174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1929 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1929  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 864 aa  1622    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316143  normal  0.35107 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1394  hypothetical protein  41.39 
 
 		 858 aa  518  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.472262  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0087  ABC transporter, permease protein  38.73 
 
 		 849 aa  451  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0099  hypothetical protein  38.11 
 
 		 849 aa  451  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4056  protein of unknown function DUF214  38.24 
 
 		 847 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3733  protein of unknown function DUF214  38.53 
 
 		 847 aa  446  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3075  hypothetical protein  38.39 
 
 		 863 aa  443  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  37.79 
 
 		 851 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  37.48 
 
 		 856 aa  436  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0387  putative ABC transporter, permease protein  36.96 
 
 		 856 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0829  hypothetical protein  37.59 
 
 		 871 aa  429  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270904  normal  0.305315 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4181  hypothetical protein  37.49 
 
 		 848 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.821525  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0085  ABC transporter, permease protein  38.6 
 
 		 849 aa  429  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0414  hypothetical protein  38.04 
 
 		 851 aa  419  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.336355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0286  hypothetical protein  37.36 
 
 		 860 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463422  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3352  hypothetical protein  37.83 
 
 		 869 aa  419  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  36.4 
 
 		 864 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0550  hypothetical protein  37.75 
 
 		 858 aa  403  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5469  hypothetical protein  37.29 
 
 		 862 aa  399  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18562  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1016  hypothetical protein  36.64 
 
 		 858 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331004  normal  0.145704 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3653  hypothetical protein  38.19 
 
 		 847 aa  393  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1913  protein of unknown function DUF214  35.81 
 
 		 882 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.549699 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2222  protein of unknown function DUF214  33.91 
 
 		 935 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2679  putative ABC transporter permease  35.16 
 
 		 842 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0339343  normal  0.926867 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1778  protein of unknown function DUF214  36.25 
 
 		 863 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2226  protein of unknown function DUF214  36.15 
 
 		 862 aa  382  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0961704 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0411  hypothetical protein  35.51 
 
 		 852 aa  379  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.773219  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2271  hypothetical protein  36.36 
 
 		 842 aa  378  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276468  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2269  hypothetical protein  35.8 
 
 		 892 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2544  protein of unknown function DUF214  35.8 
 
 		 860 aa  376  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519388  normal  0.0357395 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1671  protein of unknown function DUF214  33.72 
 
 		 844 aa  372  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0107522  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3603  eflux ABC transporter inner membrane protein  34.82 
 
 		 835 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.217562  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0124  hypothetical protein  35.36 
 
 		 831 aa  371  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0544905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3288  hypothetical protein  34.71 
 
 		 835 aa  369  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3957  hypothetical protein  34.55 
 
 		 835 aa  366  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1757  hypothetical protein  34.64 
 
 		 851 aa  343  7e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0698  hypothetical protein  32.99 
 
 		 833 aa  330  6e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1276  hypothetical protein  35.6 
 
 		 838 aa  313  5.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53995  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1150  hypothetical protein  34.82 
 
 		 847 aa  297  7e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  28.54 
 
 		 829 aa  238  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  28.57 
 
 		 827 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  28.49 
 
 		 838 aa  211  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  28.13 
 
 		 838 aa  208  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6498  protein of unknown function DUF214  26.91 
 
 		 835 aa  207  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850994  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1399  ABC transporter, permease protein  27.74 
 
 		 830 aa  204  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27140  hypothetical protein  30.02 
 
 		 830 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  27.34 
 
 		 841 aa  201  5e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  23.23 
 
 		 836 aa  200  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1597  protein of unknown function DUF214  25.09 
 
 		 861 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  29.35 
 
 		 856 aa  199  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  26.13 
 
 		 835 aa  197  6e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2108  protein of unknown function DUF214  24.88 
 
 		 832 aa  197  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0616  efflux ABC transporter permease  27.72 
 
 		 804 aa  197  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1273  efflux ABC transporter permease  27.34 
 
 		 809 aa  196  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.924579 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0545  efflux ABC transporter, permease protein  26.62 
 
 		 804 aa  196  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0557  efflux ABC transporter permease  27.6 
 
 		 804 aa  196  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  26.54 
 
 		 843 aa  195  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1159  hypothetical protein  27.46 
 
 		 810 aa  194  9e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184343 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0572  efflux ABC transporter permease  27.6 
 
 		 804 aa  193  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.868504 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0600  efflux ABC transporter, permease protein  26.46 
 
 		 804 aa  192  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.77559 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2618  hypothetical protein  28.96 
 
 		 842 aa  192  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.855589  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  28.35 
 
 		 826 aa  192  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3019  efflux ABC transporter, permease protein  26.98 
 
 		 809 aa  192  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00602267  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0562  efflux ABC transporter permease protein  27.29 
 
 		 804 aa  191  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0555  efflux ABC transporter, permease protein  27.48 
 
 		 804 aa  191  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3114  protein of unknown function DUF214  26.46 
 
 		 804 aa  190  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0535  efflux ABC transporter, permease protein  26.46 
 
 		 804 aa  190  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  29.16 
 
 		 874 aa  189  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  28.23 
 
 		 831 aa  189  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00447  predicted inner membrane protein  26.46 
 
 		 804 aa  188  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  26.24 
 
 		 844 aa  188  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3157  hypothetical protein  26.86 
 
 		 809 aa  188  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.513308  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3120  hypothetical protein  26.34 
 
 		 804 aa  189  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749019 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00452  hypothetical protein  26.46 
 
 		 804 aa  188  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2414  hypothetical protein  26.61 
 
 		 832 aa  188  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459172  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  23.71 
 
 		 840 aa  188  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0575  efflux ABC transporter, permease protein  26.34 
 
 		 804 aa  188  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2110  protein of unknown function DUF214  25.45 
 
 		 833 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0431  efflux ABC transporter, permease protein  26.58 
 
 		 805 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  25.09 
 
 		 835 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  25.74 
 
 		 858 aa  186  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  29.15 
 
 		 863 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1124  hypothetical protein  27.15 
 
 		 809 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.101154  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  23.98 
 
 		 842 aa  184  7e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  25.53 
 
 		 804 aa  183  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  23.43 
 
 		 832 aa  181  4.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3191  protein of unknown function DUF214  26.7 
 
 		 809 aa  180  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0495543  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5607  hypothetical protein  28.88 
 
 		 871 aa  180  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  26.59 
 
 		 844 aa  178  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  28.23 
 
 		 871 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0944  hypothetical protein  26.3 
 
 		 853 aa  174  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.69332 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2318  hypothetical protein  28.66 
 
 		 871 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3255  hypothetical protein  27.18 
 
 		 839 aa  172  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0335123  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1668  hypothetical protein  28.35 
 
 		 871 aa  172  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2280  hypothetical protein  28.35 
 
 		 871 aa  172  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2209  hypothetical protein  24.44 
 
 		 819 aa  172  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.795386  normal  0.224518 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2896  hypothetical protein  24.41 
 
 		 821 aa  170  9e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431502 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  28.23 
 
 		 860 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  27.86 
 
 		 861 aa  169  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1056  protein of unknown function DUF214  28.81 
 
 		 810 aa  169  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>