253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2269 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1757  hypothetical protein  52.96 
 
 		 851 aa  723    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1394  hypothetical protein  50.53 
 
 		 858 aa  697    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.472262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1016  hypothetical protein  70.3 
 
 		 858 aa  1081    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331004  normal  0.145704 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2269  hypothetical protein  100 
 
 		 892 aa  1722    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3075  hypothetical protein  51.64 
 
 		 863 aa  723    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0087  ABC transporter, permease protein  50.41 
 
 		 849 aa  762    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0414  hypothetical protein  55.8 
 
 		 851 aa  818    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.336355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0829  hypothetical protein  51.83 
 
 		 871 aa  731    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270904  normal  0.305315 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1913  protein of unknown function DUF214  51.95 
 
 		 882 aa  701    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.549699 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0099  hypothetical protein  50.89 
 
 		 849 aa  765    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2226  protein of unknown function DUF214  94.2 
 
 		 862 aa  1360    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0961704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2544  protein of unknown function DUF214  99.19 
 
 		 860 aa  1634    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519388  normal  0.0357395 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0286  hypothetical protein  54.28 
 
 		 860 aa  795    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463422  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  54.48 
 
 		 851 aa  831    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0387  putative ABC transporter, permease protein  52.17 
 
 		 856 aa  787    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  53.79 
 
 		 864 aa  808    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0550  hypothetical protein  55.06 
 
 		 858 aa  813    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3352  hypothetical protein  50.83 
 
 		 869 aa  706    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4181  hypothetical protein  50 
 
 		 848 aa  727    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.821525  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  54.75 
 
 		 856 aa  842    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5469  hypothetical protein  69.64 
 
 		 862 aa  1081    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18562  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3733  protein of unknown function DUF214  51.06 
 
 		 847 aa  741    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4056  protein of unknown function DUF214  51.3 
 
 		 847 aa  751    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0085  ABC transporter, permease protein  50.41 
 
 		 849 aa  731    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1778  protein of unknown function DUF214  69.99 
 
 		 863 aa  1059    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3653  hypothetical protein  43.5 
 
 		 847 aa  503  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2679  putative ABC transporter permease  40.64 
 
 		 842 aa  494  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0339343  normal  0.926867 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0124  hypothetical protein  42.8 
 
 		 831 aa  489  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0544905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3603  eflux ABC transporter inner membrane protein  40.09 
 
 		 835 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.217562  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0698  hypothetical protein  40.47 
 
 		 833 aa  481  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1671  protein of unknown function DUF214  37.63 
 
 		 844 aa  480  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0107522  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3288  hypothetical protein  39.98 
 
 		 835 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3957  hypothetical protein  39.65 
 
 		 835 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2271  hypothetical protein  37.56 
 
 		 842 aa  439  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276468  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3687  hypothetical protein  39.18 
 
 		 840 aa  436  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0411  hypothetical protein  36.34 
 
 		 852 aa  431  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.773219  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2222  protein of unknown function DUF214  34.68 
 
 		 935 aa  429  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1150  hypothetical protein  36.14 
 
 		 847 aa  393  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1276  hypothetical protein  39.29 
 
 		 838 aa  391  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53995  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1929  protein of unknown function DUF214  35.74 
 
 		 864 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316143  normal  0.35107 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6498  protein of unknown function DUF214  27.71 
 
 		 835 aa  272  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  29.09 
 
 		 829 aa  249  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  29.23 
 
 		 841 aa  247  6e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1597  protein of unknown function DUF214  24.11 
 
 		 861 aa  243  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2108  protein of unknown function DUF214  25.65 
 
 		 832 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  28.05 
 
 		 835 aa  235  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  28.8 
 
 		 840 aa  229  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  28.54 
 
 		 844 aa  228  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1399  ABC transporter, permease protein  28.3 
 
 		 830 aa  224  6e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  27.57 
 
 		 832 aa  221  3.9999999999999997e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  28.33 
 
 		 844 aa  218  4e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  28.21 
 
 		 843 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1918  hypothetical protein  28.84 
 
 		 835 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695603  hitchhiker  0.000000000000882803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2110  protein of unknown function DUF214  26.11 
 
 		 833 aa  214  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  28.61 
 
 		 826 aa  209  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2414  hypothetical protein  25.61 
 
 		 832 aa  208  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459172  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0542  protein of unknown function DUF214  27.75 
 
 		 843 aa  209  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3255  hypothetical protein  28.75 
 
 		 839 aa  206  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0335123  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  29.69 
 
 		 871 aa  206  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3446  ABC transporter, permease protein, putative  25.5 
 
 		 828 aa  204  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000339618  hitchhiker  0.000208184 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1668  hypothetical protein  29.4 
 
 		 871 aa  202  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2280  hypothetical protein  29.4 
 
 		 871 aa  202  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  26.25 
 
 		 838 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27140  hypothetical protein  28.66 
 
 		 830 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3824  hypothetical protein  30.18 
 
 		 843 aa  200  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  26.63 
 
 		 838 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  26.02 
 
 		 835 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  30.35 
 
 		 863 aa  199  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0722  hypothetical protein  27.53 
 
 		 815 aa  198  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000480127  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2785  protein of unknown function DUF214  28.89 
 
 		 857 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.482364  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5607  hypothetical protein  29.35 
 
 		 871 aa  197  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  27.3 
 
 		 827 aa  196  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  26.01 
 
 		 842 aa  195  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2196  hypothetical protein  29.58 
 
 		 834 aa  194  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3458  hypothetical protein  28.64 
 
 		 857 aa  194  8e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.840481  normal  0.470717 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05800  hypothetical protein  24.76 
 
 		 818 aa  194  9e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  28.52 
 
 		 840 aa  193  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2015  hypothetical protein  29.53 
 
 		 844 aa  192  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1046  hypothetical protein  27.07 
 
 		 828 aa  191  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2436  hypothetical protein  25.61 
 
 		 870 aa  191  5e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  26.43 
 
 		 870 aa  190  9e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2115  ABC efflux transporter, fused inner membrane subunits  25.46 
 
 		 882 aa  189  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.675122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  28.52 
 
 		 860 aa  189  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  27.77 
 
 		 869 aa  189  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000166  predicted ABC-type transport system permease component  23.48 
 
 		 818 aa  189  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2318  hypothetical protein  29.24 
 
 		 871 aa  188  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  27.76 
 
 		 831 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  27.69 
 
 		 858 aa  184  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  23.85 
 
 		 836 aa  183  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  27.76 
 
 		 861 aa  183  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  29.58 
 
 		 874 aa  182  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2618  hypothetical protein  28.82 
 
 		 842 aa  181  7e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.855589  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  23.64 
 
 		 840 aa  178  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  26.29 
 
 		 804 aa  178  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0431  efflux ABC transporter, permease protein  26.37 
 
 		 805 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  29.3 
 
 		 856 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2957  hypothetical protein  24.87 
 
 		 810 aa  170  9e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133946  normal  0.10767 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1029  hypothetical protein  28.13 
 
 		 869 aa  170  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2896  hypothetical protein  24.32 
 
 		 821 aa  169  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431502 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0073  hypothetical protein  24.3 
 
 		 884 aa  169  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>