABC transporter, permease protein  40.79 
 
 		 856 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4181  hypothetical protein  41.46 
 
 		 848 aa  522  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.821525  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  41.67 
 
 		 851 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0829  hypothetical protein  42.22 
 
 		 871 aa  516  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270904  normal  0.305315 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  39.71 
 
 		 864 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0099  hypothetical protein  39.2 
 
 		 849 aa  514  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3352  hypothetical protein  42.79 
 
 		 869 aa  514  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3733  protein of unknown function DUF214  40.6 
 
 		 847 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0085  ABC transporter, permease protein  41.11 
 
 		 849 aa  512  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5469  hypothetical protein  41.09 
 
 		 862 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18562  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0286  hypothetical protein  40.67 
 
 		 860 aa  502  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463422  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1778  protein of unknown function DUF214  41.07 
 
 		 863 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1016  hypothetical protein  40.32 
 
 		 858 aa  490  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331004  normal  0.145704 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0550  hypothetical protein  40.17 
 
 		 858 aa  490  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0414  hypothetical protein  40.02 
 
 		 851 aa  486  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.336355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3687  hypothetical protein  67.64 
 
 		 840 aa  471  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3653  hypothetical protein  42.26 
 
 		 847 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2544  protein of unknown function DUF214  40.54 
 
 		 860 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519388  normal  0.0357395 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2226  protein of unknown function DUF214  40.57 
 
 		 862 aa  459  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0961704 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1757  hypothetical protein  42.92 
 
 		 851 aa  457  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2269  hypothetical protein  40.54 
 
 		 892 aa  457  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1671  protein of unknown function DUF214  37.19 
 
 		 844 aa  451  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0107522  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0411  hypothetical protein  37.4 
 
 		 852 aa  449  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.773219  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2222  protein of unknown function DUF214  34.33 
 
 		 935 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1913  protein of unknown function DUF214  38.86 
 
 		 882 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.549699 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0124  hypothetical protein  37.76 
 
 		 831 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0544905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0698  hypothetical protein  35.32 
 
 		 833 aa  403  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1276  hypothetical protein  38.63 
 
 		 838 aa  369  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53995  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1929  protein of unknown function DUF214  34.52 
 
 		 864 aa  363  8e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316143  normal  0.35107 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  30.3 
 
 		 835 aa  249  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2414  hypothetical protein  28.86 
 
 		 832 aa  239  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459172  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  28.77 
 
 		 832 aa  235  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  28.76 
 
 		 841 aa  229  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  28.24 
 
 		 829 aa  230  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2108  protein of unknown function DUF214  26.86 
 
 		 832 aa  226  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  30.38 
 
 		 870 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2110  protein of unknown function DUF214  27.01 
 
 		 833 aa  219  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6498  protein of unknown function DUF214  26.77 
 
 		 835 aa  218  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  29.99 
 
 		 844 aa  217  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  28.62 
 
 		 835 aa  217  7e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  30.98 
 
 		 843 aa  215  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  31.46 
 
 		 861 aa  208  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  29.91 
 
 		 844 aa  208  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  31.8 
 
 		 860 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  26.22 
 
 		 842 aa  201  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  30.08 
 
 		 826 aa  197  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0542  protein of unknown function DUF214  28.41 
 
 		 843 aa  196  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  28.83 
 
 		 858 aa  195  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  30.99 
 
 		 869 aa  195  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  31.05 
 
 		 874 aa  194  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1046  hypothetical protein  27.59 
 
 		 828 aa  193  9e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2896  hypothetical protein  26.32 
 
 		 821 aa  193  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431502 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3446  ABC transporter, permease protein, putative  24.51 
 
 		 828 aa  190  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000339618  hitchhiker  0.000208184 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  28.62 
 
 		 827 aa  188  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  26.31 
 
 		 840 aa  186  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1029  hypothetical protein  31.85 
 
 		 869 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4056  protein of unknown function DUF214  29.44 
 
 		 838 aa  185  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  28.81 
 
 		 840 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  30.7 
 
 		 856 aa  184  6e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2785  protein of unknown function DUF214  30.11 
 
 		 857 aa  183  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.482364  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  30.79 
 
 		 863 aa  183  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5607  hypothetical protein  30.23 
 
 		 871 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1480  hypothetical protein  26.68 
 
 		 833 aa  179  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  30.13 
 
 		 871 aa  179  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0898  hypothetical protein  29.01 
 
 		 851 aa  178  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3824  hypothetical protein  30.53 
 
 		 843 aa  178  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3458  hypothetical protein  30.23 
 
 		 857 aa  179  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.840481  normal  0.470717 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1539  hypothetical protein  26.55 
 
 		 833 aa  178  5e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274903 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1668  hypothetical protein  30.45 
 
 		 871 aa  177  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2280  hypothetical protein  30.45 
 
 		 871 aa  177  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1251  efflux ABC transporter, permease protein  31.96 
 
 		 883 aa  177  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1545  hypothetical protein  26.55 
 
 		 833 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1259  efflux ABC transporter, permease protein  31.96 
 
 		 880 aa  177  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356208  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1698  hypothetical protein  25.03 
 
 		 823 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.405062 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1597  protein of unknown function DUF214  23.18 
 
 		 861 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  29.27 
 
 		 831 aa  174  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1400  putative permease  31.96 
 
 		 1108 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2318  hypothetical protein  29.52 
 
 		 871 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1399  ABC transporter, permease protein  26.26 
 
 		 830 aa  174  7.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  23.01 
 
 		 836 aa  174  9e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0944  hypothetical protein  30.4 
 
 		 853 aa  173  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.69332 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27140  hypothetical protein  28 
 
 		 830 aa  172  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2196  hypothetical protein  29.65 
 
 		 834 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2618  hypothetical protein  27.84 
 
 		 842 aa  171  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.855589  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2401  hypothetical protein  26.72 
 
 		 816 aa  170  9e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.678425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0600  efflux ABC transporter, permease protein  24.94 
 
 		 804 aa  169  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.77559 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0722  hypothetical protein  24.59 
 
 		 815 aa  169  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000480127  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0545  efflux ABC transporter, permease protein  24.94 
 
 		 804 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  27.28 
 
 		 840 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3255  hypothetical protein  28.16 
 
 		 839 aa  168  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0335123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>