173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0411 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0411  hypothetical protein  100 
 
 		 852 aa  1687    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.773219  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1671  protein of unknown function DUF214  45.7 
 
 		 844 aa  676    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0107522  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2222  protein of unknown function DUF214  58.57 
 
 		 935 aa  988    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1394  hypothetical protein  39.55 
 
 		 858 aa  526  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.472262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  37.38 
 
 		 856 aa  485  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  36.36 
 
 		 864 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0099  hypothetical protein  35.79 
 
 		 849 aa  464  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0087  ABC transporter, permease protein  35.32 
 
 		 849 aa  462  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3352  hypothetical protein  37.1 
 
 		 869 aa  459  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3653  hypothetical protein  39.62 
 
 		 847 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4056  protein of unknown function DUF214  36.11 
 
 		 847 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0829  hypothetical protein  36.01 
 
 		 871 aa  455  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270904  normal  0.305315 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  35.61 
 
 		 851 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3075  hypothetical protein  37.94 
 
 		 863 aa  451  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0286  hypothetical protein  36.23 
 
 		 860 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463422  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0414  hypothetical protein  36.25 
 
 		 851 aa  444  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.336355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5469  hypothetical protein  36.78 
 
 		 862 aa  446  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18562  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3733  protein of unknown function DUF214  36.34 
 
 		 847 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4181  hypothetical protein  35.77 
 
 		 848 aa  438  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.821525  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0550  hypothetical protein  35.96 
 
 		 858 aa  438  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0387  putative ABC transporter, permease protein  35.23 
 
 		 856 aa  438  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0085  ABC transporter, permease protein  35.32 
 
 		 849 aa  437  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1778  protein of unknown function DUF214  36.66 
 
 		 863 aa  433  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1757  hypothetical protein  38.49 
 
 		 851 aa  431  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1016  hypothetical protein  34.94 
 
 		 858 aa  425  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331004  normal  0.145704 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3603  eflux ABC transporter inner membrane protein  36.74 
 
 		 835 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.217562  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2679  putative ABC transporter permease  37.08 
 
 		 842 aa  417  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0339343  normal  0.926867 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1913  protein of unknown function DUF214  36.15 
 
 		 882 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.549699 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3288  hypothetical protein  36.74 
 
 		 835 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3957  hypothetical protein  36.36 
 
 		 835 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2226  protein of unknown function DUF214  36.15 
 
 		 862 aa  388  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0961704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2544  protein of unknown function DUF214  36.08 
 
 		 860 aa  386  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519388  normal  0.0357395 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2271  hypothetical protein  34.67 
 
 		 842 aa  387  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276468  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3687  hypothetical protein  35.38 
 
 		 840 aa  383  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0698  hypothetical protein  33.61 
 
 		 833 aa  385  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2269  hypothetical protein  35.84 
 
 		 892 aa  383  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0124  hypothetical protein  34.99 
 
 		 831 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0544905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1929  protein of unknown function DUF214  34.84 
 
 		 864 aa  336  1e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316143  normal  0.35107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1276  hypothetical protein  33.68 
 
 		 838 aa  289  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53995  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1150  hypothetical protein  30.39 
 
 		 847 aa  270  5.9999999999999995e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  30.58 
 
 		 835 aa  265  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  27.25 
 
 		 829 aa  262  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  29.68 
 
 		 835 aa  251  6e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1029  hypothetical protein  30.79 
 
 		 869 aa  244  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  31.21 
 
 		 871 aa  243  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  26.17 
 
 		 832 aa  241  5e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  28.95 
 
 		 870 aa  240  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5607  hypothetical protein  30.92 
 
 		 871 aa  236  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  30.59 
 
 		 863 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6498  protein of unknown function DUF214  25.7 
 
 		 835 aa  234  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1668  hypothetical protein  30.9 
 
 		 871 aa  233  9e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2280  hypothetical protein  30.9 
 
 		 871 aa  233  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  27.25 
 
 		 841 aa  233  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  28.21 
 
 		 843 aa  231  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2108  protein of unknown function DUF214  24.82 
 
 		 832 aa  232  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0542  protein of unknown function DUF214  28.69 
 
 		 843 aa  231  5e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1251  efflux ABC transporter, permease protein  31.07 
 
 		 883 aa  230  9e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1259  efflux ABC transporter, permease protein  30.73 
 
 		 880 aa  230  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356208  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1400  putative permease  30.73 
 
 		 1108 aa  229  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  27.76 
 
 		 844 aa  228  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2196  hypothetical protein  31.43 
 
 		 834 aa  227  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2318  hypothetical protein  31.05 
 
 		 871 aa  226  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  29.62 
 
 		 831 aa  223  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  28.65 
 
 		 840 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  29.45 
 
 		 840 aa  221  5e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2110  protein of unknown function DUF214  25.64 
 
 		 833 aa  220  7.999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1918  hypothetical protein  29.1 
 
 		 835 aa  218  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695603  hitchhiker  0.000000000000882803 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  28.7 
 
 		 860 aa  217  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  28.31 
 
 		 861 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2414  hypothetical protein  26.6 
 
 		 832 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459172  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  26.68 
 
 		 844 aa  214  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1597  protein of unknown function DUF214  25.37 
 
 		 861 aa  211  5e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  26.79 
 
 		 869 aa  209  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2316  hypothetical protein  29.1 
 
 		 832 aa  208  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000697167 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  27.96 
 
 		 838 aa  207  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  28.26 
 
 		 838 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3453  hypothetical protein  29.2 
 
 		 832 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000113684 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  28.69 
 
 		 826 aa  202  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  27.5 
 
 		 858 aa  200  7e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3824  hypothetical protein  27.79 
 
 		 843 aa  197  9e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3255  hypothetical protein  28.94 
 
 		 839 aa  196  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0335123  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2785  protein of unknown function DUF214  26.93 
 
 		 857 aa  195  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.482364  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  29.24 
 
 		 874 aa  194  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0944  hypothetical protein  26.65 
 
 		 853 aa  194  7e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.69332 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2015  hypothetical protein  27.29 
 
 		 844 aa  193  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4056  protein of unknown function DUF214  28.32 
 
 		 838 aa  191  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3458  hypothetical protein  26.81 
 
 		 857 aa  191  5.999999999999999e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.840481  normal  0.470717 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  25.7 
 
 		 827 aa  190  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  28.74 
 
 		 856 aa  189  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1273  efflux ABC transporter permease  26.35 
 
 		 809 aa  187  6e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.924579 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3019  efflux ABC transporter, permease protein  26.1 
 
 		 809 aa  186  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00602267  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3157  hypothetical protein  26.47 
 
 		 809 aa  186  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.513308  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3446  ABC transporter, permease protein, putative  25.72 
 
 		 828 aa  184  9.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000339618  hitchhiker  0.000208184 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  22.13 
 
 		 836 aa  182  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0600  efflux ABC transporter, permease protein  24.47 
 
 		 804 aa  181  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.77559 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1758  hypothetical protein  28.15 
 
 		 835 aa  180  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293557  hitchhiker  0.00000000277599 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  24.27 
 
 		 840 aa  177  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  23.88 
 
 		 842 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0898  hypothetical protein  26.79 
 
 		 851 aa  171  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  25.18 
 
 		 804 aa  171  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>