167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2222 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0411  hypothetical protein  58.57 
 
 		 852 aa  970    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.773219  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1671  protein of unknown function DUF214  43.45 
 
 		 844 aa  661    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0107522  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2222  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 935 aa  1800    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1394  hypothetical protein  38.5 
 
 		 858 aa  541  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.472262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  36.33 
 
 		 851 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  36.16 
 
 		 856 aa  493  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4181  hypothetical protein  35.26 
 
 		 848 aa  478  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.821525  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  35.14 
 
 		 864 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0099  hypothetical protein  34.82 
 
 		 849 aa  469  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0286  hypothetical protein  36.03 
 
 		 860 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463422  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_004310  BR0087  ABC transporter, permease protein  34.22 
 
 		 849 aa  459  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0414  hypothetical protein  36.66 
 
 		 851 aa  456  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.336355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0387  putative ABC transporter, permease protein  34.95 
 
 		 856 aa  458  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4056  protein of unknown function DUF214  34.19 
 
 		 847 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0829  hypothetical protein  34.64 
 
 		 871 aa  452  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270904  normal  0.305315 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2679  putative ABC transporter permease  35.22 
 
 		 842 aa  442  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0339343  normal  0.926867 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0085  ABC transporter, permease protein  34.22 
 
 		 849 aa  436  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3653  hypothetical protein  38.13 
 
 		 847 aa  435  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1016  hypothetical protein  35.5 
 
 		 858 aa  434  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331004  normal  0.145704 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3733  protein of unknown function DUF214  33.58 
 
 		 847 aa  426  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5469  hypothetical protein  35.19 
 
 		 862 aa  425  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18562  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1778  protein of unknown function DUF214  35.4 
 
 		 863 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3352  hypothetical protein  32.94 
 
 		 869 aa  396  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2271  hypothetical protein  32.62 
 
 		 842 aa  385  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276468  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3075  hypothetical protein  33.08 
 
 		 863 aa  382  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0698  hypothetical protein  32.19 
 
 		 833 aa  375  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0124  hypothetical protein  33.48 
 
 		 831 aa  375  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0544905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2226  protein of unknown function DUF214  34.39 
 
 		 862 aa  369  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0961704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2544  protein of unknown function DUF214  34.42 
 
 		 860 aa  368  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519388  normal  0.0357395 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2269  hypothetical protein  34.18 
 
 		 892 aa  362  1e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0550  hypothetical protein  36.82 
 
 		 858 aa  330  9e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1757  hypothetical protein  38.02 
 
 		 851 aa  307  7e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1150  hypothetical protein  31.15 
 
 		 847 aa  301  4e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1276  hypothetical protein  34.04 
 
 		 838 aa  291  3e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53995  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1929  protein of unknown function DUF214  35.91 
 
 		 864 aa  278  3e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316143  normal  0.35107 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3603  eflux ABC transporter inner membrane protein  35.01 
 
 		 835 aa  269  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.217562  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3288  hypothetical protein  35.17 
 
 		 835 aa  266  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3687  hypothetical protein  34.34 
 
 		 840 aa  259  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3957  hypothetical protein  34.91 
 
 		 835 aa  258  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2110  protein of unknown function DUF214  24.87 
 
 		 833 aa  233  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  26.13 
 
 		 841 aa  228  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2108  protein of unknown function DUF214  23.69 
 
 		 832 aa  220  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1913  protein of unknown function DUF214  37.08 
 
 		 882 aa  218  5e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.549699 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  28.18 
 
 		 844 aa  217  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  24.97 
 
 		 832 aa  216  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1597  protein of unknown function DUF214  24.82 
 
 		 861 aa  207  5e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2414  hypothetical protein  26.23 
 
 		 832 aa  197  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459172  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3824  hypothetical protein  28.05 
 
 		 843 aa  195  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  27.14 
 
 		 829 aa  194  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  29.81 
 
 		 874 aa  192  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  26.98 
 
 		 869 aa  188  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2015  hypothetical protein  27.73 
 
 		 844 aa  188  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  26.3 
 
 		 870 aa  185  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  26.3 
 
 		 827 aa  183  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  26.43 
 
 		 858 aa  183  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  29.8 
 
 		 831 aa  181  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  27.79 
 
 		 840 aa  180  9e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  28.83 
 
 		 856 aa  180  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  30.73 
 
 		 835 aa  179  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  28.9 
 
 		 826 aa  177  8e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0944  hypothetical protein  25.19 
 
 		 853 aa  176  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.69332 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  28.41 
 
 		 843 aa  176  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0542  protein of unknown function DUF214  29.88 
 
 		 843 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6498  protein of unknown function DUF214  22.99 
 
 		 835 aa  174  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  29.82 
 
 		 861 aa  172  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4056  protein of unknown function DUF214  28.55 
 
 		 838 aa  169  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2196  hypothetical protein  30.5 
 
 		 834 aa  166  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  30.24 
 
 		 840 aa  165  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2318  hypothetical protein  30.16 
 
 		 871 aa  163  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  29.18 
 
 		 860 aa  161  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  25.11 
 
 		 838 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2618  hypothetical protein  25.44 
 
 		 842 aa  155  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.855589  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2115  ABC efflux transporter, fused inner membrane subunits  23.89 
 
 		 882 aa  154  8e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.675122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5607  hypothetical protein  29 
 
 		 871 aa  154  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3255  hypothetical protein  30.29 
 
 		 839 aa  153  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0335123  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2436  hypothetical protein  23.2 
 
 		 870 aa  145  5e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3446  ABC transporter, permease protein, putative  22.01 
 
 		 828 aa  143  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000339618  hitchhiker  0.000208184 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1093  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  34.95 
 
 		 569 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0774  hypothetical protein  34.95 
 
 		 569 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1399  ABC transporter, permease protein  24.84 
 
 		 830 aa  142  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0898  hypothetical protein  25.41 
 
 		 851 aa  139  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2785  protein of unknown function DUF214  28.17 
 
 		 857 aa  137  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.482364  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27140  hypothetical protein  29.31 
 
 		 830 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3458  hypothetical protein  28.52 
 
 		 857 aa  135  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.840481  normal  0.470717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2316  hypothetical protein  30.49 
 
 		 832 aa  134  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000697167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1918  hypothetical protein  26.24 
 
 		 835 aa  134  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695603  hitchhiker  0.000000000000882803 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2296  hypothetical protein  29.05 
 
 		 833 aa  132  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3453  hypothetical protein  30.31 
 
 		 832 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000113684 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  24.76 
 
 		 840 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  25.93 
 
 		 838 aa  129  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  21.4 
 
 		 836 aa  127  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23050  hypothetical protein  30.03 
 
 		 833 aa  127  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.636342  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4016  hypothetical protein  28.04 
 
 		 834 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401086  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2560  hypothetical protein  30.39 
 
 		 834 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00315514  hitchhiker  0.00000000000119307 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0600  efflux ABC transporter, permease protein  24.45 
 
 		 804 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.77559 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1046  hypothetical protein  28.83 
 
 		 828 aa  120  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1124  hypothetical protein  22.73 
 
 		 809 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.101154  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0572  efflux ABC transporter permease  25.81 
 
 		 804 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.868504 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0562  efflux ABC transporter permease protein  25.81 
 
 		 804 aa  119  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1758  hypothetical protein  28.84 
 
 		 835 aa  119  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293557  hitchhiker  0.00000000277599 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>