207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1778 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2269  hypothetical protein  69.99 
 
 		 892 aa  1004    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_004310  BR0087  ABC transporter, permease protein  52.01 
 
 		 849 aa  786    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0414  hypothetical protein  58.01 
 
 		 851 aa  853    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.336355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1778  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 863 aa  1646    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2226  protein of unknown function DUF214  70.6 
 
 		 862 aa  1003    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0961704 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0286  hypothetical protein  56.53 
 
 		 860 aa  816    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463422  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  56.92 
 
 		 851 aa  879    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4181  hypothetical protein  51.78 
 
 		 848 aa  754    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.821525  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  55.58 
 
 		 864 aa  831    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1913  protein of unknown function DUF214  55.16 
 
 		 882 aa  721    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.549699 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0550  hypothetical protein  56.87 
 
 		 858 aa  835    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2544  protein of unknown function DUF214  70.34 
 
 		 860 aa  1016    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519388  normal  0.0357395 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3352  hypothetical protein  52.04 
 
 		 869 aa  734    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0829  hypothetical protein  55.03 
 
 		 871 aa  796    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270904  normal  0.305315 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  55.01 
 
 		 856 aa  862    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1757  hypothetical protein  54.08 
 
 		 851 aa  739    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4056  protein of unknown function DUF214  53.36 
 
 		 847 aa  779    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5469  hypothetical protein  88.53 
 
 		 862 aa  1393    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18562  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3733  protein of unknown function DUF214  53.01 
 
 		 847 aa  761    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1016  hypothetical protein  70.29 
 
 		 858 aa  1071    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331004  normal  0.145704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0387  putative ABC transporter, permease protein  53.44 
 
 		 856 aa  807    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0085  ABC transporter, permease protein  51.89 
 
 		 849 aa  753    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3075  hypothetical protein  52 
 
 		 863 aa  718    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0099  hypothetical protein  51.89 
 
 		 849 aa  783    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1394  hypothetical protein  50.29 
 
 		 858 aa  720    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.472262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1671  protein of unknown function DUF214  39.29 
 
 		 844 aa  522  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0107522  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3653  hypothetical protein  44.58 
 
 		 847 aa  515  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2679  putative ABC transporter permease  39.95 
 
 		 842 aa  486  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0339343  normal  0.926867 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0698  hypothetical protein  41.12 
 
 		 833 aa  480  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0124  hypothetical protein  41.79 
 
 		 831 aa  479  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0544905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2271  hypothetical protein  38.6 
 
 		 842 aa  463  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276468  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3603  eflux ABC transporter inner membrane protein  41.39 
 
 		 835 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.217562  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3288  hypothetical protein  40.8 
 
 		 835 aa  459  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2222  protein of unknown function DUF214  35.26 
 
 		 935 aa  452  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3957  hypothetical protein  40.4 
 
 		 835 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0411  hypothetical protein  36.84 
 
 		 852 aa  439  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.773219  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3687  hypothetical protein  39.15 
 
 		 840 aa  414  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1150  hypothetical protein  37.51 
 
 		 847 aa  400  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1276  hypothetical protein  38.95 
 
 		 838 aa  396  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53995  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1929  protein of unknown function DUF214  36.62 
 
 		 864 aa  346  1e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316143  normal  0.35107 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6498  protein of unknown function DUF214  27.05 
 
 		 835 aa  255  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  28.44 
 
 		 835 aa  255  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1597  protein of unknown function DUF214  25.68 
 
 		 861 aa  254  6e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2108  protein of unknown function DUF214  26.03 
 
 		 832 aa  251  5e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  28.62 
 
 		 841 aa  248  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2110  protein of unknown function DUF214  26.61 
 
 		 833 aa  231  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  31.03 
 
 		 840 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  27.92 
 
 		 829 aa  221  3.9999999999999997e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  28.39 
 
 		 835 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  28.13 
 
 		 838 aa  211  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  28.77 
 
 		 838 aa  211  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2414  hypothetical protein  26.39 
 
 		 832 aa  208  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459172  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0542  protein of unknown function DUF214  29.31 
 
 		 843 aa  206  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4016  hypothetical protein  29.23 
 
 		 834 aa  204  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401086  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  26.96 
 
 		 827 aa  204  7e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3453  hypothetical protein  27.98 
 
 		 832 aa  204  9e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000113684 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2316  hypothetical protein  27.95 
 
 		 832 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000697167 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  28.26 
 
 		 844 aa  203  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1399  ABC transporter, permease protein  26.83 
 
 		 830 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  29.68 
 
 		 840 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  25.81 
 
 		 832 aa  201  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  28.87 
 
 		 843 aa  201  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27140  hypothetical protein  30.14 
 
 		 830 aa  200  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1046  hypothetical protein  27.27 
 
 		 828 aa  199  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1918  hypothetical protein  27.75 
 
 		 835 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695603  hitchhiker  0.000000000000882803 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  28.36 
 
 		 844 aa  196  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  29.47 
 
 		 826 aa  192  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  26.72 
 
 		 860 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2785  protein of unknown function DUF214  28.72 
 
 		 857 aa  190  8e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.482364  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  25 
 
 		 842 aa  189  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05800  hypothetical protein  25.48 
 
 		 818 aa  189  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  24.55 
 
 		 836 aa  188  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3824  hypothetical protein  29.36 
 
 		 843 aa  189  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  26.86 
 
 		 861 aa  189  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000166  predicted ABC-type transport system permease component  24.91 
 
 		 818 aa  187  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3458  hypothetical protein  28.47 
 
 		 857 aa  187  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.840481  normal  0.470717 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  26.43 
 
 		 870 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  27.26 
 
 		 804 aa  186  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  28.96 
 
 		 871 aa  185  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0722  hypothetical protein  25.77 
 
 		 815 aa  184  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000480127  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3255  hypothetical protein  26.81 
 
 		 839 aa  182  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0335123  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2196  hypothetical protein  28.75 
 
 		 834 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5607  hypothetical protein  29.04 
 
 		 871 aa  180  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2318  hypothetical protein  28.77 
 
 		 871 aa  180  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1668  hypothetical protein  28.73 
 
 		 871 aa  180  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2280  hypothetical protein  28.73 
 
 		 871 aa  180  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2115  ABC efflux transporter, fused inner membrane subunits  23.77 
 
 		 882 aa  179  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.675122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1029  hypothetical protein  28.66 
 
 		 869 aa  178  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3446  ABC transporter, permease protein, putative  24.94 
 
 		 828 aa  177  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000339618  hitchhiker  0.000208184 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2436  hypothetical protein  23.9 
 
 		 870 aa  178  5e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  28.57 
 
 		 831 aa  177  7e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  26.93 
 
 		 858 aa  177  8e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  29.52 
 
 		 856 aa  177  8e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0600  efflux ABC transporter, permease protein  27.61 
 
 		 804 aa  175  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.77559 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  26.7 
 
 		 869 aa  175  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0545  efflux ABC transporter, permease protein  27.71 
 
 		 804 aa  175  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0287  predicted permease  24.87 
 
 		 815 aa  174  6.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2015  hypothetical protein  29.82 
 
 		 844 aa  173  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0616  efflux ABC transporter permease  27.95 
 
 		 804 aa  173  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  28.46 
 
 		 863 aa  172  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>