187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5607 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  55.13 
 
 
843 aa  825    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  92.24 
 
 
863 aa  1363    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  54.24 
 
 
869 aa  783    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1400  putative permease  78.57 
 
 
1108 aa  1140    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5607  hypothetical protein  100 
 
 
871 aa  1696    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616708  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1029  hypothetical protein  79.23 
 
 
869 aa  1154    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  73.46 
 
 
860 aa  1117    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  73.67 
 
 
861 aa  1115    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0898  hypothetical protein  54.35 
 
 
851 aa  758    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  69.79 
 
 
870 aa  1099    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1668  hypothetical protein  95.75 
 
 
871 aa  1467    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2196  hypothetical protein  93.17 
 
 
834 aa  1324    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2318  hypothetical protein  92.05 
 
 
871 aa  1360    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2280  hypothetical protein  95.75 
 
 
871 aa  1467    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1093  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  80.9 
 
 
569 aa  761    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0774  hypothetical protein  80.9 
 
 
569 aa  761    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  96.21 
 
 
871 aa  1492    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1251  efflux ABC transporter, permease protein  78.53 
 
 
883 aa  1139    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1259  efflux ABC transporter, permease protein  78.57 
 
 
880 aa  1139    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356208  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  54.95 
 
 
844 aa  823    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  55.3 
 
 
844 aa  813    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  43.93 
 
 
835 aa  632  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4056  protein of unknown function DUF214  47.57 
 
 
838 aa  625  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0944  hypothetical protein  46.55 
 
 
853 aa  623  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.69332 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  46.3 
 
 
858 aa  621  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  45.22 
 
 
827 aa  618  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2015  hypothetical protein  46.73 
 
 
844 aa  613  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  48.17 
 
 
856 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  42.14 
 
 
832 aa  613  9.999999999999999e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3824  hypothetical protein  47.42 
 
 
843 aa  609  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936763  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  45.87 
 
 
840 aa  612  1e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3255  hypothetical protein  46.6 
 
 
839 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0335123  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2785  protein of unknown function DUF214  46 
 
 
857 aa  592  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.482364  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3458  hypothetical protein  46.49 
 
 
857 aa  589  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.840481  normal  0.470717 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  46.8 
 
 
874 aa  582  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0533  hypothetical protein  47.1 
 
 
840 aa  575  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  39.67 
 
 
829 aa  548  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  40.7 
 
 
835 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  40.26 
 
 
840 aa  504  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  40.98 
 
 
831 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  39.52 
 
 
826 aa  493  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  36.72 
 
 
838 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  36.58 
 
 
838 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1918  hypothetical protein  37.22 
 
 
835 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695603  hitchhiker  0.000000000000882803 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1399  ABC transporter, permease protein  35.12 
 
 
830 aa  436  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4016  hypothetical protein  36.93 
 
 
834 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401086  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2316  hypothetical protein  37.05 
 
 
832 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000697167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3453  hypothetical protein  36.74 
 
 
832 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000113684 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2618  hypothetical protein  38.74 
 
 
842 aa  419  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.855589  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27140  hypothetical protein  36.98 
 
 
830 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0008  protein of unknown function DUF214  39.32 
 
 
836 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2560  hypothetical protein  38.43 
 
 
834 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00315514  hitchhiker  0.00000000000119307 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  31.29 
 
 
840 aa  401  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23050  hypothetical protein  36.54 
 
 
833 aa  401  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.636342  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2296  hypothetical protein  36.76 
 
 
833 aa  399  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1758  hypothetical protein  36.55 
 
 
835 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293557  hitchhiker  0.00000000277599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3446  ABC transporter, permease protein, putative  33.06 
 
 
828 aa  395  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000339618  hitchhiker  0.000208184 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  29.41 
 
 
836 aa  389  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  30.79 
 
 
842 aa  386  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2209  hypothetical protein  31.47 
 
 
819 aa  385  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.795386  normal  0.224518 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0684  hypothetical protein  35.99 
 
 
829 aa  382  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.852275  normal  0.517784 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1046  hypothetical protein  33.71 
 
 
828 aa  362  2e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0649  protein of unknown function DUF214  38 
 
 
838 aa  355  2e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2066  hypothetical protein  36.23 
 
 
835 aa  341  2.9999999999999998e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2896  hypothetical protein  29.93 
 
 
821 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000431502 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0551  hypothetical protein  29.65 
 
 
823 aa  338  3.9999999999999995e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.454209  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  31.92 
 
 
804 aa  334  5e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1124  hypothetical protein  30.94 
 
 
809 aa  330  9e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.101154  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1092  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  74.38 
 
 
287 aa  327  5e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0775  putative permease  74.38 
 
 
287 aa  327  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.254557  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3019  efflux ABC transporter, permease protein  32.52 
 
 
809 aa  327  7e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00602267  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3157  hypothetical protein  32.52 
 
 
809 aa  325  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.513308  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1273  efflux ABC transporter permease  32.16 
 
 
809 aa  325  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.924579 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0545  efflux ABC transporter, permease protein  31.27 
 
 
804 aa  323  9.000000000000001e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3191  protein of unknown function DUF214  30.34 
 
 
809 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0495543  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1698  hypothetical protein  29.47 
 
 
823 aa  322  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.405062 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04662  oxidoreductase  36.19 
 
 
824 aa  321  3.9999999999999996e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3114  protein of unknown function DUF214  31.15 
 
 
804 aa  321  5e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0575  efflux ABC transporter, permease protein  31.15 
 
 
804 aa  321  5e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3120  hypothetical protein  31.15 
 
 
804 aa  320  6e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000749019 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00447  predicted inner membrane protein  31.15 
 
 
804 aa  320  7e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0616  efflux ABC transporter permease  32.25 
 
 
804 aa  320  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0555  efflux ABC transporter, permease protein  32.25 
 
 
804 aa  320  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00452  hypothetical protein  31.15 
 
 
804 aa  320  7e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0600  efflux ABC transporter, permease protein  31.03 
 
 
804 aa  319  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.77559 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0535  efflux ABC transporter, permease protein  31.03 
 
 
804 aa  318  3e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0557  efflux ABC transporter permease  32.25 
 
 
804 aa  318  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0562  efflux ABC transporter permease protein  32.25 
 
 
804 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336553  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0431  efflux ABC transporter, permease protein  31.05 
 
 
805 aa  317  6e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0572  efflux ABC transporter permease  32.12 
 
 
804 aa  315  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.868504 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1056  protein of unknown function DUF214  32.53 
 
 
810 aa  308  4.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1487  ABC transporter, permease, putative  30.68 
 
 
818 aa  307  7e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1159  hypothetical protein  31.17 
 
 
810 aa  301  5e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184343 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0287  predicted permease  28.54 
 
 
815 aa  298  3e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3003  protein of unknown function DUF214  32.01 
 
 
810 aa  296  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.558274  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2566  hypothetical protein  29.83 
 
 
827 aa  294  5e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1545  hypothetical protein  29.8 
 
 
833 aa  293  7e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2783  hypothetical protein  29.14 
 
 
837 aa  293  9e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.667381  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1662  hypothetical protein  29.35 
 
 
817 aa  293  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000552359  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2707  hypothetical protein  29.06 
 
 
836 aa  292  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>