202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2091 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  100 
 
 		 843 aa  1642    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  65.8 
 
 		 869 aa  981    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1400  putative permease  55.06 
 
 		 1108 aa  723    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5607  hypothetical protein  55.13 
 
 		 871 aa  774    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  86.37 
 
 		 844 aa  1397    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  54.91 
 
 		 863 aa  764    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1029  hypothetical protein  55.78 
 
 		 869 aa  742    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2015  hypothetical protein  50.18 
 
 		 844 aa  658    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  55.41 
 
 		 871 aa  785    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3255  hypothetical protein  47.78 
 
 		 839 aa  643    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0335123  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0944  hypothetical protein  47.58 
 
 		 853 aa  645    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.69332 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  55.49 
 
 		 860 aa  786    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0898  hypothetical protein  65.95 
 
 		 851 aa  953    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1668  hypothetical protein  55.25 
 
 		 871 aa  770    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2196  hypothetical protein  55.52 
 
 		 834 aa  741    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  86.85 
 
 		 844 aa  1364    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2318  hypothetical protein  54.87 
 
 		 871 aa  739    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2280  hypothetical protein  55.25 
 
 		 871 aa  770    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4056  protein of unknown function DUF214  50.42 
 
 		 838 aa  671    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3824  hypothetical protein  50.3 
 
 		 843 aa  644    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  47.18 
 
 		 858 aa  654    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3458  hypothetical protein  50.54 
 
 		 857 aa  646    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.840481  normal  0.470717 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  50.83 
 
 		 856 aa  640    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1251  efflux ABC transporter, permease protein  54.87 
 
 		 883 aa  725    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1259  efflux ABC transporter, permease protein  55.06 
 
 		 880 aa  725    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356208  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  45.57 
 
 		 832 aa  686    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  55.91 
 
 		 861 aa  793    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  53.76 
 
 		 870 aa  806    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2785  protein of unknown function DUF214  50.54 
 
 		 857 aa  647    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.482364  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  48.81 
 
 		 874 aa  633  1e-180  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  45.79 
 
 		 840 aa  632  1e-180  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0533  hypothetical protein  50.12 
 
 		 840 aa  624  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  43.54 
 
 		 835 aa  615  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  42.87 
 
 		 827 aa  590  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  40.05 
 
 		 829 aa  552  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  39.23 
 
 		 835 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  42.72 
 
 		 831 aa  528  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  40.38 
 
 		 826 aa  520  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  40.12 
 
 		 840 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1093  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  54.95 
 
 		 569 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0774  hypothetical protein  54.95 
 
 		 569 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1399  ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 		 830 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  34.8 
 
 		 838 aa  458  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  34.88 
 
 		 838 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1918  hypothetical protein  36.28 
 
 		 835 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695603  hitchhiker  0.000000000000882803 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2316  hypothetical protein  36.11 
 
 		 832 aa  439  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000697167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3453  hypothetical protein  36.11 
 
 		 832 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000113684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4016  hypothetical protein  35.96 
 
 		 834 aa  432  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401086  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27140  hypothetical protein  36.35 
 
 		 830 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2296  hypothetical protein  36.4 
 
 		 833 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  32.97 
 
 		 840 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1758  hypothetical protein  35.68 
 
 		 835 aa  412  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293557  hitchhiker  0.00000000277599 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23050  hypothetical protein  36.97 
 
 		 833 aa  409  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.636342  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2618  hypothetical protein  37.21 
 
 		 842 aa  406  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.855589  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  29.86 
 
 		 836 aa  401  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  31.12 
 
 		 842 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2209  hypothetical protein  31.74 
 
 		 819 aa  396  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.795386  normal  0.224518 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2560  hypothetical protein  35.06 
 
 		 834 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00315514  hitchhiker  0.00000000000119307 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3446  ABC transporter, permease protein, putative  31.18 
 
 		 828 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000339618  hitchhiker  0.000208184 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0008  protein of unknown function DUF214  37.53 
 
 		 836 aa  382  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  33.93 
 
 		 804 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1046  hypothetical protein  34.16 
 
 		 828 aa  363  5.0000000000000005e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2066  hypothetical protein  36.77 
 
 		 835 aa  363  9e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0616  efflux ABC transporter permease  32.82 
 
 		 804 aa  363  9e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0572  efflux ABC transporter permease  32.7 
 
 		 804 aa  362  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.868504 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0684  hypothetical protein  36.39 
 
 		 829 aa  360  4e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.852275  normal  0.517784 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0555  efflux ABC transporter, permease protein  32.62 
 
 		 804 aa  360  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0557  efflux ABC transporter permease  32.7 
 
 		 804 aa  360  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0545  efflux ABC transporter, permease protein  33.41 
 
 		 804 aa  359  9.999999999999999e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3120  hypothetical protein  33.41 
 
 		 804 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749019 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00447  predicted inner membrane protein  33.41 
 
 		 804 aa  358  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00452  hypothetical protein  33.41 
 
 		 804 aa  358  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3114  protein of unknown function DUF214  33.41 
 
 		 804 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0575  efflux ABC transporter, permease protein  33.41 
 
 		 804 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0649  protein of unknown function DUF214  38.11 
 
 		 838 aa  356  1e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0562  efflux ABC transporter permease protein  32.58 
 
 		 804 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0535  efflux ABC transporter, permease protein  33.29 
 
 		 804 aa  355  1e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0600  efflux ABC transporter, permease protein  33.21 
 
 		 804 aa  355  2e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.77559 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0431  efflux ABC transporter, permease protein  33.37 
 
 		 805 aa  353  5e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1273  efflux ABC transporter permease  33.69 
 
 		 809 aa  353  1e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.924579 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3157  hypothetical protein  33.85 
 
 		 809 aa  350  4e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.513308  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3019  efflux ABC transporter, permease protein  33.85 
 
 		 809 aa  350  4e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00602267  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1124  hypothetical protein  30.72 
 
 		 809 aa  350  8e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.101154  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3191  protein of unknown function DUF214  30.84 
 
 		 809 aa  347  4e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0495543  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04662  oxidoreductase  38.44 
 
 		 824 aa  347  7e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2896  hypothetical protein  30.01 
 
 		 821 aa  342  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431502 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1487  ABC transporter, permease, putative  33 
 
 		 818 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1159  hypothetical protein  33.85 
 
 		 810 aa  335  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184343 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1056  protein of unknown function DUF214  34.18 
 
 		 810 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1539  hypothetical protein  30.88 
 
 		 833 aa  317  5e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274903 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1698  hypothetical protein  28.88 
 
 		 823 aa  316  9e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.405062 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0551  hypothetical protein  29.6 
 
 		 823 aa  316  9.999999999999999e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.454209  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1480  hypothetical protein  30.76 
 
 		 833 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1545  hypothetical protein  30.53 
 
 		 833 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2401  hypothetical protein  31.13 
 
 		 816 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.678425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2707  hypothetical protein  29.5 
 
 		 836 aa  307  6e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3003  protein of unknown function DUF214  33.17 
 
 		 810 aa  303  8.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.558274  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1662  hypothetical protein  30.02 
 
 		 817 aa  301  4e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000552359  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2783  hypothetical protein  29.35 
 
 		 837 aa  299  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.667381  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2926  ABC transporter, permease, putative  30.43 
 
 		 835 aa  298  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>