193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1029 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  55.78 
 
 
843 aa  810    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  79.58 
 
 
863 aa  1162    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  55.12 
 
 
844 aa  808    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  55.01 
 
 
869 aa  796    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1400  putative permease  93.3 
 
 
1108 aa  1366    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  79.81 
 
 
871 aa  1192    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5607  hypothetical protein  79.23 
 
 
871 aa  1184    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616708  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2196  hypothetical protein  79.03 
 
 
834 aa  1130    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1029  hypothetical protein  100 
 
 
869 aa  1662    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  73.65 
 
 
860 aa  1137    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  71.8 
 
 
870 aa  1125    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  73.76 
 
 
861 aa  1144    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0898  hypothetical protein  54.25 
 
 
851 aa  752    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1668  hypothetical protein  79.7 
 
 
871 aa  1181    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4056  protein of unknown function DUF214  48 
 
 
838 aa  636    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2318  hypothetical protein  78.75 
 
 
871 aa  1149    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2280  hypothetical protein  79.7 
 
 
871 aa  1181    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1093  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  94.59 
 
 
569 aa  883    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0774  hypothetical protein  94.59 
 
 
569 aa  883    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1251  efflux ABC transporter, permease protein  92.98 
 
 
883 aa  1360    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1259  efflux ABC transporter, permease protein  93.41 
 
 
880 aa  1369    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356208  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  55.01 
 
 
844 aa  829    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  46.34 
 
 
858 aa  627  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  49.13 
 
 
856 aa  625  1e-178  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  42.56 
 
 
835 aa  624  1e-177  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0944  hypothetical protein  46.42 
 
 
853 aa  622  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.69332 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  42.37 
 
 
832 aa  620  1e-176  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  45.68 
 
 
840 aa  618  1e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  48.51 
 
 
874 aa  612  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2015  hypothetical protein  46.47 
 
 
844 aa  611  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  44.37 
 
 
827 aa  599  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3255  hypothetical protein  45.31 
 
 
839 aa  598  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0335123  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3824  hypothetical protein  47.36 
 
 
843 aa  596  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936763  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2785  protein of unknown function DUF214  46.38 
 
 
857 aa  594  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.482364  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3458  hypothetical protein  46.26 
 
 
857 aa  591  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.840481  normal  0.470717 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0533  hypothetical protein  46.71 
 
 
840 aa  568  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  39.86 
 
 
829 aa  557  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  39.83 
 
 
835 aa  546  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  40.47 
 
 
840 aa  505  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  39.88 
 
 
826 aa  498  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  41.01 
 
 
831 aa  498  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  37.11 
 
 
838 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  37.22 
 
 
838 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1918  hypothetical protein  37.5 
 
 
835 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695603  hitchhiker  0.000000000000882803 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1399  ABC transporter, permease protein  35.65 
 
 
830 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2316  hypothetical protein  37.34 
 
 
832 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000697167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3453  hypothetical protein  37.22 
 
 
832 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000113684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4016  hypothetical protein  35.89 
 
 
834 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401086  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2618  hypothetical protein  39.09 
 
 
842 aa  428  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.855589  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23050  hypothetical protein  37.62 
 
 
833 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.636342  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  33.18 
 
 
840 aa  422  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27140  hypothetical protein  37.24 
 
 
830 aa  422  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  32.1 
 
 
842 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1092  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  89.02 
 
 
287 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0775  putative permease  89.02 
 
 
287 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.254557  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1758  hypothetical protein  37.26 
 
 
835 aa  412  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293557  hitchhiker  0.00000000277599 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2296  hypothetical protein  35.64 
 
 
833 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0008  protein of unknown function DUF214  37.79 
 
 
836 aa  397  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2560  hypothetical protein  37.44 
 
 
834 aa  398  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00315514  hitchhiker  0.00000000000119307 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0684  hypothetical protein  37.23 
 
 
829 aa  393  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.852275  normal  0.517784 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 
836 aa  392  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3446  ABC transporter, permease protein, putative  31.88 
 
 
828 aa  385  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000339618  hitchhiker  0.000208184 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1046  hypothetical protein  33.83 
 
 
828 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2066  hypothetical protein  38.35 
 
 
835 aa  366  1e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2209  hypothetical protein  30.4 
 
 
819 aa  361  3e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.795386  normal  0.224518 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0649  protein of unknown function DUF214  37.66 
 
 
838 aa  353  5.9999999999999994e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  32.7 
 
 
804 aa  350  5e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3191  protein of unknown function DUF214  31.83 
 
 
809 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0495543  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0616  efflux ABC transporter permease  32.38 
 
 
804 aa  338  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2896  hypothetical protein  29.68 
 
 
821 aa  336  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000431502 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3019  efflux ABC transporter, permease protein  32.7 
 
 
809 aa  336  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00602267  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1124  hypothetical protein  31.14 
 
 
809 aa  335  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.101154  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0600  efflux ABC transporter, permease protein  31.59 
 
 
804 aa  334  3e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.77559 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0545  efflux ABC transporter, permease protein  31.59 
 
 
804 aa  335  3e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3157  hypothetical protein  32.7 
 
 
809 aa  335  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.513308  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1273  efflux ABC transporter permease  32.4 
 
 
809 aa  334  5e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.924579 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0557  efflux ABC transporter permease  32.26 
 
 
804 aa  333  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0555  efflux ABC transporter, permease protein  32.26 
 
 
804 aa  333  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3114  protein of unknown function DUF214  31.71 
 
 
804 aa  332  2e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0535  efflux ABC transporter, permease protein  31.47 
 
 
804 aa  332  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0575  efflux ABC transporter, permease protein  31.47 
 
 
804 aa  332  2e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0562  efflux ABC transporter permease protein  32.26 
 
 
804 aa  331  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336553  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3120  hypothetical protein  31.47 
 
 
804 aa  331  3e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000749019 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00447  predicted inner membrane protein  31.47 
 
 
804 aa  331  4e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00452  hypothetical protein  31.47 
 
 
804 aa  331  4e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0431  efflux ABC transporter, permease protein  31.76 
 
 
805 aa  327  9e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1698  hypothetical protein  29.35 
 
 
823 aa  326  1e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.405062 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0551  hypothetical protein  29.11 
 
 
823 aa  325  3e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.454209  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0572  efflux ABC transporter permease  32.19 
 
 
804 aa  325  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.868504 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1487  ABC transporter, permease, putative  30.7 
 
 
818 aa  324  4e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04662  oxidoreductase  36.47 
 
 
824 aa  323  8e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1056  protein of unknown function DUF214  33.41 
 
 
810 aa  315  2.9999999999999996e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3003  protein of unknown function DUF214  33.05 
 
 
810 aa  306  8.000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.558274  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1159  hypothetical protein  32.39 
 
 
810 aa  301  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184343 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0287  predicted permease  28.47 
 
 
815 aa  301  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1662  hypothetical protein  29.13 
 
 
817 aa  295  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000552359  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1545  hypothetical protein  30.01 
 
 
833 aa  295  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1539  hypothetical protein  30.01 
 
 
833 aa  295  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274903 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1480  hypothetical protein  30.13 
 
 
833 aa  295  4e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2401  hypothetical protein  29.46 
 
 
816 aa  293  7e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.678425  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>