204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3687 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_2679  putative ABC transporter permease  65.95 
 
 
842 aa  960    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0339343  normal  0.926867 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3603  eflux ABC transporter inner membrane protein  62.54 
 
 
835 aa  882    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.217562  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3687  hypothetical protein  100 
 
 
840 aa  1604    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2271  hypothetical protein  59.29 
 
 
842 aa  875    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276468  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3288  hypothetical protein  62.43 
 
 
835 aa  882    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3957  hypothetical protein  62.71 
 
 
835 aa  889    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1394  hypothetical protein  42.77 
 
 
858 aa  551  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.472262  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  41.25 
 
 
856 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  41.13 
 
 
851 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0387  putative ABC transporter, permease protein  40.68 
 
 
856 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0099  hypothetical protein  39.43 
 
 
849 aa  510  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3352  hypothetical protein  40.85 
 
 
869 aa  508  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0087  ABC transporter, permease protein  38.8 
 
 
849 aa  503  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4181  hypothetical protein  40.61 
 
 
848 aa  504  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.821525  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3075  hypothetical protein  40.35 
 
 
863 aa  501  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4056  protein of unknown function DUF214  39.05 
 
 
847 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0286  hypothetical protein  39.41 
 
 
860 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463422  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  39.29 
 
 
864 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3733  protein of unknown function DUF214  39.76 
 
 
847 aa  489  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454912  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0414  hypothetical protein  39.69 
 
 
851 aa  482  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.336355  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0550  hypothetical protein  39.23 
 
 
858 aa  480  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0085  ABC transporter, permease protein  38.68 
 
 
849 aa  477  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1016  hypothetical protein  38.8 
 
 
858 aa  457  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331004  normal  0.145704 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3653  hypothetical protein  41.42 
 
 
847 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5469  hypothetical protein  38.37 
 
 
862 aa  451  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18562  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1778  protein of unknown function DUF214  38.04 
 
 
863 aa  451  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0829  hypothetical protein  37.97 
 
 
871 aa  448  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270904  normal  0.305315 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1671  protein of unknown function DUF214  35.59 
 
 
844 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0107522  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1757  hypothetical protein  40.82 
 
 
851 aa  442  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2222  protein of unknown function DUF214  33.94 
 
 
935 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2269  hypothetical protein  39.6 
 
 
892 aa  424  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0411  hypothetical protein  36.15 
 
 
852 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.773219  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2226  protein of unknown function DUF214  39.65 
 
 
862 aa  423  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0961704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2544  protein of unknown function DUF214  39.65 
 
 
860 aa  426  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519388  normal  0.0357395 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1913  protein of unknown function DUF214  38.31 
 
 
882 aa  411  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.549699 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0124  hypothetical protein  37.58 
 
 
831 aa  391  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0544905  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1276  hypothetical protein  38.34 
 
 
838 aa  363  5.0000000000000005e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53995  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1929  protein of unknown function DUF214  33.37 
 
 
864 aa  328  2.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316143  normal  0.35107 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1150  hypothetical protein  32.25 
 
 
847 aa  283  9e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2108  protein of unknown function DUF214  26.75 
 
 
832 aa  234  5e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  28.88 
 
 
841 aa  229  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  28.98 
 
 
829 aa  224  7e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  27.49 
 
 
835 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2110  protein of unknown function DUF214  26.67 
 
 
833 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0698  hypothetical protein  34.06 
 
 
833 aa  209  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6498  protein of unknown function DUF214  26.05 
 
 
835 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850994  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  27.54 
 
 
804 aa  201  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  27.04 
 
 
835 aa  200  7e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2414  hypothetical protein  26.24 
 
 
832 aa  194  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459172  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2896  hypothetical protein  25.62 
 
 
821 aa  194  7e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000431502 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  29.2 
 
 
844 aa  193  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  27.23 
 
 
832 aa  191  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  28.05 
 
 
840 aa  189  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1597  protein of unknown function DUF214  24.52 
 
 
861 aa  189  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  27.77 
 
 
844 aa  187  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  28.84 
 
 
843 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  27 
 
 
827 aa  183  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0616  efflux ABC transporter permease  27.71 
 
 
804 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1124  hypothetical protein  24.97 
 
 
809 aa  181  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.101154  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0557  efflux ABC transporter permease  27.71 
 
 
804 aa  181  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0572  efflux ABC transporter permease  27.71 
 
 
804 aa  180  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.868504 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  28.55 
 
 
826 aa  180  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0542  protein of unknown function DUF214  26.41 
 
 
843 aa  179  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0562  efflux ABC transporter permease protein  27.71 
 
 
804 aa  179  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336553  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0555  efflux ABC transporter, permease protein  27.61 
 
 
804 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3191  protein of unknown function DUF214  25.27 
 
 
809 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0495543  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  25.06 
 
 
840 aa  175  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0600  efflux ABC transporter, permease protein  26.54 
 
 
804 aa  174  7.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.77559 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0545  efflux ABC transporter, permease protein  26.54 
 
 
804 aa  172  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0431  efflux ABC transporter, permease protein  26.17 
 
 
805 aa  172  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0535  efflux ABC transporter, permease protein  26.42 
 
 
804 aa  170  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1273  efflux ABC transporter permease  24.64 
 
 
809 aa  170  9e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.924579 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3157  hypothetical protein  24.52 
 
 
809 aa  170  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.513308  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3114  protein of unknown function DUF214  26.42 
 
 
804 aa  170  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00447  predicted inner membrane protein  26.42 
 
 
804 aa  169  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0575  efflux ABC transporter, permease protein  26.45 
 
 
804 aa  169  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3446  ABC transporter, permease protein, putative  25.06 
 
 
828 aa  169  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000339618  hitchhiker  0.000208184 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00452  hypothetical protein  26.42 
 
 
804 aa  169  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3019  efflux ABC transporter, permease protein  24.55 
 
 
809 aa  169  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00602267  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3120  hypothetical protein  26.45 
 
 
804 aa  168  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000749019 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  27.79 
 
 
860 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1159  hypothetical protein  26.09 
 
 
810 aa  167  9e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184343 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  29.35 
 
 
856 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  25.42 
 
 
842 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  27.32 
 
 
870 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  26.6 
 
 
858 aa  164  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  28.03 
 
 
861 aa  163  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2366  hypothetical protein  24.73 
 
 
827 aa  160  9e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.197088  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  27.59 
 
 
869 aa  160  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2618  hypothetical protein  27.78 
 
 
842 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.855589  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  26.93 
 
 
831 aa  155  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0944  hypothetical protein  27.48 
 
 
853 aa  154  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.69332 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0287  predicted permease  23.3 
 
 
815 aa  153  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3255  hypothetical protein  27.16 
 
 
839 aa  152  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0335123  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  27.92 
 
 
874 aa  152  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1056  protein of unknown function DUF214  25.1 
 
 
810 aa  151  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27140  hypothetical protein  27.59 
 
 
830 aa  151  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1029  hypothetical protein  29.2 
 
 
869 aa  150  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3824  hypothetical protein  28.02 
 
 
843 aa  150  8e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936763  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2015  hypothetical protein  27.47 
 
 
844 aa  150  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>