207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2271 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3603  eflux ABC transporter inner membrane protein  61.5 
 
 		 835 aa  867    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.217562  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2679  putative ABC transporter permease  62.59 
 
 		 842 aa  935    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0339343  normal  0.926867 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3687  hypothetical protein  58.69 
 
 		 840 aa  818    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2271  hypothetical protein  100 
 
 		 842 aa  1632    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276468  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3288  hypothetical protein  61.5 
 
 		 835 aa  870    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3957  hypothetical protein  61.98 
 
 		 835 aa  868    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1394  hypothetical protein  42.29 
 
 		 858 aa  548  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.472262  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0087  ABC transporter, permease protein  39.42 
 
 		 849 aa  518  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0099  hypothetical protein  39.16 
 
 		 849 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  40.32 
 
 		 856 aa  515  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4056  protein of unknown function DUF214  38.95 
 
 		 847 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4181  hypothetical protein  39.1 
 
 		 848 aa  497  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.821525  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0085  ABC transporter, permease protein  39.42 
 
 		 849 aa  495  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3352  hypothetical protein  39.84 
 
 		 869 aa  492  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3733  protein of unknown function DUF214  39.31 
 
 		 847 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3075  hypothetical protein  39.83 
 
 		 863 aa  488  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0387  putative ABC transporter, permease protein  39.28 
 
 		 856 aa  484  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  38.41 
 
 		 851 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1778  protein of unknown function DUF214  38.6 
 
 		 863 aa  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  37.7 
 
 		 864 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0829  hypothetical protein  37.62 
 
 		 871 aa  464  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270904  normal  0.305315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5469  hypothetical protein  38.56 
 
 		 862 aa  458  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18562  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0286  hypothetical protein  38.2 
 
 		 860 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463422  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1757  hypothetical protein  41.04 
 
 		 851 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0414  hypothetical protein  38.47 
 
 		 851 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.336355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3653  hypothetical protein  42.13 
 
 		 847 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1016  hypothetical protein  39.36 
 
 		 858 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331004  normal  0.145704 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0550  hypothetical protein  38.9 
 
 		 858 aa  451  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1671  protein of unknown function DUF214  36.52 
 
 		 844 aa  432  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0107522  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0124  hypothetical protein  38.1 
 
 		 831 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0544905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2544  protein of unknown function DUF214  37.73 
 
 		 860 aa  403  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519388  normal  0.0357395 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2269  hypothetical protein  37.73 
 
 		 892 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0698  hypothetical protein  36.55 
 
 		 833 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2226  protein of unknown function DUF214  37.44 
 
 		 862 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0961704 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1913  protein of unknown function DUF214  36.93 
 
 		 882 aa  399  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.549699 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2222  protein of unknown function DUF214  32.91 
 
 		 935 aa  393  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0411  hypothetical protein  34.62 
 
 		 852 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.773219  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1276  hypothetical protein  37.17 
 
 		 838 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53995  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1929  protein of unknown function DUF214  35.84 
 
 		 864 aa  350  5e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316143  normal  0.35107 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1150  hypothetical protein  35.23 
 
 		 847 aa  317  7e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2108  protein of unknown function DUF214  26.95 
 
 		 832 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  28.84 
 
 		 829 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2110  protein of unknown function DUF214  26.22 
 
 		 833 aa  232  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  27.46 
 
 		 832 aa  229  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6498  protein of unknown function DUF214  26.84 
 
 		 835 aa  224  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  28.04 
 
 		 835 aa  221  5e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  27.19 
 
 		 841 aa  220  7e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  28.72 
 
 		 835 aa  211  6e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  28.28 
 
 		 844 aa  210  9e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1597  protein of unknown function DUF214  24.12 
 
 		 861 aa  207  5e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  25.09 
 
 		 842 aa  206  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1124  hypothetical protein  27.54 
 
 		 809 aa  205  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.101154  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2414  hypothetical protein  27.59 
 
 		 832 aa  204  6e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459172  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3191  protein of unknown function DUF214  27.11 
 
 		 809 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0495543  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3157  hypothetical protein  24.91 
 
 		 809 aa  189  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.513308  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1273  efflux ABC transporter permease  25.15 
 
 		 809 aa  189  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.924579 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  27.79 
 
 		 844 aa  188  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3019  efflux ABC transporter, permease protein  25.15 
 
 		 809 aa  187  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00602267  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2896  hypothetical protein  25.54 
 
 		 821 aa  187  6e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431502 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  27.08 
 
 		 870 aa  187  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  25.82 
 
 		 840 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  27.91 
 
 		 840 aa  185  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1539  hypothetical protein  26.47 
 
 		 833 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274903 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4056  protein of unknown function DUF214  27.68 
 
 		 838 aa  184  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  27.81 
 
 		 831 aa  183  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0572  efflux ABC transporter permease  26.41 
 
 		 804 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.868504 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1698  hypothetical protein  26.52 
 
 		 823 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.405062 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  27.95 
 
 		 827 aa  181  7e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  28.78 
 
 		 874 aa  181  7e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1480  hypothetical protein  26.24 
 
 		 833 aa  180  9e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  27.17 
 
 		 858 aa  180  9e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0555  efflux ABC transporter, permease protein  26.27 
 
 		 804 aa  180  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0562  efflux ABC transporter permease protein  26.27 
 
 		 804 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1545  hypothetical protein  26.24 
 
 		 833 aa  179  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0557  efflux ABC transporter permease  26.27 
 
 		 804 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  26.27 
 
 		 804 aa  179  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  28.16 
 
 		 843 aa  178  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2366  hypothetical protein  27.76 
 
 		 827 aa  178  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.197088  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  29.82 
 
 		 860 aa  178  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  23.23 
 
 		 836 aa  177  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  27.39 
 
 		 838 aa  177  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0616  efflux ABC transporter permease  25.98 
 
 		 804 aa  177  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  28.1 
 
 		 826 aa  177  6e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2015  hypothetical protein  27.18 
 
 		 844 aa  177  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  26.95 
 
 		 838 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0287  predicted permease  23.68 
 
 		 815 aa  174  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1399  ABC transporter, permease protein  26 
 
 		 830 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  29.82 
 
 		 861 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0535  efflux ABC transporter, permease protein  25.99 
 
 		 804 aa  174  9e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3114  protein of unknown function DUF214  25.99 
 
 		 804 aa  173  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0542  protein of unknown function DUF214  28.86 
 
 		 843 aa  173  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0575  efflux ABC transporter, permease protein  25.87 
 
 		 804 aa  171  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  30.56 
 
 		 863 aa  171  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1046  hypothetical protein  26.47 
 
 		 828 aa  170  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2785  protein of unknown function DUF214  26.01 
 
 		 857 aa  169  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.482364  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27140  hypothetical protein  28.22 
 
 		 830 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1056  protein of unknown function DUF214  27.65 
 
 		 810 aa  169  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  28.42 
 
 		 856 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0600  efflux ABC transporter, permease protein  25.37 
 
 		 804 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.77559 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00447  predicted inner membrane protein  25.87 
 
 		 804 aa  167  9e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>