240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2414 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2414  hypothetical protein  100 
 
 		 832 aa  1628    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459172  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2110  protein of unknown function DUF214  56.45 
 
 		 833 aa  887    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2108  protein of unknown function DUF214  56.42 
 
 		 832 aa  916    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0073  hypothetical protein  28.79 
 
 		 884 aa  338  2.9999999999999997e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2115  ABC efflux transporter, fused inner membrane subunits  28.7 
 
 		 882 aa  308  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.675122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2436  hypothetical protein  28.32 
 
 		 870 aa  303  8.000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  29.81 
 
 		 841 aa  292  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  30.74 
 
 		 844 aa  288  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6498  protein of unknown function DUF214  27.98 
 
 		 835 aa  285  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850994  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  30.38 
 
 		 843 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  29.71 
 
 		 844 aa  274  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1597  protein of unknown function DUF214  25.56 
 
 		 861 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  30 
 
 		 870 aa  261  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3653  hypothetical protein  29.39 
 
 		 847 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  30.3 
 
 		 863 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  29.07 
 
 		 832 aa  253  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2679  putative ABC transporter permease  29.23 
 
 		 842 aa  252  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0339343  normal  0.926867 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  30.56 
 
 		 861 aa  251  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  28.89 
 
 		 829 aa  248  3e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  30.37 
 
 		 871 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  28.33 
 
 		 869 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  30.71 
 
 		 860 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4056  protein of unknown function DUF214  29.28 
 
 		 838 aa  244  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1394  hypothetical protein  27.34 
 
 		 858 aa  243  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.472262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1668  hypothetical protein  30.05 
 
 		 871 aa  239  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2280  hypothetical protein  30.05 
 
 		 871 aa  239  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  29.27 
 
 		 840 aa  238  3e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  30.54 
 
 		 831 aa  238  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0542  protein of unknown function DUF214  29.69 
 
 		 843 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5469  hypothetical protein  26.92 
 
 		 862 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18562  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5607  hypothetical protein  29.2 
 
 		 871 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2785  protein of unknown function DUF214  29.33 
 
 		 857 aa  233  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.482364  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  27.21 
 
 		 858 aa  231  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3458  hypothetical protein  29.2 
 
 		 857 aa  230  9e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.840481  normal  0.470717 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2015  hypothetical protein  28.46 
 
 		 844 aa  228  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  28.22 
 
 		 835 aa  228  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0411  hypothetical protein  26.4 
 
 		 852 aa  228  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.773219  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3957  hypothetical protein  29.09 
 
 		 835 aa  228  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  26.04 
 
 		 835 aa  227  7e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1671  protein of unknown function DUF214  27.3 
 
 		 844 aa  226  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0107522  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3288  hypothetical protein  27.59 
 
 		 835 aa  225  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3603  eflux ABC transporter inner membrane protein  27.74 
 
 		 835 aa  225  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.217562  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1029  hypothetical protein  29.99 
 
 		 869 aa  225  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1399  ABC transporter, permease protein  27.94 
 
 		 830 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  27.53 
 
 		 838 aa  224  6e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0829  hypothetical protein  26.2 
 
 		 871 aa  224  6e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270904  normal  0.305315 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  28.34 
 
 		 864 aa  223  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  27.68 
 
 		 838 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2196  hypothetical protein  29.02 
 
 		 834 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  29.51 
 
 		 856 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0286  hypothetical protein  28.27 
 
 		 860 aa  221  5e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463422  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3824  hypothetical protein  28.59 
 
 		 843 aa  220  7e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2222  protein of unknown function DUF214  26.48 
 
 		 935 aa  219  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1259  efflux ABC transporter, permease protein  29.24 
 
 		 880 aa  219  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356208  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0087  ABC transporter, permease protein  26 
 
 		 849 aa  218  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  24.34 
 
 		 842 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23050  hypothetical protein  29.65 
 
 		 833 aa  218  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.636342  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  27.5 
 
 		 856 aa  218  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2318  hypothetical protein  28.63 
 
 		 871 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1400  putative permease  29.3 
 
 		 1108 aa  217  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0898  hypothetical protein  27.54 
 
 		 851 aa  216  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3352  hypothetical protein  28.42 
 
 		 869 aa  216  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  28.85 
 
 		 840 aa  216  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  28.42 
 
 		 874 aa  216  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1757  hypothetical protein  26.67 
 
 		 851 aa  213  9e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0387  putative ABC transporter, permease protein  26.45 
 
 		 856 aa  212  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1251  efflux ABC transporter, permease protein  30.42 
 
 		 883 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1016  hypothetical protein  26.89 
 
 		 858 aa  211  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331004  normal  0.145704 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  23.75 
 
 		 836 aa  211  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0099  hypothetical protein  25.74 
 
 		 849 aa  211  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  26.7 
 
 		 827 aa  209  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0085  ABC transporter, permease protein  26.08 
 
 		 849 aa  209  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4181  hypothetical protein  25.59 
 
 		 848 aa  209  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.821525  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4016  hypothetical protein  28.15 
 
 		 834 aa  207  6e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401086  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3075  hypothetical protein  25.18 
 
 		 863 aa  206  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  25.6 
 
 		 840 aa  206  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0944  hypothetical protein  26.72 
 
 		 853 aa  202  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.69332 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3733  protein of unknown function DUF214  25.62 
 
 		 847 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4056  protein of unknown function DUF214  25.26 
 
 		 847 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3446  ABC transporter, permease protein, putative  24.36 
 
 		 828 aa  201  7e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000339618  hitchhiker  0.000208184 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2271  hypothetical protein  26.6 
 
 		 842 aa  200  7.999999999999999e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276468  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0414  hypothetical protein  26.42 
 
 		 851 aa  198  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.336355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  28.03 
 
 		 826 aa  197  7e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  26.45 
 
 		 851 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2544  protein of unknown function DUF214  26.03 
 
 		 860 aa  196  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519388  normal  0.0357395 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2269  hypothetical protein  25.79 
 
 		 892 aa  195  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3255  hypothetical protein  24.57 
 
 		 839 aa  192  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0335123  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0550  hypothetical protein  26.28 
 
 		 858 aa  191  5.999999999999999e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0545  efflux ABC transporter, permease protein  25.79 
 
 		 804 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2226  protein of unknown function DUF214  25.44 
 
 		 862 aa  189  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0961704 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3019  efflux ABC transporter, permease protein  25.54 
 
 		 809 aa  187  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00602267  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0124  hypothetical protein  28.09 
 
 		 831 aa  187  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0544905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0698  hypothetical protein  24.97 
 
 		 833 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.996623 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3114  protein of unknown function DUF214  25.66 
 
 		 804 aa  186  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0575  efflux ABC transporter, permease protein  25.66 
 
 		 804 aa  186  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1273  efflux ABC transporter permease  25.54 
 
 		 809 aa  186  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.924579 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3157  hypothetical protein  25.41 
 
 		 809 aa  185  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.513308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27140  hypothetical protein  27.57 
 
 		 830 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0535  efflux ABC transporter, permease protein  25.53 
 
 		 804 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3120  hypothetical protein  25.66 
 
 		 804 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>