More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0414 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2226  protein of unknown function DUF214  55.52 
 
 		 862 aa  753    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0961704 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  75.39 
 
 		 856 aa  1206    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0087  ABC transporter, permease protein  48.58 
 
 		 849 aa  751    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1394  hypothetical protein  50.94 
 
 		 858 aa  749    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.472262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4181  hypothetical protein  49.17 
 
 		 848 aa  729    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.821525  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2544  protein of unknown function DUF214  56.04 
 
 		 860 aa  775    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519388  normal  0.0357395 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0085  ABC transporter, permease protein  48.58 
 
 		 849 aa  719    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0414  hypothetical protein  100 
 
 		 851 aa  1656    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.336355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0387  putative ABC transporter, permease protein  73.96 
 
 		 856 aa  1186    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2269  hypothetical protein  55.8 
 
 		 892 aa  768    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5469  hypothetical protein  57.79 
 
 		 862 aa  881    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18562  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3733  protein of unknown function DUF214  49.64 
 
 		 847 aa  723    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1757  hypothetical protein  53.51 
 
 		 851 aa  756    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3075  hypothetical protein  50.12 
 
 		 863 aa  712    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0286  hypothetical protein  74.94 
 
 		 860 aa  1157    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463422  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0099  hypothetical protein  50.48 
 
 		 849 aa  773    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  76.46 
 
 		 851 aa  1219    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  75.29 
 
 		 864 aa  1187    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0550  hypothetical protein  87.07 
 
 		 858 aa  1357    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1016  hypothetical protein  57.57 
 
 		 858 aa  841    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331004  normal  0.145704 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3352  hypothetical protein  48.52 
 
 		 869 aa  709    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0829  hypothetical protein  50.89 
 
 		 871 aa  726    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270904  normal  0.305315 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4056  protein of unknown function DUF214  49.58 
 
 		 847 aa  741    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1913  protein of unknown function DUF214  50.64 
 
 		 882 aa  713    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.549699 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1778  protein of unknown function DUF214  58.01 
 
 		 863 aa  858    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2679  putative ABC transporter permease  40.8 
 
 		 842 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0339343  normal  0.926867 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1671  protein of unknown function DUF214  37.54 
 
 		 844 aa  511  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0107522  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2222  protein of unknown function DUF214  36.98 
 
 		 935 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0698  hypothetical protein  39.91 
 
 		 833 aa  508  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3653  hypothetical protein  43.18 
 
 		 847 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0124  hypothetical protein  41.34 
 
 		 831 aa  473  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0544905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2271  hypothetical protein  38.52 
 
 		 842 aa  468  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276468  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3603  eflux ABC transporter inner membrane protein  39.93 
 
 		 835 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.217562  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3957  hypothetical protein  39.51 
 
 		 835 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0411  hypothetical protein  36.12 
 
 		 852 aa  457  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.773219  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3288  hypothetical protein  39.58 
 
 		 835 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3687  hypothetical protein  39.5 
 
 		 840 aa  442  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1150  hypothetical protein  37.46 
 
 		 847 aa  391  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1929  protein of unknown function DUF214  38.22 
 
 		 864 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316143  normal  0.35107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1276  hypothetical protein  37.62 
 
 		 838 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53995  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6498  protein of unknown function DUF214  25.5 
 
 		 835 aa  242  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  26.64 
 
 		 835 aa  240  8e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  26.98 
 
 		 829 aa  230  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  27.09 
 
 		 841 aa  228  4e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1597  protein of unknown function DUF214  24.3 
 
 		 861 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2108  protein of unknown function DUF214  24.25 
 
 		 832 aa  213  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  28.33 
 
 		 840 aa  212  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1399  ABC transporter, permease protein  26.31 
 
 		 830 aa  212  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  29.07 
 
 		 844 aa  211  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2110  protein of unknown function DUF214  25.49 
 
 		 833 aa  208  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  27.26 
 
 		 843 aa  206  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  25.17 
 
 		 836 aa  206  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  25.97 
 
 		 832 aa  205  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  27.86 
 
 		 869 aa  203  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 		 844 aa  202  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  24.8 
 
 		 840 aa  202  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  25.49 
 
 		 835 aa  200  9e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  28.2 
 
 		 871 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2414  hypothetical protein  26.14 
 
 		 832 aa  198  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459172  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1029  hypothetical protein  28.87 
 
 		 869 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5607  hypothetical protein  28.78 
 
 		 871 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  25.66 
 
 		 827 aa  194  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1668  hypothetical protein  28 
 
 		 871 aa  194  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2280  hypothetical protein  28 
 
 		 871 aa  194  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  28.88 
 
 		 826 aa  193  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  26.21 
 
 		 870 aa  193  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  26.27 
 
 		 838 aa  191  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  28.75 
 
 		 863 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  27.2 
 
 		 838 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  29.02 
 
 		 856 aa  190  7e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0542  protein of unknown function DUF214  26.95 
 
 		 843 aa  190  9e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  28.98 
 
 		 874 aa  187  7e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3446  ABC transporter, permease protein, putative  25.4 
 
 		 828 aa  187  7e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000339618  hitchhiker  0.000208184 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2196  hypothetical protein  27.68 
 
 		 834 aa  183  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  24.84 
 
 		 842 aa  183  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  25.33 
 
 		 804 aa  182  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  26.62 
 
 		 840 aa  181  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2318  hypothetical protein  27.35 
 
 		 871 aa  181  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1251  efflux ABC transporter, permease protein  28.32 
 
 		 883 aa  180  9e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  26.93 
 
 		 831 aa  179  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2785  protein of unknown function DUF214  28.29 
 
 		 857 aa  177  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.482364  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1259  efflux ABC transporter, permease protein  28.43 
 
 		 880 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356208  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  26.52 
 
 		 861 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3255  hypothetical protein  27.8 
 
 		 839 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0335123  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3458  hypothetical protein  28.17 
 
 		 857 aa  175  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.840481  normal  0.470717 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2896  hypothetical protein  24.02 
 
 		 821 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431502 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  27.56 
 
 		 858 aa  174  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1124  hypothetical protein  24.94 
 
 		 809 aa  174  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.101154  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1400  putative permease  28.57 
 
 		 1108 aa  173  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0557  efflux ABC transporter permease  25.55 
 
 		 804 aa  171  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3019  efflux ABC transporter, permease protein  25.16 
 
 		 809 aa  171  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00602267  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1046  hypothetical protein  25.09 
 
 		 828 aa  171  7e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3191  protein of unknown function DUF214  24.46 
 
 		 809 aa  170  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0495543  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0562  efflux ABC transporter permease protein  25.55 
 
 		 804 aa  170  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1273  efflux ABC transporter permease  25.38 
 
 		 809 aa  170  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.924579 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0572  efflux ABC transporter permease  25.43 
 
 		 804 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.868504 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3157  hypothetical protein  25.15 
 
 		 809 aa  170  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.513308  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0287  predicted permease  25.74 
 
 		 815 aa  168  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  26.77 
 
 		 860 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27140  hypothetical protein  27.09 
 
 		 830 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>