228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4181 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2269  hypothetical protein  50.06 
 
 		 892 aa  686    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_004310  BR0087  ABC transporter, permease protein  60.71 
 
 		 849 aa  963    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0414  hypothetical protein  49.17 
 
 		 851 aa  728    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.336355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0829  hypothetical protein  46.28 
 
 		 871 aa  659    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270904  normal  0.305315 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4181  hypothetical protein  100 
 
 		 848 aa  1675    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.821525  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0286  hypothetical protein  49.64 
 
 		 860 aa  717    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463422  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  50.12 
 
 		 851 aa  757    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  49.52 
 
 		 864 aa  738    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0550  hypothetical protein  48.8 
 
 		 858 aa  717    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4056  protein of unknown function DUF214  72.21 
 
 		 847 aa  1187    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1757  hypothetical protein  47.34 
 
 		 851 aa  640    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3352  hypothetical protein  62.26 
 
 		 869 aa  951    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0085  ABC transporter, permease protein  60.71 
 
 		 849 aa  932    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0099  hypothetical protein  60.48 
 
 		 849 aa  966    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3733  protein of unknown function DUF214  72.09 
 
 		 847 aa  1171    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  51.07 
 
 		 856 aa  775    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3075  hypothetical protein  67.66 
 
 		 863 aa  1071    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1016  hypothetical protein  49.59 
 
 		 858 aa  741    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331004  normal  0.145704 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2226  protein of unknown function DUF214  50.47 
 
 		 862 aa  686    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0961704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1778  protein of unknown function DUF214  51.78 
 
 		 863 aa  754    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5469  hypothetical protein  51.01 
 
 		 862 aa  756    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18562  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0387  putative ABC transporter, permease protein  48.46 
 
 		 856 aa  716    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1394  hypothetical protein  47.62 
 
 		 858 aa  712    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.472262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2544  protein of unknown function DUF214  50.24 
 
 		 860 aa  690    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519388  normal  0.0357395 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1913  protein of unknown function DUF214  46.85 
 
 		 882 aa  625  1e-177  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.549699 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3653  hypothetical protein  44.66 
 
 		 847 aa  560  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1671  protein of unknown function DUF214  37.13 
 
 		 844 aa  526  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0107522  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2679  putative ABC transporter permease  41.37 
 
 		 842 aa  525  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0339343  normal  0.926867 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2222  protein of unknown function DUF214  35.26 
 
 		 935 aa  512  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0698  hypothetical protein  38.72 
 
 		 833 aa  496  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0124  hypothetical protein  41.48 
 
 		 831 aa  496  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0544905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3957  hypothetical protein  41.16 
 
 		 835 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3603  eflux ABC transporter inner membrane protein  41.1 
 
 		 835 aa  492  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.217562  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2271  hypothetical protein  39.22 
 
 		 842 aa  491  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276468  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3288  hypothetical protein  41.04 
 
 		 835 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3687  hypothetical protein  40.38 
 
 		 840 aa  474  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0411  hypothetical protein  35.91 
 
 		 852 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.773219  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1150  hypothetical protein  36.5 
 
 		 847 aa  425  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1929  protein of unknown function DUF214  37.08 
 
 		 864 aa  412  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316143  normal  0.35107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1276  hypothetical protein  38.06 
 
 		 838 aa  379  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53995  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  29.4 
 
 		 841 aa  282  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0542  protein of unknown function DUF214  30.35 
 
 		 843 aa  281  4e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  26.94 
 
 		 835 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6498  protein of unknown function DUF214  26.88 
 
 		 835 aa  250  7e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  27.36 
 
 		 835 aa  243  7e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1399  ABC transporter, permease protein  27.38 
 
 		 830 aa  235  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  25.98 
 
 		 829 aa  235  3e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  28.33 
 
 		 832 aa  235  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1597  protein of unknown function DUF214  25.4 
 
 		 861 aa  232  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  25.55 
 
 		 836 aa  231  5e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  29.63 
 
 		 840 aa  226  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2108  protein of unknown function DUF214  24.65 
 
 		 832 aa  224  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  28.12 
 
 		 843 aa  224  4.9999999999999996e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  27.84 
 
 		 844 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2110  protein of unknown function DUF214  24.8 
 
 		 833 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  28.42 
 
 		 838 aa  211  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1046  hypothetical protein  27.65 
 
 		 828 aa  211  6e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  25.4 
 
 		 842 aa  210  7e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  27.28 
 
 		 838 aa  206  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  24.24 
 
 		 840 aa  205  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2414  hypothetical protein  24.78 
 
 		 832 aa  204  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459172  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  27.91 
 
 		 826 aa  203  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  27.28 
 
 		 844 aa  202  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2957  hypothetical protein  24.65 
 
 		 810 aa  198  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133946  normal  0.10767 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  27.14 
 
 		 831 aa  198  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2618  hypothetical protein  27.48 
 
 		 842 aa  197  7e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.855589  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23050  hypothetical protein  28.39 
 
 		 833 aa  195  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.636342  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3191  protein of unknown function DUF214  26.85 
 
 		 809 aa  196  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0495543  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1124  hypothetical protein  26.67 
 
 		 809 aa  194  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.101154  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0287  predicted permease  23.71 
 
 		 815 aa  193  9e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1918  hypothetical protein  27.85 
 
 		 835 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695603  hitchhiker  0.000000000000882803 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  26.48 
 
 		 870 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  26.01 
 
 		 858 aa  191  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  26.85 
 
 		 871 aa  189  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  26.27 
 
 		 804 aa  188  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2785  protein of unknown function DUF214  28.11 
 
 		 857 aa  188  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.482364  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3255  hypothetical protein  27.53 
 
 		 839 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0335123  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2318  hypothetical protein  27.08 
 
 		 871 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0557  efflux ABC transporter permease  27.92 
 
 		 804 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0572  efflux ABC transporter permease  27.92 
 
 		 804 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.868504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  26.26 
 
 		 861 aa  185  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3157  hypothetical protein  26.45 
 
 		 809 aa  185  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.513308  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  26.39 
 
 		 860 aa  185  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0562  efflux ABC transporter permease protein  27.92 
 
 		 804 aa  185  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3458  hypothetical protein  27.99 
 
 		 857 aa  185  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.840481  normal  0.470717 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  29.1 
 
 		 856 aa  185  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1273  efflux ABC transporter permease  26.58 
 
 		 809 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.924579 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0616  efflux ABC transporter permease  27.89 
 
 		 804 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27140  hypothetical protein  27.53 
 
 		 830 aa  184  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3019  efflux ABC transporter, permease protein  26.58 
 
 		 809 aa  184  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00602267  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2196  hypothetical protein  27.36 
 
 		 834 aa  184  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1668  hypothetical protein  26.94 
 
 		 871 aa  184  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2280  hypothetical protein  26.94 
 
 		 871 aa  184  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  26.6 
 
 		 840 aa  183  9.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  27.26 
 
 		 869 aa  182  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0555  efflux ABC transporter, permease protein  27.8 
 
 		 804 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3446  ABC transporter, permease protein, putative  25.66 
 
 		 828 aa  182  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000339618  hitchhiker  0.000208184 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  28.8 
 
 		 874 aa  181  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4016  hypothetical protein  25.83 
 
 		 834 aa  181  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401086  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1159  hypothetical protein  28.09 
 
 		 810 aa  181  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>